用于沉默SCN9A表达的组合物和方法技术

本公开涉及靶向SCN9A的双链核糖核酸(dsRNA)组合物，以及使用这类dsRNA组合物改变(例如，抑制)SCN9A表达的方法。抑制)SCN9A表达的方法。

【技术实现步骤摘要】
【国外来华专利技术】用于沉默SCN9A表达的组合物和方法
[0001]相关申请
[0002]本申请要求2020年4月7日提交的美国临时申请号63/006,328和2021年3月15日提交的美国临时申请号63/161,313的优先权。前述申请的全部内容在此引入作为参考。
[0003]序列表
[0004]本申请包含以ASCII格式电子提交的序列表，并在此全文引入作为参考。于2021年4月2日创建的所述ASCII副本的名称为A2038
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7235WO_SL.txt，且大小为1,514,568字节。


[0005]本公开涉及对SCN9A基因表达的特异性抑制。

技术介绍

[0006]疼痛，例如，慢性疼痛是普遍症状和残疾的主要原因。慢性疼痛可由炎性疼痛或神经病理性疼痛引起，或其可与疾病或障碍相关，例如癌症、关节炎、糖尿病、创伤性损伤和/或病毒感染。对疼痛的高敏感性或低敏感性也可能由疼痛相关的障碍导致，包括但不限于无法感知疼痛、原发性红斑性肢痛症(PE)和阵发性剧痛症(PEPD)。目前对疼痛的治疗对其靶标是非选择性的，并导致涉及中枢神经系统(CNS)的不需要的脱靶效应。需要新的疼痛治疗方法，例如慢性疼痛和疼痛相关障碍。

技术实现思路

[0007]本公开描述了用于调节SCN9A表达的方法和iRNA组合物。在某些实施方案中，使用SCN9A特异性iRNA降低或抑制SCN9A的表达。这种抑制可用于治疗与SCN9A表达相关的障碍，如疼痛，例如急性疼痛或慢性疼痛(例如，炎性疼痛、神经病理性疼痛、疼痛超敏反应、疼痛低敏感性、无法感知疼痛、原发性红斑性肢痛症(PE)、阵发性剧痛症(PEPD)、小纤维神经病(SFN)、三叉神经痛(TN)以及与例如癌症、关节炎、糖尿病、创伤性损伤和病毒感染相关的疼痛)。
[0008]因此，本文描述了实现SCN9A的RNA转录物由RNA诱导的沉默复合物(RISC)介导的裂解的组合物和方法，如在细胞或受试者(例如在哺乳动物，如人类受试者)中。还描述了用于治疗与SCN9A表达相关的障碍的组合物和方法，例如疼痛(例如，急性疼痛或慢性疼痛，例如，炎性疼痛、神经病理性疼痛、疼痛超敏反应、疼痛低敏感性、无法感知疼痛、原发性红斑性肢痛症(PE)、阵发性剧痛症(PEPD)、小纤维神经病(SFN)、三叉神经痛(TN)和与例如癌症、关节炎、糖尿病、创伤性损伤和病毒感染相关的疼痛)。
[0009]本文所述组合物中包含的iRNA(例如dsRNA)包括具有与SCN9A(例如人SCN9A)的mRNA转录物的至少一部分基本互补的区域(例如长度为30个核苷酸或更少，通常19
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24个核苷酸的区域)的RNA链(反义链)(在本文中也称为“SCN9A特异性iRNA”)。在一些实施方案中，SCN9A mRNA转录物是人SCN9A mRNA转录物，例如，本文中的SEQ ID NO:1。
[0010]在一些实施方案中，本文所述的iRNA(例如dsRNA)包含具有与人SCN9A mRNA的区
域基本上互补的区域的反义链。在一些实施方案中，人SCN9A mRNA具有序列NM_002977.3(SEQ ID NO:1)或NM_001365536.1(SEQ ID NO:4001)。在一些实施方案中，人SCN9A mRNA具有序列NM_002977.3(SEQ ID NO:1)。NM_002977.3的序列也通过引用整体并入本文。SEQ ID NO:1的反向互补序列在本文中作为SEQ ID NO:2提供。在一些实施方案中，人SCN9A mRNA具有序列NM_001365536.1(SEQ ID NO:4001)。NM_001365536.1的序列也通过引用整体并入本文。SEQ ID NO:4001的反向互补序列在本文中作为SEQ ID NO:4002提供。
[0011]在一些方面，本公开提供了一种用于抑制电压门控钠通道，IX型α亚基(SCN9A)表达的双链核糖核酸(dsRNA)剂，其中dsRNA剂包含形成双链区的有义链和反义链，其中有义链包含含有人SCN9A的编码链的一部分的至少15个连续核苷酸(具有0、1、2或3个错配)的核苷酸序列，并且该反义链包含含有人SCN9A的非编码链的相应部分的至少15个连续核苷酸(具有0、1、2或3个错配)的核苷酸序列，使得该有义链与反义链中的该至少15个连续核苷酸互补。
[0012]在一些方面，本公开提供了一种用于抑制SCN9A表达的双链核糖核酸(dsRNA)剂，其中dsRNA剂包含形成双链区的有义链和反义链，其中该反义链包括含有SEQ ID NO:2的核苷酸序列的一部分的至少15个连续核苷酸(具有0、1、2或3个错配)的核苷酸序列，使得该有义链与反义链中的该至少15个连续核苷酸互补。
[0013]在一些方面，本公开提供了一种人细胞或组织，与其他方面类似的未处理的细胞或组织相比，其包含降低的SCN9A mRNA水平或SCN9A蛋白水平，其中任选地该细胞或组织未进行遗传工程化(例如，其中该细胞或组织包含一种或多种天然产生的突变，例如SCN9A)，其中任选地该水平降低至少10％、15％、20％、25％、30％、35％、40％、45％、50％、55％、60％、65％、70％、75％、80％、85％、90％或95％。在一些实施方案中，人细胞或组织是人外周感觉神经元(例如背根节中的外周感觉神经元，或伤害感受神经元，例如A
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δ纤维或C
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型纤维)。
[0014]在一些方面中，本公开还提供了包含本文所述dsRNA剂的细胞。
[0015]在一些方面，本公开还提供了用于抑制编码SCN9A的基因的表达的药物组合物，其包含本文所述的dsRNA剂。
[0016]在一些方面中，本公开还提供了一种抑制细胞中SCN9A表达的方法，该方法包括：
[0017](a)将细胞与本文所述的dsRNA剂或本文所述的药物组合物接触；和
[0018](b)将步骤(a)中产生的细胞维持足够长的时间以获得SCN9A的mRNA转录物的降解，从而抑制SCN9A在细胞中的表达。
[0019]在一些方面中，本公开还提供了一种抑制细胞中SCN9A表达的方法，该方法包括：
[0020](a)将细胞与本文所述的dsRNA剂或本文所述的药物组合物接触；和
[0021](b)将步骤(a)中产生的细胞维持足够的时间以降低SCN9A mRNA、SCN9A蛋白或SCN9A mRNA和蛋白两者的水平，从而抑制细胞中SCN9A的表达。
[0022]在一些方面中，本公开还提供了一种抑制中枢神经系统(CNS)的细胞或组织中SCN9A表达的方法，该方法包括：
[0023](a)将细胞或组织与结合SCN9A的dsRNA剂接触；和
[0024](b)将步骤(a)中产生的细胞或组织维持足够的时间以降低SCN9A mRNA、SCN9A蛋白或SCN9A mRNA和蛋白两者的水平，从而抑制细胞或组织中SCN9A的表达。...

【技术保护点】

【技术特征摘要】
【国外来华专利技术】1.一种用于抑制电压门控钠通道，IX型α亚基(SCN9A)表达的双链核糖核酸(dsRNA)剂，其中所述dsRNA剂包含形成双链区的有义链和反义链，其中所述反义链包含含有选自表2A、2B、4A、4B、5A、5B、6A、6B、13A、13B、14A、14B、15A、15B、16、18和20中任一个所列的反义序列之一的至少15个连续核苷酸的核苷酸序列，具有0、1、2或3个错配，并且其中所述有义链包含含有对应于所述反义序列的选自表2A、2B、4A、4B、5A、5B、6A、6B、13A、13B、14A、14B、15A、15B、16、18和20中任一个所列的有义序列的至少15个连续核苷酸的核苷酸序列，具有0、1、2或3个错配。2.根据权利要求1所述的dsRNA剂，其中所述有义链的部分是SEQ ID NO：4001的核苷酸581
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601、760
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780或8498
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8518内的部分。3.根据权利要求1或2所述的dsRNA剂，其中所述有义链的部分是选自AD
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1251284(UGUCGAGUACACUUUUACUGA(SEQ IDNO:4827))、AD
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961334(CAACACAATUTCUUCUUAGCA(SEQ IDNO:5026))或AD
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1251325(AAAACAAUCUUCCGUUUCAAA(SEQ ID NO:4822))的双链体的有义链内的部分。4.根据权利要求1
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3中任一项所述的dsRNA剂，其中所述有义链的部分是选自AD
‑
1251284(UGUCGAGUACACUUUUACUGA(SEQ ID NO:4827))、AD
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961334(CAACACAATUTCUUCUUAGCA(SEQ ID NO:5026))或AD
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1251325(AAAACAAUCUUCCGUUUCAAA(SEQ ID NO:4822))的有义链的有义链。5.根据权利要求1
‑
4中任一项所述的dsRNA，其中所述反义链的部分是选自AD
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1251284(UCAGTAAAAGUGUACTCGACAUU(SEQ ID NO:5093))、AD
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961334(UGCUAAGAAGAAATUGUGUUGUU(SEQ ID NO:5292))或AD
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1251325(UUUGAAACGGAAGAUUGUUUUCC(SEQ ID NO:5088))的双链体的反义链内的部分。6.根据权利要求1
‑
5中任一项所述的dsRNA，其中所述反义链的部分是选自AD
‑
1251284(UCAGTAAAAGUGUACTCGACAUU(SEQ ID NO:5093))、AD
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961334(UGCUAAGAAGAAATUGUGUUGUU(SEQ ID NO:5292))或AD
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1251325(UUUGAAACGGAAGAUUGUUUUCC(SEQ ID NO:5088))的反义链的反义链。7.根据权利要求1
‑
6中任一项所述的dsRNA，其中所述有义链和所述反义链包含选自AD
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1251284(SEQ ID NO:4827和5093)、AD
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961334(SEQ ID NO:5026和5292)或AD
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1251325(SEQ ID NO:4822和5088)的双链体的成对有义链和反义链的核苷酸序列。8.根据权利要求1
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7中任一项所述的dsRNA剂，其中所述反义链包含表16中所列的反义序列的核苷酸序列，并且所述有义链包含对应于所述反义序列的表16中所列的有义序列的核苷酸序列。9.根据权利要求1
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8中任一项所述的dsRNA剂，其中所述dsRNA剂是AD
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1251284、AD
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961334、AD
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1251325、AD
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1331352、AD
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1209344或AD
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1331350。10.根据权利要求1
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9中任一项所述的dsRNA剂，其中所述有义链和所述反义链中的至少一个与一个或多个亲脂性部分缀合。11.根据权利要求10所述的dsRNA剂，其中所述亲脂性部分经由接头或载体缀合。12.根据权利要求10或11所述的dsRNA剂，其中一个或多个亲脂性部分缀合于至少一条链上的一个或多个内部位置。13.根据权利要求12所述的dsRNA剂，其中所述一个或多个亲脂性部分经由接头或载体
缀合于至少一条链上的一个或多个内部位置。14.根据权利要求10
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13中任一项所述的dsRNA剂，其中所述亲脂性部分是脂族、脂环族或聚脂环族化合物。15.根据权利要求14所述的dsRNA剂，其中所述亲脂性部分含有饱和或不饱和C16烃链。16.根据权利要求10
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15中任一项所述的dsRNA剂，其中所述亲脂性部分经由替代所述内部位置或所述双链区中的一个或多个核苷酸的载体缀合。17.根据权利要求10
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15中任一项所述的dsRNA剂，其中所述亲脂性部分经由包含醚、硫醚、脲、碳酸酯、胺、酰胺、马来酰亚胺
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硫醚、二硫化物、磷酸二酯、磺酰胺键、点击反应产物或氨基甲酸酯的接头与所述双链iRNA剂缀合。18.根据权利要求10
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16中任一项所述的双链iRNA剂，其中所述亲脂性部分与核碱基、糖部分或核苷间键缀合。19.根据前述权利要求中任一项所述的dsRNA剂，其中所述dsRNA剂包含至少一个修饰的核苷酸。20.根据权利要求19所述的dsRNA剂，其中所述有义链的不超过5个核苷酸和所述反义链的不超过5个核苷酸是未修饰的核苷酸。21.根据权利要求19所述的dsRNA剂，其中所述有义链的所有核苷酸和所述反义链的所有核苷酸都包含修饰。22.根据权利要求19
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21中任一项所述的dsRNA剂，其中所述修饰的核苷酸中的至少...

【专利技术属性】
技术研发人员：W，
申请(专利权)人：阿尔尼拉姆医药品有限公司，
类型：发明
国别省市：