一种利用|制造技术

本发明专利技术涉及基因定位技术领域，尤其是一种利用|

【技术实现步骤摘要】
一种利用|
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(SNP
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index)|进行枸杞果实颜色基因定位方法


[0001]本专利技术涉及基因定位
，尤其涉及一种利用|
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(SNP
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index)|进行枸杞果实颜色基因定位方法。

技术介绍

[0002]基因定位是指基因所属连锁群或染色体以及基因在染色体上的位置的测定。基因定位是遗传学研究中的重要环节，是遗传学研究中的一项基本工作，而|
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(SNP
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index)|作为BSA定位的算法，它的基本原理是，构建子代分离群体，经过挑选极端性状构建混池后对SNP进行检测，对各混池进行等位基因频率分析，并与其中一个亲本进行比较。
[0003]目前，果实颜色基因定位方法有两种，一种是QTL定位法，主要包括：基因组DNA提取、文库构建及测序；测序数据的过滤及比对；SNP标记检测与开发；高密遗传连锁图谱构建；QTL定位，而另外一种BSA定位：其具体主要有以下几个方面：基因组DNA提取、文库构建及测序；与参考基因组比对；SNP、InDe本文档来自技高网...

【技术保护点】

【技术特征摘要】
1.一种利用|
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(SNP
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index)|进行枸杞果实颜色基因定位方法，其特征在于，所述方法包括如下步骤：S1、混池：选择北方枸杞与宁夏黄果为亲本构建遗传群体，构建获得健康生长且结果为F1的单株，再利用色差仪对其亲本及杂交群体进行果实颜色测定；S2、基因组DNA提取与检测：提取亲本及其混池材料的DNA进行检测；S3、F1群体极端植株的筛选：根据目测法和CCI指数最终选取不同颜色的极端果实若干个单株，对这若干个不同颜色的极端果实的果实颜色指数CCI的数值进行分析后，进行BSA测序建库；S4、测序：通过高通量测序对亲本及混池的样品进行分析，通过分析结果表明的数据符合BSA检测和分析标准后用于Illumina测序分析；S5、SNP变异检测分析：对亲本及其混池材料进行SNP变异分析；S6、SNP关联分析：利用绝对值|
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(SNP
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index)|方法关联阈值判定；S7、候选区域筛选：根据|
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(SNP
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index)|的置信区间得到与果实颜色性状相关关联的染色体区域分布后进行基本筛选定位。2.根据权利要求1所述的一种利用|
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(SNP
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index)|进行枸杞果实颜色基因定位方法，其特征在于，所述步骤S1中的F1单株有144株，其中极端黄色果实单株有40株，极端红...

【专利技术属性】
技术研发人员：尹跃，曹有龙，赵建华，安巍，秦小雅，米佳，
申请(专利权)人：宁夏农林科学院枸杞科学研究所，
类型：发明
国别省市：