一种导致Bohring-Opitz综合征的致病基因ASXL1突变的应用及检测试剂制造技术

本发明专利技术提供了一种ASXL1基因突变c.1132G>T的应用及诊断试剂，属于基因诊断技术领域。本发明专利技术通过外显子组测序技术首次发现了ASXL1:NM_015338.6:exon11:c.1132G>T:p.E378*位点突变导致Bohring

【技术实现步骤摘要】
一种导致Bohring
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Opitz综合征的致病基因ASXL1突变的应用及检测试剂


[0001]本专利技术属于基因诊断
，具体涉及一种导致Bohring
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Opitz综合征的致病基因ASXL1突变的应用及检测试剂。

技术介绍

[0002]Bohring
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Opitz综合征(Bohring
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Opitz syndrome，BOS)(MIM 605039)，是一种罕见的常染色体显性遗传性疾病，1999年由Bohring等首次报道。Bohring
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Opitz综合征的临床表现主要为典型的头面部特征：三角头畸形、小头畸形、颌后缩、睑裂上斜、鼻梁宽、后旋耳、低位耳、腭裂及宽牙槽嵴、鲜红斑痣、前发际线低等，其他还包括胎儿宫内发育迟缓(intrauterine growth ratardation，IUGR)及身材矮小、关节异常、音调异常、严重的发育迟缓、易感染、喂养困难、婴儿死亡率高等。临床诊断标准根据2011年Hastings等报道的Bohring
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Opitz综合征患者最常见的表型制定，同年ASXL1基因(MIM 612990)的胚系突变被认为是导致Bohring
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Opitz综合征的病因。OMIM数据库上该疾病是被收录为常染色体显性遗传疾病，若父母双方其中一人携带ASXL1致病突变，其子女会有50％的概率遗传到相同的致病突变，从而致病。
[0003]ASXL1基因(MIM 612990)定位于染色体20q11.21，基因全长81.0kb，包含12个外显子和11个内含子；ASXL1与ASXL2、ASXL3同属ASXL基因家族；编码1541个氨基酸组成的ASXL1蛋白，属于polycomb group(PcG)和trithorax group(TrxG)蛋白家族，作为共激活因子参与核激素受体(nuclear hormone receptors，NHRs)介导的转录调控，并通过泛素化多梳抑制去泛素化酶复合物(polycomb repressive deubiquitinase，PR
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DUB)来调节基因的表观遗传沉默。ASXL1基因可以维持HOX基因的激活和沉默，后者在人类胚胎发育过程中至关重要。因此，ASXL1基因截短突变可导致蛋白功能丧失，扰乱表观遗传和转录调控，从而导致Bohring
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Opitz综合征临床表现。目前发现的ASXL1突变，包括无义与错义突变、剪接突变、小片段缺失突变、小片段插入突变、小片段缺失插入突变、大片段缺失突变、大片段插入突变等，其中记录为Bohring
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Opitz综合征表型的突变一般为截短突变。
[0004]基因突变是导致Bohring
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Opitz综合征发生发展的重要遗传基础，基因诊断是确诊Bohring
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Opitz综合征的金标准。临床上需要针对不同突变建立相应的检测技术并用于明确病因和疾病诊断。而目前现有技术对Bohring
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Opitz综合征的基因突变类型报道十分有限，不利于全面高效准确筛查患Bainbridge
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Ropers综合征的人群。
[0005]现有技术中对基因突变位点基因型的检测，可以采用其他方法限制性酶切片段长度多态性、单链构象多态性、等位基因特异的寡聚核苷酸杂交等等，但这些检测方法均不能同时满足定性、定量及明确突变基因的序列的目的，所以需要针对特异突变位点的特异性扩增引物。

技术实现思路

[0006]有鉴于此，本专利技术的目的在于提供一种一种导致Bohring
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Opitz综合征的致病基因ASXL1突变的应用，不仅能丰富基因诊断Bohring
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Opitz综合征的突变位点，还能作为靶点为药物筛选、药效评价及靶向治疗提供基础。
[0007]本专利技术的目的还在于提供一种检测导致Bohring
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Opitz综合征的致病基因ASXL1突变位点的试剂，助力Bohring
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Opitz综合征基因突变的筛查和诊断。
[0008]本专利技术提供了一种基因ASXL1突变位点在制备防治Bohring
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Opitz综合征诊断试剂或制备防治Bohring
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Opitz综合征的药物中的应用，所述基因ASXL1突变位点为ASXL1:NM_015338.6:exon11:c.1132G>T:p.E378*。
[0009]本专利技术提供了一种用于检测导致Bohring
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Opitz综合征的致病基因ASXL1突变位点的试剂，包括检测致病基因ASXL1突变位点c.1132G>T的引物；
[0010]所述检测致病基因ASXL1突变位点c.1132G>T的引物包括核苷酸序列如SEQ ID NO:1所示的ASXL1
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F和核苷酸序列如SEQ ID NO:2所示的ASXL1
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R。
[0011]优选的，所述试剂还包括测序引物；
[0012]所述测序引物包括核苷酸序列如SEQ ID NO:3所示的ASXL1
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SeqF和核苷酸序列如SEQ IDNO:4所示的ASXL1
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SeqR。
[0013]本专利技术提供了一种Bohring
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Opitz综合征诊断试剂盒，包括所述试剂和PCR扩增试剂。
[0014]优选的，所述PCR扩增试剂包括dNTP、10
×
PCR缓冲液、镁离子和Tap聚合酶；
[0015]所述10
×
PCR缓冲液包含以下组分的水溶液：500mmol/LKCl、pH 8.3的100mmol/LTris
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Cl和15mmol/LMgCl2。
[0016]本专利技术提供了所述试剂在制备检测导致Bohring
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Opitz综合征的致病基因ASXL1突变位点的试剂盒中的应用。
[0017]本专利技术提供了一种检测基因ASXL1突变位点的引物在制备Bohring
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Opitz综合征辅助诊断试剂盒中的应用，所述基因ASXL1突变位点为ASXL1:NM_015338.6:exon11:c.1132G>T:p.E378*。
[0018]优选的，所述引物为所述试剂。
[0019]优选的，利用所述试剂盒辅助诊断Bohring
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Opitz综合征的方法，包括以下步骤：
[0020]用所述试剂盒检测样本中ASXL1基因突变位点的基因型来诊断个体是否患有Bohring
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Opitz综合征：
[0021]若检测基因型是“c.1132G>T杂合子突变”，则诊断受试个体为Bohring...

【技术保护点】

【技术特征摘要】
1.一种基因ASXL1突变位点在制备防治Bohring
‑
Opitz综合征诊断试剂或制备防治Bohring
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Opitz综合征的药物中的应用，所述基因ASXL1突变位点为ASXL1:NM_015338.6:exon11:c.1132G>T:p.E378*。2.一种用于检测导致Bohring
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Opitz综合征的致病基因ASXL1突变位点的试剂，其特征在于，包括检测致病基因ASXL1突变位点c.1132G>T的引物；所述检测致病基因ASXL1突变位点c.1132G>T的引物包括核苷酸序列如SEQ ID NO:1所示的ASXL1
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F和核苷酸序列如SEQ ID NO:2所示的ASXL1
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R。3.根据权利要求2所述试剂，其特征在于，所述试剂还包括测序引物；所述测序引物包括核苷酸序列如SEQ ID NO:3所示的ASXL1
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SeqF和核苷酸序列如SEQ ID NO:4所示的ASXL1
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SeqR。4.一种Bohring
‑
Opitz综合征诊断试剂盒，其特征在于，包括权利要求2或3所述试剂和PCR扩增试剂。5.根据权利要求4所述试剂盒，其特征在于，所述PCR扩增试剂包括dNTP、10
×
PCR缓冲液...

【专利技术属性】
技术研发人员：曾桥，刘亚宁，伍亮，何博，
申请(专利权)人：湖南家辉生物技术有限公司，
类型：发明
国别省市：