一种与棉花纤维长度QTL紧密连锁的KASP分子标记和应用制造技术

本发明专利技术公开了一种与棉花纤维长度QTL紧密连锁的KASP分子标记组合和应用，属于棉花育种技术领域。包括以下(1)

【技术实现步骤摘要】
一种与棉花纤维长度QTL紧密连锁的KASP分子标记和应用


[0001]本专利技术涉及棉花育种
，特别是涉及一种与棉花纤维长度QTL紧密连锁的KASP分子标记和应用。

技术介绍

[0002]棉花是世界上重要的经济作物，其纤维是纺织工业重要的原材料。目前所应用的棉花栽培种主要是亚洲棉、海岛棉和陆地棉等。陆地棉原产于中美洲，具有适应性好、产量高、纤维长和品质优秀的特点。棉花的经济价值主要是用于制成各种各样的织布品，是世界上最主要的农作物之一。而棉花纤维长度的改善对提高棉花的经济价值有重要作用。
[0003]棉花的纤维长度性状属于数量性状，受多基因的控制。QTL作图是一种分析复杂数量性状遗传基础的有效工具，主要包括连锁分析和关联分析两种方法。连锁分析主要基于由遗传差异大的双亲构建的群体，具有很高的作图能力，但双亲群体缺乏遗传多样性和大量重组事件。关联分析主要基于通过广泛收集种质资源而获得的种质资源群体，该群体具有丰富的遗传变异和表型变异，可以检测到大量的QTL。目前已经在棉花中定位到了大量的与纤维长度有关的QTL，但是如何将这些纤维长度的QTL运用到棉花精准分子育种是个问题。
[0004]利用多亲本杂交群体可以将亲本拥有的纤维长度的QTL聚合到重组单株。聚合纤维长度QTL的重组单株可以用于育种。利用分子标记可以鉴定筛选单个纤维长度QTL的单株的存在与否，以及聚合多个纤维长度QTL的单株。

技术实现思路

[0005]本专利技术的目的是提供一种与棉花纤维长度QTL紧密连锁的KASP分子标记和应用，以解决上述现有技术存在的问题，本专利技术的KASP分子标记能够实现多个纤维长度QTL的聚合鉴定，可以大幅度提高棉花品种的纤维长度，为棉花植株优良品种的筛选提供了有力保障。
[0006]为实现上述目的，本专利技术提供了如下方案：
[0007]一种与棉花纤维长度QTL紧密连锁的KASP分子标记组合，包括以下(1)
‑
(3)中至少一项所述的KASP分子标记组合：
[0008](1)与棉花纤维长度QTL中FL5区间紧密连锁的KASP分子标记KASP
‑
G41、KASP
‑
G42、KASP
‑
G43和KASP
‑
G44；
[0009](2)与棉花纤维长度QTL中FL3区间紧密连锁的KASP分子标记KASP
‑
G21、KASP
‑
G22、KASP
‑
G23和KASP
‑
G24；
[0010](3)与棉花纤维长度QTL中FL2区间紧密连锁的KASP分子标记KASP
‑
G31、KASP
‑
G32、KASP
‑
G33和KASP
‑
G34；
[0011]所述KASP
‑
G41的SNP位点的物理位置为A07染色体的88,396,617bp，为C/T突变；
[0012]所述KASP
‑
G42的SNP位点的物理位置为A07染色体的88,437,416bp，为A/G突变；
[0013]所述KASP
‑
G43的SNP位点的物理位置为A07染色体的88,459,489bp，为C/T突变；
[0014]所述KASP
‑
G44的SNP位点的物理位置为A07染色体的88,469,638bp，为C/T突变；
[0015]所述KASP
‑
G21的SNP位点的物理位置为A09染色体的61,894,952bp，为C/G突变；
[0016]所述KASP
‑
G22的SNP位点的物理位置为A09染色体的61,890,951bp，为C/G突变；
[0017]所述KASP
‑
G23的SNP位点的物理位置为A09染色体的61,976,868bp，为C/T突变；
[0018]所述KASP
‑
G24的SNP位点的物理位置为A09染色体的62,027,231bp，为C/G突变；
[0019]所述KASP
‑
G31的SNP位点的物理位置为D11染色体的24,669,170bp，为G/T突变；
[0020]所述KASP
‑
G32的SNP位点的物理位置为D11染色体的24,671,829bp，为C/G突变；
[0021]所述KASP
‑
G33的SNP位点的物理位置为D11染色体的24,676,672bp，为C/T突变；
[0022]所述KASP
‑
G34的SNP位点的物理位置为D11染色体的24,567,513bp，为A/G突变。
[0023]本专利技术还提供一种与棉花纤维长度QTL中FL5区间紧密连锁的KASP引物对组合，所述KASP引物对组合包括如下表所示引物：
[0024][0025]本专利技术还提供一种与棉花纤维长度QTL中FL3区间紧密连锁的KASP引物对组合，所述KASP引物对组合包括如下表所示引物：
[0026][0027][0028]本专利技术还提供一种与棉花纤维长度QTL中FL2区间紧密连锁的KASP引物对组合，所述KASP引物对组合包括如下表所示引物：
[0029][0030]本专利技术还提供一种利用单个棉花纤维长度QTL分子标记鉴定棉花纤维长度性状的方法，包括以下步骤，
[0031]S1.利用所述的KASP引物对组合对待测棉花材料进行KASP分子标记基因型分型检测；
[0032]S2.当能够读取到以下(1)
‑
(3)任一项所述的扩增信号时，将所述待测棉花材料鉴定为棉花长纤维性状植株：
[0033](1)当采用所述的KASP引物对组合时，所述KASP
‑
G41、所述KASP
‑
G42、所述KASP
‑
G43和所述KASP
‑
G44均检测到引物类型为X的扩增信号；
[0034](2)当采用所述的KASP引物对组合时，所述KASP
‑
G21、所述KASP
‑
G22、所述KASP
‑
G23和所述KASP
‑
G24均检测到引物类型为Y的扩增信号；
[0035](3)当采用所述的KASP引物对组合时，所述KASP
‑
G31、所述KASP
‑
G32、所述KASP
‑
G33和所述KASP
‑
G34均检测到引物类型为X的扩增信号。
[0036]本专利技术还提供一种利用多个棉花纤维长度QTL分子标记鉴定棉花纤维长度性状的
方法，包括以下步骤，
[0037](1)利用所述的KASP引物对组合对待测棉花材料进行KASP分子标记基因型分型检本文档来自技高网...

【技术保护点】

【技术特征摘要】
1.一种与棉花纤维长度QTL紧密连锁的KASP分子标记组合，其特征在于，包括以下(1)
‑
(3)中至少一项所述的KASP分子标记组合：(1)与棉花纤维长度QTL中FL5区间紧密连锁的KASP分子标记KASP
‑
G41、KASP
‑
G42、KASP
‑
G43和KASP
‑
G44；(2)与棉花纤维长度QTL中FL3区间紧密连锁的KASP分子标记KASP
‑
G21、KASP
‑
G22、KASP
‑
G23和KASP
‑
G24；(3)与棉花纤维长度QTL中FL2区间紧密连锁的KASP分子标记KASP
‑
G31、KASP
‑
G32、KASP
‑
G33和KASP
‑
G34；所述KASP
‑
G41的SNP位点的物理位置为A07染色体的88,396,617bp，为C/T突变；所述KASP
‑
G42的SNP位点的物理位置为A07染色体的88,437,416bp，为A/G突变；所述KASP
‑
G43的SNP位点的物理位置为A07染色体的88,459,489bp，为C/T突变；所述KASP
‑
G44的SNP位点的物理位置为A07染色体的88,469,638bp，为C/T突变；所述KASP
‑
G21的SNP位点的物理位置为A09染色体的61,894,952bp，为C/G突变；所述KASP
‑
G22的SNP位点的物理位置为A09染色体的61,890,951bp，为C/G突变；所述KASP
‑
G23的SNP位点的物理位置为A09染色体的61,976,868bp，为C/T突变；所述KASP
‑
G24的SNP位点的物理位置为A09染色体的62,027,231bp，为C/G突变；所述KASP
‑
G31的SNP位点的物理位置为D11染色体的24,669,170bp，为G/T突变；所述KASP
‑
G32的SNP位点的物理位置为D11染色体的24,671,829bp，为C/G突变；所述KASP
‑
G33的SNP位点的物理位置为D11染色体的24,676,672bp，为C/T突变；所述KASP
‑
G34的SNP位点的物理位置为D11染色体的24,567,513bp，为A/G突变。2.一种与棉花纤维长度QTL中FL5区间紧密连锁的KASP引物对组合，其特征在于，所述KASP引物对组合包括如下表所示引物：KASP引物对组合包括如下表所示引物：3.一种与棉花纤维长度QTL中FL3区间紧密连锁的KASP引物对组合，其特征在于，所述KASP引物对组合包括如下表所示引物：
4.一种与棉花纤维长度QTL中FL2区间紧密连锁的KASP引物对组合，其特...

【专利技术属性】
技术研发人员：杜雄明，赵盈睿，何守朴，陈保军，潘兆娥，贾银华，庞保印，王静静，
申请(专利权)人：中国农业科学院棉花研究所，
类型：发明
国别省市：