【技术实现步骤摘要】
一种用于猴痘病毒野生型和突变型分子分型的引物分子信标组合及其应用
[0001]本专利技术属于生物检测
,具体涉及一种用于猴痘病毒野生型和突变型分子分型的引物分子信标组合及其应用。
技术介绍
[0002]目前,荧光定量PCR应用的探针主要是5
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端
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报告荧光基团和3
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端
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淬灭荧光基团,该方法是通过探针之间的无规则卷曲达到淬灭荧光的效果,然而该标记方法由于空间距离导致报告荧光基团和淬灭荧光基团之间无法达到零距离接触,从而无法实现零背景的荧光。
[0003]虽然,目前已经开发有超级淬灭探针(例如上海百力格生物技术有限公司),在原先5
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报告荧光基团和3
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淬灭荧光基团的基础上在中间再加入BHQ淬灭基团,但是依然无法彻底达到零背景荧光的目的。百力格的对比研究表明:通过超级淬灭探针可以实现对背景荧光彻底淬灭,不仅可以增加检测体系的荧光值Rn值,还可以显著降低相同模板的Ct值,进而可以显著提高分子检测的灵敏 ...
【技术保护点】
【技术特征摘要】
1.一种用于猴痘病毒野生型和突变型分子分型的引物分子信标组合,其特征在于,所述引物分子信标组合包括分别特异性扩增并检测猴痘病毒F3L基因的引物对和分子信标;特异性扩增所述猴痘病毒F3L基因的引物对的核苷酸序列如SEQ ID No.1和SEQ ID No.2所示。2.根据权利要求1所述的用于猴痘病毒野生型和突变型分子分型的引物分子信标组合,其特征在于,检测野生型猴痘病毒的分子信标的核苷酸序列如SEQ ID No.3所示,检测突变型猴痘病毒的分子信标的核苷酸序列如SEQ ID No.4所示。3.根据权利要求1或2所述的用于猴痘病毒野生型和突变型分子分型的引物分子信标组合,其特征在于,所述引物分子信标组合还包括分别特异性扩增并检测内标基因的引物对和分子信标,所述内标基因为RNase P基因;优选地,特异性扩增所述内标基因的引物对的核苷酸序列如SEQ ID No.7和SEQ ID No.8所示;优选地,检测所述内标基因的分子信标的核苷酸序列如SEQ ID No.9所示。4.根据权利要求1
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3中任一项所述的用于猴痘病毒野生型和突变型分子分型的引物分子信标组合,其特征在于,所述分子信标均带有荧光基团和淬灭基团,检测野生型猴痘病毒的分子信标、检测突变型猴痘病毒的分子信标和检测内标基因的分子信标的荧光基团均不同;优选地,所述荧光基团包括FAM、HEX、VIC、ROX、TAMRA、JOE、TET、CY3、CY5、Texas Red或LC RED460中任意一种或至少两种的组合;优选地,所述淬灭荧光基团包括TAMRA、BHQ1、BHQ2、MGB、DABCYL、BHQ3中任意一种或至少两种的组合。5.一种检测猴痘病毒野生型和突变型的检测试剂盒,其特征在于,所述检测试剂盒包括权利要求1
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4中任一项所述的用于猴痘病毒野生型和突变型分子分型的引物分子信标组合。6.一种权利要求5所述的检测猴痘病毒野生型和突变型的检测试剂盒以非疾病诊断和/或治疗为目的的使用方法,其特征在于,所述使用方法包括以下步骤:(1)采集样本并提取DNA,配制PCR扩增体系;(2)对步骤(1)中的PCR体系进行扩增检测;(3)根据步骤(2)中获得的扩增曲线对猴痘病毒及其变异株的检测结果进行检测和判读,判断样本中的病原体感染情况。7.根据权利要求6所述的检测猴痘病毒野生型和突变型的检测试剂...
【专利技术属性】
技术研发人员:杨文文,周凯月,陶维维,窦竞萌,何小明,林灵,
申请(专利权)人:上海华藤生物科技有限公司上海宝藤医学检验所有限公司,
类型:发明
国别省市:
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