一种工人噪声易感性听力损伤生物标志物及其应用制造技术

本发明专利技术公开一种工人噪声易感性听力损伤生物标志物及其应用，属于生物技术学领域，本发明专利技术提取出工厂中噪声性听力损伤工人和没有听力损伤的对照组工人的临床信息，并从抽查的噪声暴露工人血细胞中提取RNA，利用LightGBM分类算法分析SIRT1基因以及环境因素在导致噪声性听力损伤中的比重，同时检测了SIRT1基因的7个位点与噪声暴露的相关性，并将SIRT1基因rs12778366、rs7895833单核苷酸多态性位点作为噪声暴露工人岗前筛查的特异性基因标志物，本试剂盒操作简易，筛查灵敏度特异度高，适用于大规模易感人群的岗前入职筛查。于大规模易感人群的岗前入职筛查。于大规模易感人群的岗前入职筛查。

【技术实现步骤摘要】
一种工人噪声易感性听力损伤生物标志物及其应用


[0001]本专利技术属于生物技术学领域，具体涉及一种工人噪声易感性听力损伤生物标志物及其应用。

技术介绍

[0002]噪声性听力损失(Noise
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induced hearing loss，NIHL)是指因长时间接触较强程度的噪声而引起的进行性感音神经性听力损失，其受到噪声强度，频率，暴露时间，暴露方式，遗传基因等因素的影响。随着全球工业化程度增加，NIHL已经成为全球性的公共卫生疾病。据WHO统计，全球有十分之一的人群暴露于噪声条件下的，而在这其中有超半数的人患有NIHL。研究显示，在中国和美国，分别有超过1000万和2200万人左右每天在有害噪声环境下工作。所以，急需寻找到导致NIHL的易感标志物，通过筛查发现噪声暴露高危人群，提升工人的健康水平。之前研究认为，氧化应激被证实是影响NIHL的重要因素，而氧化应激可以通过沉默信息调节因子1(SIRT1)/增殖物激活的受体
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γ共激活因子1α(PGC
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1α)信号通路紧密结合，影响NIHL的发生。
[0003]Sirtuin家族蛋白是一类翻译后在细胞中有重要作用，包括识别DNA、催化并维持蛋白质稳定性、发挥蛋白质之间相互作用的组蛋白去乙酰化酶(Ilistone deacetvlase，HDAC)。它对细胞的调控作用体现在众多的细胞过程中如细胞凋亡和应激反应、脂质代谢与脂肪酸氧化、改善胰岛素的分泌以及减缓衰老进程。SIRT1属于Sirtuin家族蛋白的一员，是一种可以调节氧化应激反应和蛋白毒性应激反应的酶，可以大幅度减少ROS水平和提高细胞存活率(M Bernier,RKPaul et al.2011)。研究显示，暴露于噪声的小鼠SIRT1蛋白的表达和活性均低于对照组，超氧化物歧化酶(SOD)的含量也相对减少，因此认为SIRT1可能通过调节氧化应激参与NIHL的发病机制。
[0004]虽然NIHL的环境致病因素已比较明确，但研究显示在相同环境及相同噪声暴露水平下，个体对于噪声的反应不尽相同，这提示着个体的基因差异可能是对噪声暴露存在着易感性差异的研究重点。个体基因差异中基因型、基因单核苷酸多态性以及其不同等位基因往往影响着个体对毒物的耐受性与。

技术实现思路

[0005]针对现有技术的不足，本专利技术的目的在于提供一种工人噪声易感性听力损伤生物标志物及其应用，通过提取出工厂中噪声听力损伤组工人和听力正常的对照组工人的临床信息，并从抽查的噪声暴露工人血细胞中提取RNA，通过机器学习模型确定SIRT1基因和环境因素在噪声性听力损伤中的比重，确定了SIRT1基因在导致噪声性听力损伤的重要性，同时检测了SIRT1基因的7个位点的基因型，等位基因，基因交互作用并验证了SIRT1基因rs12778366，rs7895833位点与噪声暴露的相关性，本试剂盒操作简易，筛查灵敏度特异度高，适用于大规模易感人群的岗前入职筛查。
[0006]本专利技术的目的可以通过以下技术方案实现：
[0007]一种噪声易感性听力损伤生物标志物，所述生物标志物为SIRT1基因中rs12778366或rs7895833单核苷酸多态性位点，其中rs12778366单核苷酸多态性位点如SEQ ID NO.1所示，rs7895833单核苷酸多态性位点如SEQ ID NO.2所示。
[0008]所述的生物标志物在制备噪声易感性听力损伤检测试剂盒上的应用。
[0009]一种噪声易感性听力损伤检测试剂，所述试剂包括用于检测SIRT1基因rs12778366、rs7895833单核苷酸多态性位点的试剂；
[0010]所述试剂包括SIRT1基因多态性位点的RT引物和SIRT1基因RT引物；
[0011]所述SIRT1基因多态性位点的RT引物包括rs12778366
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F端引物和rs12778366
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R端引物；或rs7895833
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F端引物和rs7895833
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R端引物
[0012]所述SIRT1基因RT引物包括SIRT1
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F端引物和SIRT1
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R端引物；
[0013]其中rs12778366
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F端引物和rs12778366
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R端引物，如SEQ ID NO:3和SEQ ID NO.4所示；
[0014]或rs7895833
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F端引物和rs7895833
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R端引物，如SEQ ID NO.5和SEQ ID NO.6所示；
[0015]SIRT1
‑
F端引物和SIRT1
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R端引物，如如SEQ ID NO.7和SEQ ID NO.8所示。
[0016]一种噪声易感性听力损伤检测试剂盒，所述试剂盒包括上述试剂。
[0017]本专利技术的有益效果：
[0018]本专利技术从抽查工人血细胞中提取RNA，通过机器学习模型确定SIRT1基因和环境因素在噪声性听力损伤中的比重，确定SIRT1基因在导致噪声性听力损伤的重要性，检测了SIRT1基因的7个位点的基因型，效应等位基因，基因交互作用并验证了SIRT1基因rs12778366，rs7895833位点与噪声暴露的相关性，操作简易，筛查灵敏度特异度高，适用于大规模易感人群的岗前入职筛查。
附图说明
[0019]为了更清楚地说明本专利技术实施例或现有技术中的技术方案，下面将对实施例或现有技术描述中所需要使用的附图作简单地介绍，显而易见地，对于本领域普通技术人员来讲，在不付出创造性劳动的前提下，还可以根据这些附图获得其他的附图。
[0020]图1是本专利技术机器学习模型主要变量占比；
[0021]图2是本专利技术NIHL组和对照组中各位点交互作用热图。
具体实施方式
[0022]下面将结合本专利技术实施例中的附图，对本专利技术实施例中的技术方案进行清楚、完整地描述，显然，所描述的实施例仅仅是本专利技术一部分实施例，而不是全部的实施例。基于本专利技术中的实施例，本领域普通技术人员在没有作出创造性劳动前提下所获得的所有其它实施例，都属于本专利技术保护的范围。
[0023]一种工人噪声易感性听力损伤生物标志物及其应用，
[0024]实施例1：
[0025]研究对象的选择
[0026]本研究对象来自于含有噪声暴露工厂的体检工人，共计1251人，其中噪声听力损
伤组工人共576人，对照组工人共675人。本研究通过江苏省疾病预防控制中心伦理委员会的伦理审查，所有研究对象均签署了相关的知情同意书。
[0027]问卷调查和听力测量
[0028]调查内容包括：(1)调查对象知情同意书；(2)一般人口学资料(性别、年龄、文化程度、工种等)；(3)生活方式与行为习惯(吸烟、饮酒)；(4)接噪时间。
[0029]听力测量要求：(1本文档来自技高网...

【技术保护点】

【技术特征摘要】
1.一种噪声易感性听力损伤生物标志物，其特征在于，所述生物标志物为SIRT1基因中rs12778366或rs7895833单核苷酸多态性位点，其中rs12778366单核苷酸多态性位点如SEQ ID NO.1所示，rs7895833单核苷酸多态性位点如SEQ ID NO.2所示。2.权利要求1所述的生物标志物在制备噪声易感性听力损伤检测试剂上的应用。3.一种噪声易感性听力损伤检测试剂，其特征在于，所述试剂包括用于检测SIRT1基因rs12778366、rs7895833单核苷酸多态性位点；所述试剂包括SIRT1基因多态性位点的RT引物和SIRT1基因RT引物；所述SIRT1基因多态性位点的RT引物包括rs12778366
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F端引物和rs12778366
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R端引物；或rs7895833
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F端引物和rs7895833
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【专利技术属性】
技术研发人员：王博深，朱宝立，李飞，韩磊，张恒东，李昊，高玥，
申请(专利权)人：江苏省疾病预防控制中心江苏省公共卫生研究院，
类型：发明
国别省市：