【技术实现步骤摘要】
AAV5扩容衣壳突变体及其扩容检测方法
[0001]本公开涉及生物
,具体涉及AAV5扩容衣壳突变体及一种通过数字PCR检测病毒全长基因表达盒占比的方法。
技术介绍
[0002]腺病毒是最早发现的病毒之一,但在20世纪60年代,电子显微镜下显示腺病毒样品通常含有一种较小的颗粒(25nm左右),1965年被分类为第二种病毒,即腺相关病毒(AAV)。AAV是一种依赖病毒,是腺病毒以及某些疱疹病毒的附属病毒,目前认为AAV是一种非致病病毒。由于其相对简单的基因组和非致病性,AAV作为基因治疗载体已被应用于临床(Ritti
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,Laure,et al.Molecular Therapy 27.10(2019):1706
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1717.)。AAV载体目前主要采用以血清型为主,结合亚型和变种的分类法。简单来说,就是按AAV不同来源和外壳特性选择不同的分类法。天然的AAV采用常规系统分类法(例如:AAV2、AAV5、AAV9);通过杂交包装(cross packaging)产生的非天然AAV则按亚型分类法进行划分(例如:AAV2/8、AAV2/5);对于那些采用其他手段(如外壳核酸序列突变)得到的新型非天然AAV则按变种分类法划分为不同变种或隔离种(例如:AAV2/7m8、AAV PHP.B、AAV DJ)。
[0003]AAV颗粒直径25nm左右,衣壳由60个衣壳蛋白亚单位构成,排列成二十面体结构。二十面体是由20个三角形围成的凸多面体,每5个三角形围出一个五倍顶,通过每一对相对着 ...
【技术保护点】
【技术特征摘要】
1.一种AAV衣壳蛋白突变体,所述AAV衣壳蛋白突变体包含与AAV亲本或野生型衣壳蛋白的氨基酸序列相比,具有在对应于如SEQ ID NO.1所示亲本或野生型AAV衣壳蛋白的氨基酸序列中第219位、第228位、第301位和第679位的一个或多个氨基酸位置处具有氨基酸突变的氨基酸序列,所述AAV衣壳蛋白突变体相比于野生型衣壳蛋白具有更大的包装容量;优选地,所述突变体在第219位具有H219R突变;优选地,所述突变体在第228位具有R228H突变;优选地,所述突变体在第301位具有S301K或S301R突变;优选地,所述突变体在第679位具有N679R突变;优选地,所述突变体在第219位具有H219R突变,在第228位具有R228H突变,在第301位具有S301K或S301R突变、在第679位具有N679R突变。2.根据权利要求1所述的AAV衣壳蛋白突变体,其中所述AAV亲本或野生型衣壳蛋白的氨基酸序列是血清型AAV1、AAV2、AAV3、AAV4、AAV5、AAV6、AAV7、AAV8、AAV9、AAV10、AAV11、AAV12及其任意组合的氨基酸序列,优选地,所述AAV亲本或野生型衣壳蛋白的氨基酸序列是血清型AAV5的氨基酸序列。3.根据权利要求1所述的AAV衣壳蛋白突变体,其中所述AAV亲本或野生型AAV衣壳蛋白具有SEQ ID NO.1所示的氨基酸序列或者与其有至少85%、至少90%、至少91%、至少92%、至少93%、至少94%、至少95%、至少96%、至少97%、至少98%或至少99%序列同一性的氨基酸序列。4.根据权利要求1
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3中任一项所述的AAV衣壳蛋白突变体,其中所述AAV衣壳蛋白突变体的氨基酸序列为与SEQ ID NO.1所示氨基酸序列具有80%或以上同一性的氨基酸序列,优选具有85%、90%、95%、96%、97%、98%、99%以上同一性的氨基酸序列,更优选具有98%或99%以上同一性的氨基酸序列;优选地,所述氨基酸具有SEQ ID NO.3所示氨基酸序列或者具有在SEQ ID NO.3上缺失、添加或取代1、2或3个氨基酸所得到的氨基酸序列;优选地,所述氨基酸具有SEQ ID NO.5所示氨基酸序列或者具有在SEQ ID NO.5上缺失、添加或取代1、2或3个氨基酸所得到的氨基酸序列;优选地,所述氨基酸具有SEQ ID NO.7所示氨基酸序列或者具有在SEQ ID NO.7上缺失、添加或取代1、2或3个氨基酸所得到的氨基酸序列;优选地,所述氨基酸具有SEQ ID NO.9所示氨基酸序列或者具有在SEQ ID NO.9上缺失、添加或取代1、2或3个氨基酸所得到的氨基酸序列;优选地,所述氨基酸具有SEQ ID NO.11所示氨基酸序列或者具有在SEQ ID N...
【专利技术属性】
技术研发人员:张晓亮,田文洪,周庆璋,师晓强,田磊,赵君竺,赵春林,
申请(专利权)人:北京安龙生物医药有限公司,
类型:发明
国别省市:
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