一种适用于罗尔斯通式菌基因组进化的系统、应用及基因组进化方法技术方案

本发明专利技术公开了一种适用于罗尔斯通式菌基因组进化的系统、应用及基因组进化方法。本发明专利技术适用于罗尔斯通式菌基因组进化的系统包括用于将编码胞嘧啶脱氨酶的基因和编码特异性单链DNA结合蛋白的基因进行融合表达的表达载体。利用本发明专利技术建立的基因组进化方法，对罗尔斯通式菌基因组进行连续进化，在操作上具有简单、高效等优点；在功能上，能提高底物消耗速率、扩展底物谱、增强对有机试剂、氧化剂及电微生物系统等生长环境的耐受性，有助于后续的合成生物学改造。所以，使用本发明专利技术的基因组进化方法能够造成菌体性状和功能的多样性，根据工业生产要求，可对某一性状(如菌株鲁棒性和生物合成效率)进行连续筛选和定向进化。物合成效率)进行连续筛选和定向进化。物合成效率)进行连续筛选和定向进化。

【技术实现步骤摘要】
J，et al.Helicase
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AID：A novel molecular device for base editing at random genomic loci[J].Metabolic Engineering，2021，67：396
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402)等，但目前这些方法还未被应用于罗氏菌。

技术实现思路

[0006]针对现有技术中存在的上述问题，本专利技术提供了种适用于罗尔斯通式菌基因组进化的系统、应用及基因组进化方法，能够简单、高效地提高罗尔斯通式菌的鲁棒性和生物合成效率。
[0007]一种适用于罗尔斯通式菌(Cupriavidus necator H16)基因组进化的系统，包括用于将编码胞嘧啶脱氨酶的基因和编码特异性单链DNA结合蛋白的基因进行融合表达的表达载体，
[0008]所述编码胞嘧啶脱氨酶的基因为：大鼠(Rattus norvegicus)来源的胞嘧啶脱氨酶编码基因APOBEC或七鳃鳗(Lampetra japonicum)来源的胞嘧啶脱氨酶编码基因PmCDA；
[0009]所述编码特异性单链本文档来自技高网...

【技术保护点】

【技术特征摘要】
1.一种适用于罗尔斯通式菌(Cupriavidus necator H16)基因组进化的系统，其特征在于，包括用于将编码胞嘧啶脱氨酶的基因和编码特异性单链DNA结合蛋白的基因进行融合表达的表达载体，所述编码胞嘧啶脱氨酶的基因为：大鼠(Rattus norvegicus)来源的胞嘧啶脱氨酶编码基因APOBEC或七鳃鳗(Lampetra japonicum)来源的胞嘧啶脱氨酶编码基因PmCDA；所述编码特异性单链DNA结合蛋白的基因来源于罗尔斯通氏菌，具体为以下任一种：(1)DNA解旋酶dnaB；(2)DNA引物酶dnaG；(3)单链结合蛋白SSB；(4)单链结合蛋白h16_A0402。2.根据权利要求1所述适用于罗尔斯通式菌基因组进化的系统，其特征在于，PmCDA或APOBEC基因的核苷酸序列根据罗尔斯通式菌进行密码子优化。3.根据权利要求1所述适用于罗尔斯通式菌基因组进化的系统，其特征在于，胞嘧啶脱氨酶编码基因APOBEC的基因序列如SEQ ID No.1或SEQ ID No.2所示；胞嘧啶脱氨酶编码基因PmCDA的基因序列如SEQ ID No.3所示；DNA解旋酶dnaB的基因序列如SEQ ID No.4所示；DNA引物酶dnaG的基因序列如SEQ ID No.5所示；单链结合蛋...

【专利技术属性】
技术研发人员：连佳长，汪之骄，潘浩杰，
申请(专利权)人：浙江大学杭州国际科创中心，
类型：发明
国别省市：