【技术实现步骤摘要】
用于变体检测的方法
[0001]本申请是申请号为2016800685006的中国专利申请(申请日:2016年11月25日,专利技术名称:用于变体检测的方法)的分案申请。
[0002]本专利技术可用来提供一种检测DNA中的变体诸如单核苷酸多态性(SNP)、多核苷酸多肽性(MNP)和插入/缺失的更有效和不太易错的方法。本专利技术还提供了一种用于进行便宜的多色测定的方法,并且提供了用于在二维图中可视化多个等位基因结果的方法。
技术介绍
[0003]RNA酶H2依赖的PCR(rhPCR)(参见美国专利申请公开号US 2009/0325169 A1,通过提及以其整体并入)和标准等位基因特异性PCR(ASPCR)均可用于突变检测。在ASPCR中,DNA聚合酶通过检测在引物的3
’
端或3
’
端附近的错配进行错配辨别。虽然ASPCR在错配检测中有时是成功的,但是由于野生型DNA聚合酶的低错配检测能力,辨别可能受限。
[0004]与ASPCR相反,rhPCR中的RNA酶H2酶的错配灵敏度允许 ...
【技术保护点】
【技术特征摘要】
1.一种用于rhPCR的封闭
‑
可切割的引物,所述引物包含:5
’‑
A
‑
B
‑
C
‑
D
‑
E
‑3’
其中,A为任选的,并且为不与靶标互补的尾延伸;B为与靶标互补的序列结构域;C为辨别结构域;D为可切割的结构域,当与所述靶标杂交时所述可切割的结构域可被RNA酶H2切割;并且E为封闭结构域,所述封闭结构域防止所述引物的延伸。2.权利要求1的引物,其中,D包含1
‑
3个RNA碱基。3.权利要求1的引物,其中,D包含1个RNA碱基。4.权利要求1的引物,其中,所述可切割结构域包含以下部分中的一个或多个:DNA残基、脱碱基残基、修饰的核苷或修饰的磷酸核苷酸间连接。5.权利要求4的引物,其中,侧接所述切割位点的序列...
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