【技术实现步骤摘要】
一种用于肺腺癌检测的甲基化分子标志物、试剂盒及应用
[0001]本专利技术属于生物医药
,更具体地,涉及一种用于肺腺癌检测的甲基化分子标志物
、
试剂盒及应用
。
技术介绍
[0002]非小细胞型肺癌包括鳞状细胞癌
(
鳞癌
)、
腺癌
、
大细胞癌
。
其中肺腺癌占肺癌总数的
40
%~
50
%,为最常见的肺癌类型
。
肺腺癌的发病率和死亡率呈逐年上升趋势,且5年生存率很低
。
其主要原因是早期肺腺癌缺少典型的临床症状,当患者在被确诊时都处于中晚期,或已经出现转移,因此肺腺癌早筛早诊是减少死亡及改善预后的关键因素
。
目前肺癌诊断常用的方法有影像学检查
、
痰脱落细胞学和支气管镜检,这些方法容易造成漏诊和误诊,且仪器设备昂贵
。
[0003]DNA
甲基化对于癌基因和抑癌基因的转录
、
表达有着深远影响,异常的
DNA
甲基化导致癌基因和抑癌基因功能紊乱,且其通常发生在癌症的早期;另外,癌变的细胞由于其细胞间黏附分子的表达降低,往往更易脱落或转移,且发生癌变的细胞可通过凋亡
、
坏死或主动分泌的方式将基因组
DNA
以片段化的方式释放到体液中,可通过检测体液样本中循环的肿瘤
DNA
的甲基化水平来诊断肺腺癌
。 />因此,探索能够用于肺腺癌早期诊断的甲基化分子标志物具有重要意义
。
技术实现思路
[0004]针对现有技术的缺陷,本专利技术的目的在于提供一种用于肺腺癌检测的甲基化分子标志物
、
试剂盒及应用,以改善现有技术对肺腺癌的检测准确度低
、
缺少对不同病理分期的肺腺癌均具有优异检测效果的甲基化分子标志物等的技术问题
。
[0005]为实现上述目的,本专利技术提供了一种用于肺腺癌检测的甲基化分子标志物,以
GRCh38.p14
为参考基因组,所述甲基化分子标志物选自
Chr1:63319871
‑
63320048
负链的全长区域或部分区域,和
/
或,
Chr2:468298
‑
468435
正链的全长区域或部分区域
。
[0006]本专利技术还提供了一种用于肺腺癌检测的试剂盒,其包括用于检测权利要求1所述的甲基化分子标志物的甲基化水平的引物对,和
/
或检测探针
。
[0007]优选地,所述引物对包括用于检测
Chr1:63319871
‑
63320048
负链和
/
或
Chr2:468298
‑
468435
正链的甲基化水平的甲基化引物对
。
[0008]优选地,所述甲基化引物对包括用于检测
Chr1:63319871
‑
63320048
负链的甲基化水平的第一甲基化引物对,和
/
或,用于检测
Chr2:468298
‑
468435
正链的甲基化水平的第二甲基化引物对
。
[0009]进一步优选地,所述第一甲基化引物对的核苷酸序列如
SEQ ID NO.7
~8所示,所述第二甲基化引物对的核苷酸序列如
SEQ ID NO.11
~
12
所示
。
[0010]优选地,所述引物对还包括用于检测
Chr1:63319871
‑
63320048
负链和
/
或
Chr2:468298
‑
468435
正链的甲基化水平的非甲基化引物对
。
[0011]进一步优选地,所述引物对包括如下组合中的至少一组:
[0012]SEQ ID NO.7
~8所示的第一甲基化引物对和
SEQ ID NO.9
~
10
所示的第一非甲基化引物对;
[0013]SEQ ID NO.11
~
12
所示的第二甲基化引物对和
SEQ ID NO.13
~
14
所示的第二非甲基化引物对
。
[0014]优选地,所述试剂盒包括用于检测
Chr1:63319871
‑
63320048
负链的甲基化水平的第一甲基化引物对和第一检测探针,和
/
或,用于检测
Chr2:468298
‑
468435
正链的甲基化水平的第二甲基化引物对和第二检测探针
。
[0015]进一步优选地,所述试剂盒包括如下组合中的至少一组:
[0016]SEQ ID NO.7
~8所示的第一甲基化引物对和
SEQ ID NO.18
所示的第一检测探针;
[0017]SEQ ID NO.11
~
12
所示的第二甲基化引物对和
SEQ ID NO.19
所示的第二检测探针
。
[0018]优选地,所述试剂盒还包括内参基因的检测引物对及检测探针
、DNA
提取试剂
、DNA
纯化试剂
、
甲基化转化试剂
、
扩增试剂
、
阳性对照品和阴性对照品中的一种或多种
。
[0019]优选地,所述检测探针和所述内参基因的检测探针的5’
端包含有荧光报告基团,3’
端包含有荧光淬灭基团
。
[0020]本专利技术还提供了所述甲基化分子标志物或所述试剂盒在制备肺腺癌检测产品中的应用
。
[0021]优选地,所述肺腺癌包括Ⅰ期肺腺癌
、Ⅱ期肺腺癌
、Ⅲ期肺腺癌和Ⅳ期肺腺癌中的至少一种
。
[0022]优选地,所述肺腺癌检测产品包括试剂盒
、
芯片和测序文库中的一种或多种
。
[0023]总体而言,通过本专利技术所构思的以上技术方案与现有技术相比,具有以下有益效果:
[0024]本专利技术提供的一种用于肺腺癌检测的甲基化分子标志物
、
试剂盒,通过检测样本中目标区域
(Chr1:63319871
‑
63320048
负链和
/
或
Chr2:468298
‑
468435
正链
)
的甲基化水平能够对肺腺癌进行检测,提供了能够用于肺腺癌本文档来自技高网...
【技术保护点】
【技术特征摘要】
1.
一种用于肺腺癌检测的甲基化分子标志物,其特征在于,以
GRCh38.p14
为参考基因组,所述甲基化分子标志物选自
Chr1:63319871
‑
63320048
负链的全长区域或部分区域,和
/
或,
Chr2:468298
‑
468435
正链的全长区域或部分区域
。2.
一种用于肺腺癌检测的试剂盒,其特征在于,其包括用于检测权利要求1所述的甲基化分子标志物的甲基化水平的引物对,和
/
或检测探针
。3.
根据权利要求2所述的试剂盒,其特征在于,所述引物对包括用于检测
Chr1:63319871
‑
63320048
负链和
/
或
Chr2:468298
‑
468435
正链的甲基化水平的甲基化引物对
。4.
根据权利要求3所述的试剂盒,其特征在于,所述甲基化引物对包括用于检测
Chr1:63319871
‑
63320048
负链的甲基化水平的第一甲基化引物对,和
/
或,用于检测
Chr2:468298
‑
468435
正链的甲基化水平的第二甲基化引物对;所述第一甲基化引物对的核苷酸序列如
SEQ ID NO.7
~8所示,所述第二甲基化引物对的核苷酸序列如
SEQ ID NO.11
~
12
所示
。5.
根据权利要求3所述的试剂盒,其特征在于,所述引物对还包括用于检测
Chr1:63319871
‑
63320048
负链和
/
或
Chr2:468298
‑
468435
正链的甲基化水平的非甲基化引物对;所述引物对包括如下组合中的至少一组:
SEQ ID NO.7
~8所示的第一甲基化引物对和
【专利技术属性】
技术研发人员:李书杨,万慧,阮彦添,梁嘉琳,袁雨文,王青,
申请(专利权)人:武汉艾米森生命科技有限公司,
类型:发明
国别省市:
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