用于结肠细胞增殖性病症的早期检测的标志物制造技术

本文公开的系统

【技术实现步骤摘要】
【国外来华专利技术】用于结肠细胞增殖性病症的早期检测的标志物
[0001]相关申请的交叉引用
[0002]本申请要求
2020
年
12
月
21
日提交的美国临时专利申请号
63/128,545
的权益，其通过引用以其整体并入本文
。


[0003]本公开涉及用于包括晚期腺瘤和结直肠癌在内的结肠细胞增殖性病症的早期鉴定的生物标志物和方法
。

技术介绍

[0004]结直肠癌
(CRC)
是西方世界中癌症相关死亡的主要原因
。
虽然
CRC
是表征最好的实体瘤之一，但是由于诊断较晚，
CRC
仍然是发达国家的主要死亡原因之一
。
除其他原因外，患者的晚期诊断是由于诊断测试如结肠镜检查进行得太晚
。
由于
CRC
导致的死亡可以通过有效的早期筛查来预防
。

技术实现思路

[0005]本公开提供了涉及与
CRC/>检测和疾病进展相本文档来自技高网...

【技术保护点】

【技术特征摘要】
【国外来华专利技术】1.
一种结肠细胞增殖性病症所特有的预先确定的蛋白质小组，所述预先确定的蛋白质小组包括选自以下的至少6种蛋白质：
EGF、FGF
‑
2、FLT3L、Fractalkine、IL
‑
1a、IL
‑
2、IL
‑
6、IL
‑
8、GROa、MIP
‑
3a、
补体成分
C2、
补体成分
C9、D
因子
、I
因子
、MBL、MMP
‑
2、GDF
‑
15、
骨粘连蛋白
、
骨膜素
、ANGPTL4、FGF
‑
21、FGF
‑
23、HGF、
血管生成素
‑
2、BMP
‑
9、IL
‑
1RII(IL1R2)、HGFR、IL
‑
6ra、OPN、
生腱蛋白
‑
C(TNC)、
血小板反应蛋白
‑
2(THBS2)、uPAR、CD44、
激肽释放酶
‑
6、
间皮素
、EpCAM、Apo A1、AGP、A2MB、
胎球蛋白
A、HP、L
‑
选择蛋白
、
补体成分
C1q、
补体成分
C3、
补体成分
C3b、B
因子
、H
因子
、
备解素
、AGRP、MMP
‑
12、CYFRA21
‑
1、HE4、
总
PSA、MIF、AFP、CA125(MUC
‑
16)、CA19
‑
9、CA15
‑
3(MUC
‑
1)
和
CEA。2.
如权利要求1所述的小组，其中所述小组包括
FLT3L、CEACAM5、IL
‑
6RA
或其组合
。3.
如权利要求1所述的小组，其中所述小组包括
FLT3L、CEACAM5、IL
‑
6RA、IL
‑
8、IL
‑
1RT2、TNC
或其组合
。4.
如权利要求1所述的小组，其中所述小组包括
FLT3L、CEACAM5、IL
‑
6RA、IL
‑
8、IL
‑
1RT2、TNC、MUC
‑
16、EGF
或其组合
。5.
如权利要求1所述的小组，其中所述小组被配置为区分健康对象
、
患有良性结肠息肉的对象
、
患有晚期腺瘤的对象或患有结直肠癌的对象
。6.
如权利要求1所述的小组，其中所述小组被配置为指示晚期腺瘤，并且包括：
1)FLT3L、CEACAM5
和
IL
‑
6RA
；
2)FLT3L、CEACAM5、IL
‑
6RA、CEA、IL
‑
8、AGP、IL
‑
1RT2、TNC
和
GDF
‑
15
；或者
3)FLT3L、CEACAM5、IL
‑
6RA、CEA、IL
‑
8、AGP、IL
‑
1RT2、TNC、GDF
‑
15、AGRP、
触珠蛋白
、ANGPTL4、FGF
‑
23、
补体成分
C2、ORM2、FGF
‑
23、MUC
‑
16、EGF
和
p00738。7.
如权利要求1所述的小组，其中所述小组被配置为指示结直肠癌，并且包括：
FLT3L、CEACAM5
和
IL
‑
6RA
；
2)
选自以下的蛋白质：
FLT3L、CEACAM5、IL
‑
6RA、IL
‑
8、IL
‑
1RT2
和
TNC
；或者
3)FLT3L、CEACAM5、IL
‑
6RA、ORM、IL
‑
8、AGP、IL
‑
1RT2、TNC、GDF
‑
15、AGRP、
触珠蛋白
、ANGPTL4、FGF
‑
23、
补体成分
C2、ORM2、FGF
‑
23、MUC
‑
16
和
EGF。8.
如权利要求1所述的小组，其中所述结肠细胞增殖性病症选自：腺瘤
(
腺瘤性息肉
)、
息肉病
、
林奇综合征
、
无蒂锯齿状腺瘤
(SSA)、
晚期腺瘤
、
结直肠发育不良
、
结直肠腺瘤
、
结直肠癌
、
结肠癌
、
直肠癌
、
结直肠上皮癌
、
结直肠腺癌
、
类癌瘤
、
胃肠道类癌瘤
、
胃肠道间质瘤
(GIST)、
淋巴瘤和肉瘤
。9.
一种被配置为区分健康对象群体与患有结肠细胞增殖性病症的对象的分类器，所述分类器包括：测量值集，所述测量值集代表来自所述结肠细胞增殖性病症所特有的预先确定的蛋白质小组的蛋白质，其中所述测量值集从来自健康对象的样品和患有结肠细胞增殖性病症的对象的样品的蛋白质表达数据获得，其中所述测量值用于生成与所述蛋白质表达数据的特性相对应的特征集，其中使用机器学习或统计模型对所述特征集进行计算机处理，并且其中所述机器学习或统计模型提供特征向量，所述特征向量可用作能够区分健康对象群体与患有所述结肠细胞增殖性病症的对象的分类器
。10.
如权利要求9所述的分类器，其中所述预先确定的蛋白质小组包括选自以下的至少6种蛋白质：
EGF、FGF
‑
2、FLT3L、Fractalkine、IL
‑
1a、IL
‑
2、IL
‑
6、IL
‑
8、GROa、MIP
‑
3a、
补体成
分
C2、
补体成分
C9、D
因子
、I
因子
、MBL、MMP
‑
2、GDF
‑
15、
骨粘连蛋白
、
骨膜素
、ANGPTL4、FGF
‑
21、FGF
‑
23、HGF、
血管生成素
‑
2、BMP
‑
9、IL
‑
1RII、HGFR、IL
‑
6ra、OPN、
生腱蛋白
‑
C、
血小板反应蛋白
‑
2、uPAR、CD44、
激肽释放酶
‑
6、
间皮素
、EpCAM、Apo A1、AGP、A2MB、
胎球蛋白
A、HP、L
‑
选择蛋白
、
补体成分
C1q、
补体成分
C3、
补体成分
C3b、B
因子
、H
因子
、
备解素
、AGRP、MMP
‑
12、CYFRA21
‑
1、HE4、
总
PSA、MIF、AFP、CA125、CA19
‑
9、CA15
‑
3(MUC
‑
1)
和
CEA。11.
如权利要求9所述的分类器，其中所述小组包括
FLT3L、CEACAM5、IL
‑
6RA
或其组合
。12.
如权利要求9所述的分类器，其中所述小组包括
FLT3L、CEACAM5、IL
‑
6RA、IL
‑
8、IL
‑
1RT2、TNC
或其组合
。13.
如权利要求9所述的分类器，其中所述小组包括
FLT3L、CEACAM5、IL
‑
6RA、ORM、IL
‑
8、AGP、IL
‑
1RT2、TNC、MUC
‑
16、EGF
或其组合
。14.
如权利要求9所述的分类器，其中所述分类器被配置为区分健康对象
、
患有良性结肠息肉的对象
、
患有晚期腺瘤的对象或患有结直肠癌的对象
。15.
如权利要求9所述的分类器，其中所述小组被配置为指示晚期腺瘤，并且包括：
FLT3L、CEACAM5
和
IL
‑
6RA
；
2)FLT3L、CEACAM5、IL
‑
6RA、CEA、IL
‑
8、AGP、IL
‑
1RT2、TNC
和
GDF
‑
15
；或者
3)FLT3L、CEACAM5、IL
‑
6RA、CEA、IL
‑
8、AGP、IL
‑
1RT2、TNC、GDF
‑
15、AGRP、
触珠蛋白
、ANGPTL4、FGF
‑
23、
补体成分
C2、ORM2、FGF
‑
23、MUC
‑
16、EGF
和
p00738。16.
如权利要求9所述的分类器，其中所述小组被配置为指示结直肠癌，并且包括：
1)FLT3L、CEACAM5
和
IL
‑
6RA
；
2)FLT3L、CEACAM5、IL
‑
6RA、IL
‑
8、IL
‑
1RT2
和
TNC
；或者
3)FLT3L、CEACAM5、IL
‑
6RA、ORM、IL
‑
8、AGP、IL
‑
1RT2、TNC、GDF
‑
15、AGRP、
触珠蛋白
、ANGPTL4、FGF
‑
23、
补体成分
C2、ORM2、FGF
‑
23、MUC
‑
16
和
EGF。17.
如权利要求9所述的分类器，其中所述结肠细胞增殖性病症选自：腺瘤
(
腺瘤性息肉
)、
息肉病
、
林奇综合征
、
无蒂锯齿状腺瘤
(SSA)、
晚期腺瘤
、
结直肠发育不良
、
结直肠腺瘤
、
结直肠癌
、
结肠癌
、
直肠癌
、
结直肠上皮癌
、
结直肠腺癌
、
类癌瘤
、
胃肠道类癌瘤
、
胃肠道间质瘤
(GIST)、
淋巴瘤和肉瘤
。18.
一种用于检测结肠细胞增殖性病症的包括机器学习模型分类器的系统，其包括：包括分类器的计算机可读介质，所述分类器可操作以基于预先确定的蛋白质小组来将对象分类；以及一个或多个处理器，用于执行存储在所述计算机可读介质上的指令
。19.
如权利要求
18
所述的系统，其包括被加载到计算机系统的存储器中的如权利要求9所述的分类器，其中所述机器学习模型使用从训练生物样品获得的训练数据来训练，其中所述训练生物样品的第一子集被鉴定为对应于患有结肠细胞增殖性病症的对象，并且其中所述训练生物样品的第二子集被鉴定为对应于未患有结肠细胞增殖性病症的对象
。20.
如权利要求
18
...

【专利技术属性】
技术研发人员：海利，
申请(专利权)人：福瑞诺姆控股公司，
类型：发明
国别省市：