用于结肠细胞增殖性病症的早期检测的标志物制造技术

本文公开的系统、介质、组合物、方法和试剂盒涉及用于包括结直肠癌的结肠细胞增殖性病症的早期检测的蛋白质生物标志物小组。用于本文所描述的蛋白质小组的生物样品中蛋白质的存在和水平可以用于分类器生成，并且用作可用于对群体中的对象进行分类以检测结肠细胞增殖性病症的机器学习模型中的输入。

【技术实现步骤摘要】
【国外来华专利技术】

本公开涉及用于包括晚期腺瘤和结直肠癌的结肠细胞增殖性病症的早期鉴定的生物标志物和方法。

技术介绍

1、结直肠癌(crc)是西方世界中癌症相关死亡的主要原因。虽然crc是表征最好的实体瘤之一，但是由于诊断较晚，crc仍然是发达国家的主要死亡原因之一。除其他原因外，患者的晚期诊断是由于诊断测试如结肠镜检查进行得太晚。由于crc导致的死亡可以通过有效的早期筛查预防。

技术实现思路

1、本公开提供了涉及与crc检测和疾病进展相关联的生物样品的蛋白质谱分析的方法和系统。本文所描述的研究能够确定crc的特定蛋白质特征的存在，表明结肠细胞增殖性病症的特定生物标志物的存在，具有检测结肠细胞增殖性病症、对患者群体进行分层以及使用来自患有结肠细胞增殖性病症的对象的血浆进行群体分类的潜力，具有高特异性和高敏感性。

2、在一方面，本公开提供了一种结肠细胞增殖性病症所特有的预先确定的蛋白质小组，该小组包括选自以下的至少4种蛋白质：abeta38、abeta40、abeta42、abeta 42.2、afp、afp-l3、a本文档来自技高网...

【技术保护点】

1.一种结肠细胞增殖性病症所特有的预先确定的蛋白质小组，所述小组包括选自以下的至少4种蛋白质：Abeta38、Abeta40、Abeta42、Abeta42.2、AFP、AFP-L3、Ang-2、anti-p53、CA125、CA15-3、CA19-9、CA72-4、CA242、CA50、降钙素、CEA、CXCL13、CYFRA 21-1、DKK-3、ESM-1、铁蛋白、FGF23、游离PSA、胃泌素-17、GDF-15、HE4、hGH、IGF-1、IGFBP-3、IGFBP-7、IL-22、IL-8、IL-6、HS IL-6、MMP-3、NSE、OPN、胃蛋白酶原1、胃蛋白酶原2、PI...

【技术特征摘要】
【国外来华专利技术】

1.一种结肠细胞增殖性病症所特有的预先确定的蛋白质小组，所述小组包括选自以下的至少4种蛋白质：abeta38、abeta40、abeta42、abeta42.2、afp、afp-l3、ang-2、anti-p53、ca125、ca15-3、ca19-9、ca72-4、ca242、ca50、降钙素、cea、cxcl13、cyfra 21-1、dkk-3、esm-1、铁蛋白、fgf23、游离psa、胃泌素-17、gdf-15、he4、hgh、igf-1、igfbp-3、igfbp-7、il-22、il-8、il-6、hs il-6、mmp-3、nse、opn、胃蛋白酶原1、胃蛋白酶原2、pivka、bnp、probnp、nt-probnp、总nt-probnp、progrp、prl、psa、s100、scc、sflt-1、shbg、shla-g、sicam-1、strem-1、tk1、tsh、vegf-a和ykl40。

2.如权利要求1所述的小组，其中所述小组包括选自以下的至少5种、至少6种、至少7种、至少8种、至少9种或至少10种蛋白质：abeta38、abeta40、abeta42、abeta42.2、afp、afp-l3、ang-2、anti-p53、ca125、ca15-3、ca19-9、ca72-4、ca242、ca50、降钙素、cea、cxcl13、cyfra 21-1、dkk-3、esm-1、铁蛋白、fgf23、游离psa、胃泌素-17、gdf-15、he4、hgh、igf-1、igfbp-3、igfbp-7、il-22、il-8、il-6、hs il-6、mmp-3、nse、opn、胃蛋白酶原1、胃蛋白酶原2、pivka、bnp、probnp、nt-probnp、总nt-probnp、progrp、prl、psa、s100、scc、sflt-1、shbg、shla-g、sicam-1、strem-1、tk1、tsh、vegf-a和ykl40。

3.如权利要求1所述的小组，其中所述小组包括cxcl13、cyfra 21-1、fgf23、gdf-15、he4、il-8或其组合。

4.如权利要求1所述的小组，其中所述小组包括abeta38、abeta40、abeta42、abeta42.2、ang-2、ca125、降钙素、cxcl13、cyfra 21-1、fgf23、gdf-15、he4、hgh、igfbp-7、il-8、il-6、hs il-6、mmp-3、opn、bnp、probnp、ntprobnp、总ntprobnp、sicam-1、strem-1、tsh、vegf-a、ykl40或其组合。

5.如权利要求1所述的小组，其中所述小组包括ang-2、ca125、降钙素、cxcl13、cyfra21-1、fgf23、gdf-15、he4、hgh、igfbp-7、il-8、il-6、hs il-6、mmp-3、opn、bnp、probnp、nt-probnp、总nt-probnp、sicam-1、strem-1、tsh、vegf-a、ykl40或其组合。

6.如权利要求1所述的小组，其中所述小组被配置为区分健康对象、患有良性结肠息肉的对象、患有晚期腺瘤的对象或患有结直肠癌的对象。

7.如权利要求1所述的小组，其中所述小组被配置为指示晚期腺瘤，并且包括选自以下的至少4种蛋白质：abeta38、abeta40、abeta42、abeta 42.2、afp、afp-l3、ang-2、anti-p53、ca125、ca15-3、ca19-9、ca72-4、ca242、ca50、降钙素、cea、cxcl13、cyfra 21-1、dkk-3、esm-1、铁蛋白、fgf23、游离psa、胃泌素-17、gdf-15、he4、hgh、igf-1、igfbp-3、igfbp-7、il-22、il-8、il-6、hs il-6、mmp-3、nse、opn、胃蛋白酶原1、胃蛋白酶原2、pivka、bnp、probnp、nt-probnp、总nt-probnp、progrp、prl、psa、s100、scc、sflt-1、shbg、shla-g、sicam-1、strem-1、tk1、tsh、vegf-a和ykl40。

8.如权利要求1所述的小组，其中所述小组被配置为指示晚期腺瘤，并且包括选自以下的至少5种、至少6种、至少7种、至少8种、至少9种或至少10种蛋白质：abeta38、abeta40、abeta42、abeta42.2、afp、afp-l3、ang-2、anti-p53、ca125、ca15-3、ca19-9、ca72-4、ca242、ca50、降钙素、cea、cxcl13、cyfra 21-1、dkk-3、esm-1、铁蛋白、fgf23、游离psa、胃泌素-17、gdf-15、he4、hgh、igf-1、igfbp-3、igfbp-7、il-22、il-8、il-6、hs il-6、mmp-3、nse、opn、胃蛋白酶原1、胃蛋白酶原2、pivka、bnp、probnp、nt-probnp、总nt-probnp、progrp、prl、psa、s100、scc、sflt-1、shbg、shla-g、sicam-1、strem-1、tk1、tsh、vegf-a和ykl40。

9.如权利要求1所述的小组，其中所述小组被配置为指示结直肠癌，并且包括选自以下的至少4种蛋白质：abeta38、abeta40、abeta42、abeta 42.2、afp、afp-l3、ang-2、anti-p53、ca125、ca15-3、ca19-9、ca72-4、ca242、ca50、降钙素、cea、cxcl13、cyfra 21-1、dkk-3、esm-1、铁蛋白、fgf23、游离psa、胃泌素-17、gdf-15、he4、hgh、igf-1、igfbp-3、igfbp-7、il-22、il-8、il-6、hs il-6、mmp-3、nse、opn、胃蛋白酶原1、胃蛋白酶原2、pivka、bnp、probnp、nt-probnp、总nt-probnp、progrp、prl、psa、s100、scc、sflt-1、shbg、shla-g、sicam-1、strem-1、tk1、tsh、vegf-a和ykl40。

10.如权利要求1所述的小组，其中所述小组被配置为指示结直肠癌，并且包括选自以下的至少5种、至少6种、至少7种、至少8种、至少9种或至少10种蛋白质：abeta38、abeta40、abeta42、abeta42.2、afp、afp-l3、ang-2、anti-p53、ca125、ca15-3、ca19-9、ca72-4、ca242、ca50、降钙素、cea、cxcl13、cyfra 21-1、dkk-3、esm-1、铁蛋白、fgf23、游离psa、胃泌素-17、gdf-15、he4、hgh、igf-1、igfbp-3、igfbp-7、il-22、il-8、il-6、hs il-6、mmp-3、nse、opn、胃蛋白酶原1、胃蛋白酶原2、pivka、bnp、probnp、nt-probnp、总nt-probnp、progrp、prl、psa、s100、scc、sflt-1、shbg、shla-g、sicam-1、strem-1、tk1、tsh、vegf-a和ykl40。

11.如权利要求1所述的小组，其中所述结肠细胞增殖性病症选自：腺瘤(腺瘤性息肉)、息肉病、林奇综合征、无蒂锯齿状腺瘤(ssa)、晚期腺瘤、结直肠发育不良、结直肠腺瘤、结直肠癌、结肠癌、直肠癌、结直肠上皮癌、结直肠腺癌、类癌瘤、胃肠道类癌瘤、胃肠道间质瘤(gist)、淋巴瘤和肉瘤。

12.一种被配置为区分健康对象群体与患有结肠细胞增殖性病症的对象的分类器，所述分类器包括：

13.如权利要求12所述的分类器，其中所述预先确定的蛋白质小组包括选自以下的至少4种蛋白质：abeta38、abeta40、abeta42、abeta 42.2、afp、afp-l3、ang-2、anti-p53、ca125、ca15-3、ca19-9、ca72-4、ca242、ca50、降钙素、cea、cxcl13、cyfra 21-1、dkk-3、esm-1、铁蛋白、fgf23、游离psa、胃泌素-17、gdf-15、he4、hgh、igf-1、igfbp-3、igfbp-7、il-22、il-8、il-6、hs il-6、mmp-3、nse、opn、胃蛋白酶原1、胃蛋白酶原2、pivka、bnp、probnp、nt-probnp、总nt-probnp、progrp、prl、psa、s100、scc、sflt-1、shbg、shla-g、sicam-1、strem-1、tk1、tsh、vegf-a和ykl40。

14.如权利要求12所述的分类器，其中所述预先确定的蛋白质小组包括选自以下的至少5种、至少6种、至少7种、至少8种、至少9种或至少10种蛋白质：abeta38、abeta40、abeta42、abeta 42.2、afp、afp-l3、ang-2、anti-p53、ca125、ca15-3、ca19-9、ca72-4、ca242、ca50、降钙素、cea、cxcl13、cyfra 21-1、dkk-3、esm-1、铁蛋白、fgf23、游离psa、胃泌素-17、gdf-15、he4、hgh、igf-1、igfbp-3、igfbp-7、il-22、il-8、il-6、hs il-6、mmp-3、nse、opn、胃蛋白酶原1、胃蛋白酶原2、pivka、bnp、probnp、nt-probnp、总nt-probnp、progrp、prl、psa、s100、scc、sflt-1、shbg、shla-g、sicam-1、strem-1、tk1、tsh、vegf-a和ykl40。

15.如权利要求12所述的分类器，其中所述小组包括cxcl13、cyfra 21-1、fgf23、gdf-15、he4、il-8或其组合。

16.如权利要求12所述的分类器，其中所述小组包括abeta38、abeta40、abeta42、abeta42.2、ang-2、ca125、降钙素、cxcl13、cyfra 21-1、fgf23、gdf-15、he4、hgh、igfbp-7、il-8、il-6、hs il-6、mmp-3、opn、bnp、probnp、nt-probnp、总nt-probnp、sicam-1、strem-1、tsh、vegf-a、ykl40或其组合。

17.如权利要求12所述的分类器，其中所述小组包括ang-2、ca125、降钙素、cxcl13、cyfra 21-1、fgf23、gdf-15、he4、hgh、igfbp-7、il-8、il-6、hs il-6、mmp-3、opn、bnp、probnp、nt-probnp、总nt-probnp、sicam-1、strem-1、tsh、vegf-a、ykl40或其组合。

18.如权利要求12所述的分类器，其中所述分类器被配置为区分健康对象、患有良性结肠息肉的对象、患有晚期腺瘤的对象或患有结直肠癌的对象。

19.如权利要求12所述的分类器，其中所述小组被配置为指示晚期腺瘤，并且包括选自以下的至少4种蛋白质：abeta38、abeta40、abeta42、abeta 42.2、afp、afp-l3、ang-2、anti-p53、ca125、ca15-3、ca19-9、ca72-4、ca242、ca50、降钙素、cea、cxcl13、cyfra 21-1、dkk-3、esm-1、铁蛋白、fgf23、游离psa、胃泌素-17、gdf-15、he4、hgh、igf-1、igfbp-3、igfbp-7、il-22、il-8、il-6、hs il-6、mmp-3、nse、opn、胃蛋白酶原1、胃蛋白酶原2、pivka、bnp、probnp、nt-probnp、总nt-probnp、progrp、prl、psa、s100、scc、sflt-1、shbg、shla-g、sicam-1、strem-1、tk1、tsh、vegf-a和ykl40。

20.如权利要求12所述的分类器，其中所述小组被配置为指示晚期腺瘤，并且包括选自以下的至少5种、至少6种、至少7种、至少8种、至少9种或至少10种蛋白质：abeta38、abeta40、abeta42、abeta 42.2、afp、afp-l3、ang-2、anti-p53、ca125、ca15-3、ca19-9、ca72-4、ca242、ca50、降钙素、cea、cxcl13、cyfra 21-1、dkk-3、esm-1、铁蛋白、fgf23、游离psa、胃泌素-17、gdf-15、he4、hgh、igf-1、igfbp-3、igfbp-7、il-22、il-8、il-6、hs il-6、mmp-3、nse、opn、胃蛋白酶原1、胃蛋白酶原2、pivka、bnp、probnp、nt-probnp、总nt-probnp、progrp、prl、psa、s100、scc、sflt-1、shbg、shla-g、sicam-1、strem-1、tk1、tsh、vegf-a和ykl40。

21.如权利要求12所述的分类器，其中所述小组被配置为指示结直肠癌，并且包括选自以下的至少4种蛋白质：abeta38、abeta40、abeta42、abeta 42.2、afp、afp-l3、ang-2、anti-p53、ca125、ca15-3、ca19-9、ca72-4、ca242、ca50、降钙素、cea、cxcl13、cyfra 21-1、dkk-3、esm-1、铁蛋白、fgf23、游离psa、胃泌素-17、gdf-15、he4、hgh、igf-1、igfbp-3、igfbp-7、il-22、il-8、il-6、hs il-6、mmp-3、nse、opn、胃蛋白酶原1、胃蛋白酶原2、pivka、bnp、probnp、nt-probnp、总nt-probnp、progrp、prl、psa、s100、scc、sflt-1、shbg、shla-g、sicam-1、strem-1、tk1、tsh、vegf-a和ykl40。

22.如权利要求12所述的分类器，其中所述小组被配置为指示结直肠癌，并且包括选自以下的至少5种、至少6种、至少7种、至少8种、至少9种或至少10种蛋白质：abeta38、abeta40、abeta42、abeta 42.2、afp、afp-l3、ang-2、anti-p53、ca125、ca15-3、ca19-9、ca72-4、ca242、ca50、降钙素、cea、cxcl13、cyfra 21-1、dkk-3、esm-1、铁蛋白、fgf23、游离psa、胃泌素-17、gdf-15、he4、hgh、igf-1、igfbp-3、igfbp-7、il-22、il-8、il-6、hs il-6、mmp-3、nse、opn、胃蛋白酶原1、胃蛋白酶原2、pivka、bnp、probnp、nt-probnp、总nt-probnp、progrp、prl、psa、s100、scc、sflt-1、shbg、shla-g、sicam-1、strem-1、tk1、tsh、vegf-a和ykl40。

23.如权利要求12所述的分类器，其中所述预先确定的蛋白质小组包括选自以下的至少4种蛋白质：afp、afp-l3、anti-p53、ca125ii、ca15-3、ca72-4、cea、cxcl13、cyfra 21-1、铁蛋白、fgf23、胃泌素-17、gdf-15、hct、hgh、igf-1、il-8、nse、prl2、probnpii、sflt-1和ykl。

24.如权利要求12所述的分类器，其中所述预先确定的蛋白质小组包括选自以下的至少5种、至少6种、至少7种、至少8种、至少9种或至少10种蛋白质：afp、afp-l3、anti-p53、ca125 ii、ca15-3、ca72-4、cea、cxcl13、cyfra 21-1、铁蛋白、fgf23、胃泌素-17、gdf-15、hct、hgh、igf-1、il-8、nse、prl2、probnp ii、sflt-1和ykl。

25.如权利要求12所述的分类器，其中所述预先确定的蛋白质小组包括选自以下的至少4种蛋白质：afp、afp-l3、anti-p53、cea、cxcl13、cyfra 21-1、铁蛋白、fgf23、gdf-15、hgh、igf-1、il-8、nse和sflt-1。

26.如权利要求12所述的分类器，其中所述预先确定的蛋白质小组包括选自以下的至少5种、至少6种、至少7种、至少8种、至少9种或至少10种蛋白质：afp、afp-l3、anti-p53、cea、cxcl13、cyfra 21-1、铁蛋白、fgf23、gdf-15、hgh、igf-1、il-8、nse和sflt-1。

27.如权利要求12所述的分类器，其中所述预先确定的蛋白质小组包括选自以下的至少4种蛋白质：afp、afp-l3、hgh、il8、nse、cea、anti-p53、sflt-1、铁蛋白、cyfra 21-1、ca125、igf-1、cxcl-13和ykl。

28.如权利要求12所述的分类器，其中所述预先确定的蛋白质小组包括选自以下的至少5种、至少6种、至少7种、至少8种、至少9种或至少10种蛋白质：afp、afp-l3、hgh、il8、nse、cea、anti-p53、sflt-1、铁蛋白、cyfra 21-1、ca125、igf-1、cxcl-13和ykl。

29.如权利要求12所述的分类器，其中所述预先确定的蛋白质小组包括选自以下的至少4种蛋白质：ca15-13、ca-19-9、cyfra 21-1、il-6、il-6hs、opn和总psa。

30.如权利要求12所述的分类器，其中所述预先确定的蛋白质小组包括选自以下的至少5种、至少6种或至少7种蛋白质：ca15-13、ca-19-9、cyfra 21-1、il-6、il-6hs、opn和总psa。

31.如权利要求12所述的分类器，其中所述预先确定的蛋白质小组包括选自以下的至少4种蛋白质：afp、afp-l3、ang-2、ca125ii、ca15-3、ca72-4、cea、cxcl13、cyfra 21-1、dkk-3、铁蛋白、fgf23、胃泌素-17、gdf-15、hgh、igf-1、igfbp-3、il-6、il-8、mmp-3、nse、胃蛋白酶原2、prl2、s100、sflt-1、strem-1、总psa、vegf-a和ykl。

32.如权利要求12所述的分类器，其中所述预先确定的蛋白质小组包括选自以下的至少5种、至少6种、至少7种、至少8种、至少9种或至少10种蛋白质：afp、afp-l3、ang-2、ca125ii、ca15-3、ca72-4、cea、cxcl13、cyfra 21-1、dkk-3、铁蛋白、fgf23、胃泌素-17、gdf-15、hgh、igf-1、igfbp-3、il-6、il-8、mmp-3、nse、胃蛋白酶原2、prl2、s100、sflt-1、strem-1、总psa、vegf-a和ykl。

33.如权利要求12所述的分类器，其中所述预先确定的蛋白质小组包括选自以下的至少4种蛋白质：afp、afp-l3、ca125 ii、ca15-3、cea、cxcl13、cyfra 21-1、fgf23、gdf-15、hgh、igf-1、il-8、nse、prl2、sflt-1和ykl。

34.如权利要求12所述的分类器，其中所述预先确定的蛋白质小组包括选自以下的至少5种、至少6种、至少7种、至少8种、至少9种或至少10种蛋白质：afp、afp-l3、ca125 ii、ca15-3、cea、cxcl13、cyfra 21-1、fgf23、gdf-15、hgh、igf-1、il-8、nse、prl2、sflt-1和ykl。

35.如权利要求12所述的分类器，其中所述结肠细胞增殖性病症选自：腺瘤(腺瘤性息肉)、息肉病、林奇综合征、无蒂锯齿状腺瘤(ssa)、晚期腺瘤、结直肠发育不良、结直肠腺瘤、结直肠癌、结肠癌、直肠癌、结直肠上皮癌、结直肠腺癌、类癌瘤、胃肠道类癌瘤、胃肠道间质瘤(gist)、淋巴瘤和肉瘤。

36.一种用于检测结肠细胞增殖性病症的包括机器学习模型分类器的系统，所述系统包括：

37.如权利要求36所述的系统，其包括被加载到计算机系统的存储器中的如权利要求9所述的分类器，其中所述机器学习模型使用从训练生物样品获得的训练数据来训练，其中所述训练生物样品的第一子集被鉴定为对应于患有结肠细胞增殖性病症的对象，并且其中所述训练生物样品的第二子集被鉴定为对应于未患有结肠细胞增殖性病症的对象。

38.如权利要求36所述的系统，其中所述小组包括选自以下的至少4种蛋白质：abeta38、abeta40、abeta42、abeta 42.2、afp、afp-l3、ang-2、anti-p53、ca125、ca15-3、ca19-9、ca72-4、ca242、ca50、降钙素、cea、cxcl13、cyfra 21-1、dkk-3、esm-1、铁蛋白、fgf23、游离psa、胃泌素-17、gdf-15、he4、hgh、igf-1、igfbp-3、igfbp-7、il-22、il-8、il-6、hs il-6、mmp-3、nse、opn、胃蛋白酶原1、胃蛋白酶原2、pivka、bnp、probnp、nt-probnp、总nt-probnp、progrp、prl、psa、s100、scc、sflt-1、shbg、shla-g、sicam-1、strem-1、tk1、tsh、vegf-a和ykl40。

39.如权利要求36所述的系统，其中所述小组包括选自以下的至少5种、至少6种、至少7种、至少8种、至少9种或至少10种蛋白质：abeta38、abeta40、abeta42、abeta 42.2、afp、afp-l3、ang-2、anti-p53、ca125、ca15-3、ca19-9、ca72-4、ca242、ca50、降钙素、cea、cxcl13、cyfra 21-1、dkk-3、esm-1、铁蛋白、fgf23、游离psa、胃泌素-17、gdf-15、he4、hgh、igf-1、igfbp-3、igfbp-7、il-22、il-8、il-6、hs il-6、mmp-3、nse、opn、胃蛋白酶原1、胃蛋白酶原2、pivka、bnp、probnp、nt-probnp、总nt-probnp、progrp、prl、psa、s100、scc、sflt-1、shbg、shla-g、sicam-1、strem-1、tk1、tsh、vegf-a和ykl40。

40.如权利要求36所述的系统，其中所述预先确定的蛋白质小组包括选自以下的至少4种蛋白质：afp、afp-l3、anti-p53、ca125 ii、ca15-3、ca72-4、cea、cxcl13、cyfra 21-1、铁蛋白、fgf23、胃泌素-17、gdf-15、hct、hgh、igf-1、il-8、nse、prl2、probnpii、sflt-1和ykl。

41.如权利要求36所述的系统，其中所述预先确定的蛋白质小组包括选自以下的至少5种、至少6种、至少7种、至少8种、至少9种或至少10种蛋白质：afp、afp-l3、anti-p53、ca125ii、ca15-3、ca72-4、cea、cxcl13、cyfra 21-1、铁蛋白、fgf23、胃泌素-17、gdf-15、hct、hgh、igf-1、il-8、nse、prl2、probnp ii、sflt-1和ykl。

42.如权利要求36所述的系统，其中所述预先确定的蛋白质小组包括选自以下的至少4种蛋白质：afp、afp-l3、anti-p53、cea、cxcl13、cyfra 21-1、铁蛋白、fgf23、gdf-15、hgh、igf-1、il-8、nse和sflt-1。

43.如权利要求36所述的系统，其中所述预先确定的蛋白质小组包括选自以下的至少5种、至少6种、至少7种、至少8种、至少9种或至少10种蛋白质：afp、afp-l3、anti-p53、cea、cxcl13、cyfra 21-1、铁蛋白、fgf23、gdf-15、hgh、igf-1、il-8、nse和sflt-1。

44.如权利要求36所述的系统，其中所述预先确定的蛋白质小组包括选自以下的至少4种蛋白质：afp、afp-l3、hgh、il8、nse、cea、anti-p53、sflt-1、铁蛋白、cyfra 21-1、ca125、igf-1、cxcl-13和ykl。

45.如权利要求36所述的系统，其中所述预先确定的蛋白质小组包括选自以下的至少5种、至少6种、至少7种、至少8种、至少9种或至少10种蛋白质：afp、afp-l3、hgh、il8、nse、cea、anti-p53、sflt-1、铁蛋白、cyfra 21-1、ca125、igf-1、cxcl-13和ykl。

46.如权利要求36所述的系统，其中所述预先确定的蛋白质小组包括选自以下的至少4种蛋白质：ca15-13、ca-19-9、cyfra 21-1、il-6、il-6hs、opn和总psa。

47.如权利要求36所述的系统，其中所述预先确定的蛋白质小组包括选自以下的至少5种、至少6种或至少7种蛋白质：ca15-13、ca-19-9、cyfra 21-1、il-6、il-6hs、opn和总psa。

48.如权利要求36所述的系统，其中所述预先确定的蛋白质小组包括选自以下的至少4种蛋白质：afp、afp-l3、ang-2、ca125 ii、ca15-3、ca72-4、cea、cxcl13、cyfra 21-1、dkk-3、铁蛋白、fgf23、胃泌素-17、gdf-15、hgh、igf-1、igfbp-3、il-6、il-8、mmp-3、nse、胃蛋白酶原2、prl2、s100、sflt-1、strem-1、总psa、vegf-a和ykl。

49.如权利要求36所述的系统，其中所述预先确定的蛋白质小组包括选自以下的至少5种、至少6种、至少7种、至少8种、至少9种或至少10种蛋白质：afp、afp-l3、ang-2、ca125 ii、ca15-3、ca72-4、cea、cxcl13、cyfra 21-1、dkk-3、铁蛋白、fgf23、胃泌素-17、gdf-15、hgh、igf-1、igfbp-3、il-6、il-8、mmp-3、nse、胃蛋白酶原2、prl2、s100、sflt-1、strem-1、总psa、vegf-a和ykl。

50.如权利要求36所述的系统，其中所述预先确定的蛋白质小组包括选自以下的至少4种蛋白质：afp、afp-l3、ca125 ii、ca15-3、cea、cxcl13、cyfra 21-1、fgf23、gdf-15、hgh、igf-1、il-8、nse、prl2、sflt-1和ykl。

51.如权利要求36所述的系统，其中所述预先确定的蛋白质小组包括选自以下的至少5种、至少6种、至少7种、至少8种、至少9种或至少10种蛋白质：afp、afp-l3、ca125 ii、ca15-3、cea、cxcl13、cyfra 21-1、fgf23、gdf-15、hgh、igf-1、il-8、nse、prl2、sflt-1和ykl。

52.如权利要求36所述的系统，其中所述系统包括分类电路，所述分类电路被配置为选自以下的机器学习分类器：深度学习分类器、神经网络分类器、线性判别分析(lda)分类器、二次判别分析(qda)分类器、支持向量机(svm)分类器、随机森林(rf)分类器、k近邻分类器、线性核支持向量机分类器、一阶或二阶多项式核支持向量机分类器、岭回归分类器、弹性网算法分类器、序列最小优化算法分类器、朴素贝叶斯算法分类器和主成分分析分类器。

53.一种用于确定来自对象的生物样品的蛋白质谱的方法，所述方法包括：

54.如权利要求53所述的方法，其中所述预先确定的蛋白质小组包括选自以下的至少5种、至少6种、至少7种、至少8种、至少9种或至少10种蛋白质：abeta38、abeta40、abeta42、abeta 42.2、afp、afp-l3、ang-2、anti-p53、ca125、ca15-3、ca19-9、ca72-4、ca242、ca50、降钙素、cea、cxcl13、cyfra 21-1、dkk-3、esm-1、铁蛋白、fgf23、游离psa、胃泌素-17、gdf-15、he4、hgh、igf-1、igfbp-3、igfbp-7、il-22、il-8、il-6、hs il-6、mmp-3、nse、opn、胃蛋白酶原1、胃蛋白酶原2、pivka、bnp、probnp、nt-probnp、总nt-probnp、progrp、prl、psa、s100、scc、sflt-1、shbg、shla-g、sicam-1、strem-1、tk1、tsh、vegf-a和ykl40。

55.如权利要求53所述的方法，其中所述预先确定的蛋白质小组包括cxcl13、cyfra21-1、fgf23、gdf-15、he4、il-8或其组合。

56.如权利要求53所述的方法，其中所述预先确定的蛋白质小组包括abeta38、abeta40、abeta42、abeta 42.2、ang-2、ca125、降钙素、cxcl13、cyfra 21-1、fgf23、gdf-15、he4、hgh、igfb...

【专利技术属性】
技术研发人员：理查德·布尔贡，许登魁，克里希南·坎纳·帕拉尼亚潘，
申请(专利权)人：福瑞诺姆控股公司，
类型：发明
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