用于核酸测序的系统和方法技术方案

技术编号:38156924 阅读:22 留言:0更新日期:2023-07-13 09:26
本文提供了用于处理和分析核酸和其他生物分子的系统和方法。该方法可包括在液滴乳液中处理核酸分子。分析核酸分子的方法可包括将核酸偶联至珠子或其他支撑物。该方法可包括使用氧化还原介体分析核酸分子。在一些情况下,核酸分子的分析包括确定核酸分子的核苷酸序列。列。列。

【技术实现步骤摘要】
用于核酸测序的系统和方法
本申请是申请日为2017年07月20日、申请号为201780057996.1、专利技术名称为“用于核酸测序的系统和方法”的中国专利申请(其对应PCT申请的申请日为2017年07月20日、申请号为PCT/US2017/043159)的分案申请。交叉引用
[0001]本申请要求于2016年7月20日提交的美国临时专利申请号62/364,489、于2016年8月15日提交的美国临时专利申请号62/375,197、于2016年11月4日提交的美国临时专利申请号62/418,101以及于2017年1月10日提交的美国临时专利申请号62/444,700的权益,其各自通过引用整体并入本文。

技术介绍

[0002]人类基因组已经引起了对快速核酸分析技术的兴趣,包括适用于小规模和大规模应用的核酸测序。目前可用的核酸测序技术包括荧光核苷酸的检测;聚合酶活性质子副产物的检测;以及(iii)通过纳米孔对电流的检测。在测序的背景下,重要的考虑因素包括准确性、速度、读取长度、成本、仪器大小和复杂性,以及产生测序信息所需的核酸模板的量。遗憾的是,由于现有测序本文档来自技高网...

【技术保护点】

【技术特征摘要】
1.一种用于对核酸模板进行测序的方法,该方法包括:(a)使核酸模板与含有核苷酸群体的感测流体接触,其中所述核酸模板与偶联到珠子的引物杂交,该珠子被定位成接近于传感器阵列中的传感器,其中所述传感器包含至少两个电极,并且其中所述感测流体具有体电导率并且所述珠子的表面具有表面电导率,以提供小于约1的杜坎数;(b)在将所述核苷酸群体的至少一个核苷酸掺入生长的核酸链中时,使用所述传感器检测所述珠子的德拜层内的电导率变化,该生长的核酸链衍生自所述引物且与所述核酸模板互补;(c)洗涤所述传感器阵列,以从所述传感器阵列去除所述核苷酸群体的未掺入核苷酸;以及(d)重复(a)

(c)以获得所述核酸模板的序列信息。2.如权利要求1所述的方法,其中所述至少两个电极的给定电极暴露于所述感测流体。3.如权利要求1所述的方法,其中(b)进一步包括在所述至少一个核苷酸掺入时检测所述珠子的所述德拜层内的阻抗变化。4.如权利要求3所述的方法,其中在稳态下检测所述德拜层内的所述阻抗变化。5.如权利要求1所述的方法,进一步包括在(b)之前:(i)使所述传感器阵列与探测流体接触,其中所述探测流体具有比与所述珠子的所述表面相关的所述电导率大至少约50倍或小至少约50倍的体电导率;以及(ii)使用所述传感器检测指示接近于所述传感器的所述珠子的存在的信号。6.一种用于确定传感器阵列位点处的珠子占据的方法,该方法包括:(a)使传感器阵列与多个珠子接触,其中所述传感器阵列包含多个各自具有至少两个电极的传感器,以在接近于所述多个传感器中的单个传感器的给定位置处提供所述多个珠子中的给定珠子;(b)使所述传感器阵列与探测流体接触,所述探测流体具有比与所述给定珠子的表面相关的电导率大至少约50倍或小至少约50倍的体电导率;(c)使用所述单个传感器检测指示接近于所述传感器的所述给定珠子的存在的信号;以及(d)将所述传感器阵列的所述给定位置鉴定为被所述给定珠子占据。7.一种用于处理核酸样品的方法,该方法包括:(a)提供包含第一组液滴和第二组液滴的混合物,其中所述第一组液滴的第一液滴包含(i)珠子,(ii)重组酶,(iii)聚合酶,和(iv)来自所述核酸样品的核酸分子,并且其中所述第二组液滴的第二液滴包含增加所述重组酶处理所述核酸分子的速率以允许所述引物与所述核酸分子杂交从而在所述聚合酶存在的情况下进行引物延伸反应的活化剂,从而由所述核酸分子生成扩增产...

【专利技术属性】
技术研发人员:H
申请(专利权)人:测序健康公司
类型:发明
国别省市:

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