用于靶向富集病原的探针组制造技术

本发明专利技术提供了用于靶向富集病原的探针组

【技术实现步骤摘要】
用于靶向富集病原的探针组、方法以及试剂盒


[0001]本专利技术属于分子生物学和医学领域，特别是涉及一种
NGS
靶向捕获法检测临床常见病原菌的试剂盒及方法
。

技术介绍

[0002]感染性疾病的病原体种类繁多，临床表现复杂，快速
、
全面
、
准确地鉴别病原体，可以为疾病的诊断
、
治疗及流行病调查提供有效的依据
。
[0003]传统的病原菌分离培养及表型鉴定方法检测周期耗时长，且操作繁琐
、
敏感性低
、
特异性差
。
研究表明，约
70%
的感染患者因传统检测方法无法确定病原体，未能得到及时有效的治疗，预后较差
。
而分子诊断技术可有效弥补传统方法的不足，对指导临床预防
、
诊断
、
治疗及疗效评价起到重要作用
。
[0004]核酸检测技术已成病原体检测的主流发展趋势，摆脱了传统方法对于病原体分离培养的依赖，显著提高了病原检测的敏感性，缩短检测时间
。
基于多重
PCR
技术开展的多重病原体检测体系在疑似病毒感染患者的病原体筛查和确认中具有较高的临床价值
。
此外，
PCR
技术在检测病原菌耐药也发挥了重要作用
。
由于
PCR
技术的敏感度高，极微量的靶基因污染也会造成结果判断失误，所以假阳性问题较为突出
。
宏基因组二代测序技术（
mNGS
）通过对临床样本中微生物核酸的测序分析，无偏倚地检测多种病原微生物，逐渐应用于临床感染性疾病病原诊断，在鉴定疑难
、
罕见感染病原及非典型病原体等常规检测技术鉴定难度大的病原体具有重要的临床价值
。
而宏基因组测序技术面临缺乏标准流程
、
报告解读
、
价格昂贵等问题
。
[0005]病原靶向测序（
tNGS
）通过超多重
PCR
扩增与高通量测序两种技术结合，能够对待测样本中的几十种至几百种已知病原微生物及其毒力和
/
或耐药基因进行检测
。
与
mNGS
相比，
tNGS
具有病原谱范围明确，其灵敏度与病原载量相关，不受人源含量影响，对数据量要求不高，成本较低，故在临床检验受到越倒越多的关注
。

技术实现思路

[0006]本专利技术的目的是提供一种临床常见病原菌检测的捕获探针
、
试剂盒及方法
。
通过针对临床常见的
26
种病原菌基因组序列设计特异性的捕获探针，用于临床标本中
26
种病原菌检测，该方法具有特异性强，灵敏度高，成本低等优点
。
[0007]本专利技术首先提供了一种靶向探针捕获法检测
26
种病原菌的探针组，能够与常见病原菌的遗传物质特异性结合，包括有用于扩增如下病原菌的探针：产单核细胞李斯特菌，探针数
20
条，核苷酸序列如
SEQ ID NO. 1
‑
20
；
EB
病毒，探针数
11
条，核苷酸序列如
SEQ ID NO. 21
‑
31
；水痘带状疱疹病毒，探针数
10
条，核苷酸序列如
SEQ ID NO. 32
‑
41
；人巨细胞病毒，探针数
12
条，核苷酸序列如
SEQ ID NO. 42
‑
53
；脑膜炎奈瑟菌，探针数
19
条，核苷酸序列如
SEQ ID NO. 54
‑
72
；
肺炎克雷伯菌，探针数
23
条，核苷酸序列如
SEQ ID NO. 73
‑
95
；流感嗜血杆菌，探针数
19
条，核苷酸序列如
SEQ ID NO. 96
‑
114
；金黄色葡萄球菌，探针数
20
条，核苷酸序列如
SEQ ID NO. 115
‑
134
；无乳链球菌，探针数
19
条，核苷酸序列如
SEQ ID NO. 135
‑
153
；肺炎链球菌，探针数
19
条，核苷酸序列如
SEQ ID NO. 154
‑
172
；屎肠球菌，探针数
20
条，核苷酸序列如
SEQ ID NO. 173
‑
192
；结核分枝杆菌复合群，探针数
22
条，核苷酸序列如
SEQ ID NO. 193
‑
214
；铜绿假单胞菌，探针数
24
条，核苷酸序列如
SEQ ID NO. 215
‑
238
；鲍曼不动杆菌，探针数
22
条，核苷酸序列如
SEQ ID NO. 239
‑
260
；大肠埃希菌，探针数
18
条，核苷酸序列如
SEQ ID NO. 261
‑
278
；粪肠球菌，探针数
21
条，核苷酸序列如
SEQ ID NO. 279
‑
299
；黄曲霉，探针数
32
条，核苷酸序列如
SEQ ID NO. 300
‑
331
；新型隐球菌，探针数
28
条，核苷酸序列如
SEQ ID NO. 332
‑
359
；白色念珠菌，探针数
27
条，核苷酸序列如
SEQ ID NO. 360
‑
386
；近平滑念珠菌，探针数
27
条，核苷酸序列如
SEQ ID NO. 387
‑
413
；格特隐球菌，探针数
28
条，核苷酸序列如
SEQ ID NO. 414
‑
441
；烟曲霉，探针数
33
条，核苷酸序列如
SEQ ID NO. 442
‑
474
；人类疱疹病毒1，探针数
11
条，核苷酸序列如
SEQ ID NO. 475
‑
485
；人类疱疹病毒2，探针数
11
条，核苷酸序列如
SEQ ID NO.本文档来自技高网...

【技术保护点】

【技术特征摘要】
1.
一种靶向探针捕获法检测
26
种病原菌的探针组，其特征在于，包括有用于扩增如下病原菌的探针：产单核细胞李斯特菌，探针数
20
条，核苷酸序列如
SEQ ID NO. 1
‑
20
所示；
EB
病毒，探针数
11
条，核苷酸序列如
SEQ ID NO. 21
‑
31
所示；水痘带状疱疹病毒，探针数
10
条，核苷酸序列如
SEQ ID NO. 32
‑
41
所示；人巨细胞病毒，探针数
12
条，核苷酸序列如
SEQ ID NO. 42
‑
53
所示；脑膜炎奈瑟菌，探针数
19
条，核苷酸序列如
SEQ ID NO. 54
‑
72
所示；肺炎克雷伯菌，探针数
23
条，核苷酸序列如
SEQ ID NO. 73
‑
95
所示；流感嗜血杆菌，探针数
19
条，核苷酸序列如
SEQ ID NO. 96
‑
114
所示；金黄色葡萄球菌，探针数
20
条，核苷酸序列如
SEQ ID NO. 115
‑
134
所示；无乳链球菌，探针数
19
条，核苷酸序列如
SEQ ID NO. 135
‑
153
所示；肺炎链球菌，探针数
19
条，核苷酸序列如
SEQ ID NO. 154
‑
172
所示；屎肠球菌，探针数
20
条，核苷酸序列如
SEQ ID NO. 173
‑
192
所示；结核分枝杆菌复合群，探针数
22
条，核苷酸序列如
SEQ ID NO. 193
‑
214
所示；铜绿假单胞菌，探针数
24
条，核苷酸序列如
SEQ ID NO. 215
‑
238
所示；鲍曼不动杆菌，探针数
22
条，核苷酸序列如
SEQ ID NO. 239
‑
260
所示；大肠埃希菌，探针数
18
条，核苷酸序列如
SEQ ID NO. 261
‑
278
所示；粪肠球菌，探针数
21
条，核苷酸序列如
SEQ ID NO. 279
‑
299
所示；黄曲霉，探针数
32
条，核苷酸序列如
SEQ ID NO. 300
‑
331
所示；新型隐球菌，探针数
28
条，核苷酸序列如
SEQ ID NO. 332
‑
359
所示；白色念珠菌，探针数
27
条，核苷酸序列如
SEQ ID NO. 360
‑
386
所示；近平滑念珠菌，探针数
27
条，核苷酸序列如
SEQ ID NO. 387
‑
413
所示；格特隐球菌，探针数
28
条，核苷酸序列如

【专利技术属性】
技术研发人员：邵阳，刘佳，赵忞超，那成龙，刘思思，崔月利，蒋文，吴卫卫，朱淼，郑丹，
申请(专利权)人：迪飞医学科技南京有限公司，
类型：发明
国别省市：