一种编码DELLA6蛋白的基因及其在判断芒果矮化品种中的应用制造技术

本发明专利技术属于基因工程技术领域，具体涉及一种编码DELLA6蛋白的基因及其在判断芒果矮化品种中的应用。一种编码DELLA6蛋白的基因，所述基因的核苷酸序列如SEQ ID No.1所示。本发明专利技术编码DELLA6蛋白的基因可以为早期预判供试材料是否具有矮化特性提供支持。材料是否具有矮化特性提供支持。

【技术实现步骤摘要】
一种编码DELLA6蛋白的基因及其在判断芒果矮化品种中的应用


[0001]本专利技术属于基因工程
，具体涉及一种编码DELLA6蛋白的基因及其在判断芒果矮化品种中的应用。

技术介绍

[0002]矮化栽培是多年生木本果树集约化生产不变的发展趋势。植物矮化主要分为遗传性矮化和生理性矮化。单一基因突变属于遗传性矮化，其矮化机理多为基因合成蛋白，蛋白影响激素，激素影响表型；受环境因素影响，导致植株表型发生变化，属于生理性矮化，其矮化作用机理多为环境变化影响植物激素分泌，最终导致变化。但不论哪种矮化模式，都要通过激素来影响表型，植株生长过程中的激素多与赤霉素(gibberellins，GAs)有关。
[0003]GAs是植物生长过程中的中央调节器，通过降解DELLA蛋白来实现其功能。当GAs缺失时，DELLA蛋白可与调控植物生长发育的相关转录因子结合，抑制下游基因表达，进而抑制植物生长；当GAs存在时，DELLA蛋白被降解，其抑制作用被解除，促进下游基因表达，植物正常生长。DELLA蛋白在GAs信号转导途径中具有承上启下的重要作用。上世纪50年代，在小麦中利用DELLA蛋白的有益突变，实现了半矮化育种，提高了粮食产量，解决了温饱问题。现在，在多种农作物及经济作物中已经可以通过转基因技术调控DELLA蛋白的表达水平，使植株矮化，降低了管理成本。
[0004]通过对比具有乔化特性和矮化特性植物材料DELLA6基因的表达量，可以预判植物其是否具有矮化特性，既省时又省力。目前还未见利用DELLA6基因预判芒果品种是否具有矮化特性的相关报道。

技术实现思路

[0005]本专利技术提供了一种编码DELLA6蛋白的基因及其在判断芒果矮化品种中的应用，其可以预判芒果品种是否具有矮化特性，既省时又省力。
[0006]为实现上述目的，本专利技术提供了如下技术方案：
[0007]本专利技术的第一个目的在于提供一种编码DELLA6蛋白的基因，所述基因的核苷酸序列如SEQ ID No.1所示。
[0008]更为具体的，所述基因的开放阅读框为1671bp。
[0009]本专利技术的第二个目的在于提供所述的编码DELLA6蛋白的基因的应用，所述编码DELLA6蛋白的基因用于预判芒果品种是否具有矮化特性。
[0010]本专利技术的第三个目的在于提供一种DELLA6蛋白，所述DELLA6蛋白是由所述的基因编码。
[0011]更为具体的，所述DELLA6蛋白的氨基酸序列如SEQ ID No.2所示。
[0012]更为具体的，所述DELLA6蛋白由556个氨基酸组成，分子重量为61.55KD，理论等电点为5.42。
[0013]与现有技术相比，本专利技术具有如下有益效果：
[0014](1)本专利技术从供试材料中获取DELLA6蛋白基因序列，分析该基因理化活性，把该基因作为调控矮化性状的指标。
[0015](2)本专利技术涉及到DELLA6蛋白基因克隆、与之相对应的氨基酸序列分析，通过半荧光定量方法测定DELLA6蛋白基因表达量，可以为早期预判供试材料是否具有矮化性状提供支持。
附图说明
[0016]图1为DELLA6基因中间片段PCR扩增结果图；
[0017]图2为DELLA6基因3'端PCR扩增结果图；
[0018]图3为DELLA6基因5'端PCR扩增结果图；
[0019]图4为芒果DELLA6与其它植物DELLA6同源性比对结果示意图；
[0020]图5为芒果DELLA6蛋白的氨基酸组分图；
[0021]图6为芒果DELLA6蛋白的信号肽及跨膜结构域分析图；
[0022]图7为芒果DELLA6蛋白二级结构预测图；
[0023]图8为芒果DELLA6蛋白三级结构预测图；
[0024]图9为芒果DELLA6蛋白亲水性和疏水性预测图；
[0025]图10为芒果DELLA6蛋白系统进化树；
[0026]图11为不同物候期金煌芒(乔化特性)和桂七芒(矮化特性)中DELLA6基因表达量图。
具体实施方式
[0027]下面结合对本专利技术专利的技术方案进行清楚、完整的描述，显然，所描述的实施例是本专利技术的一部分实施例，而不是全部的实施例。基于本专利技术中的实施例，本领域所属的技术人员在没有做出创造性劳动前提下所获得的所有其他实施例，都属于本专利技术保护的范围。
[0028]在实施例1中，主要仪器和试剂为：PCR仪：Takara；电泳仪：Bio
‑
Rad；2000分光光度计：Thermo；恒温摇床；超保真DNA聚合酶：NEB；FirstChoice RLM
‑
RACE Kit：Thermo；2
×
Taq Master Mix(Dye Plus)：Vazyme。
[0029]在实施例2中，主要仪器和试剂为：ABI 7900
‑
Fast Real
‑
Time PCR Detection System：ABI；2000分光光度计：Thermo；普通PCR仪：Takara；All
‑
in
‑
One
TM First
‑
Strand cDNA Synthesis Kit：GeneCopoeia(Cat.No.AORT
‑
0050)；All
‑
in
‑
One
TM qPCR Mix：GeneCopoeia(Cat.No.AOPR
‑
0200)；Epcentre
TM RNase R。
[0030]实施例1：芒果DELLA6基因的克隆与序列分析
[0031]一、RNA提取与纯化
[0032]1.总RNA提取(Trizol法)
[0033](1)样品处理：取80
‑
100mg芒果叶片至冷冻研钵中，加入液氮研磨至粉末状，转移至装有1mL Trizol的2.0mL离心管中，振荡混匀后室温静置约5min。
[0034](2)水相分离：每1mL Trizol加入0.2mL氯仿，振荡混匀15s后室温静置约3min，4℃，12000rpm，离心15min。
[0035](3)沉淀：转移水相至新的2.0mL离心管中，每1mL Trizol加入0.5mL异丙醇，混匀后室温静置20min，4℃，12000rpm，离心10min。
[0036](4)洗涤：弃上清，加入1.5mL 80％(质量分数)的乙醇，混匀后4℃，8000rpm，离心5min。
[0037](5)溶解：弃上清，空气干燥RNA沉淀约5min(注意不要完全干燥，只需沉淀泛白即可)，加入DEPC处理水溶解RNA沉淀。
[0038]2.纯化提取的RNA
[0039](1)在微量离心管中配制下列反应液，50ul体系：
[0040][0041](2)本文档来自技高网...

【技术保护点】

【技术特征摘要】
1.一种编码DELLA6蛋白的基因，其特征在于，所述基因的核苷酸序列如SEQ ID No.1所示。2.根据权利要求1所述的编码DELLA6蛋白的基因的应用，其特征在于，所述基因的开放阅读框为1671bp。3.一种权利要求1所述的编码DELLA6蛋白的基因的应用，其特征在于，所述编码DELLA6蛋白的基因用于预判芒果品种是否具有矮化特性。4.一种DE...

【专利技术属性】
技术研发人员：张宇，张继，黄国弟，莫永龙，郝小玲，卢业飞，赵英，郭丽梅，彭鹏，王美又，
申请(专利权)人：广西壮族自治区亚热带作物研究所广西亚热带农产品加工研究所，
类型：发明
国别省市：