【技术实现步骤摘要】
一种提取植物DNA的方法
[0001]本专利技术属于分子生物学
,涉及一种提取植物DNA的方法。
技术介绍
[0002]近年来Pacific Biosciences、Oxford Nanopore Technologies、Bionano Genomics和10x Genomics等公司的长读长测序技术越来越受欢迎,随着相关技术的推广应用,而获得大片段、高纯度、高含量和高完整性的基因组DNA显得尤为重要。高质量DNA分子(high
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molecular
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weight DNA)是指片段长度在200bp
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1Mb之间,目前已应用于基因组测序、甲基化研究和突变鉴定等多个研究领域。
[0003]传统DNA提取方法获得的DNA片段长度在50kb左右,很少有大片段DNA,而以NanoPore、PacBio为代表的三代测序平台具有长读长的优点,三代测序技术对DNA质量要求较高,即:OD260/280比值范围在1.7
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2.0,OD260/230比值范围 ...
【技术保护点】
【技术特征摘要】
1.一种提取植物DNA的方法,其特征在于,所述方法包括:将研磨后的植物组织样品与裂解缓冲液混合,加热孵育,离心获取上清液,将所述上清液与沉淀液混合并进行低温处理,再次离心获取最终上清液,进行分离纯化处理,得到DNA;所述裂解缓冲液含有:醋酸盐、乙二胺四乙酸二钠、十二烷基硫酸钠、聚乙烯吡咯烷酮和氯化钠,所述沉淀液含有醋酸盐。2.根据权利要求1所述的方法,其特征在于,所述分离纯化处理具体包括:向最终上清液中加入异丙醇和羟基磁珠溶液进行核酸吸附,用漂洗液漂洗磁珠,用第一洗脱液进行洗脱获得DNA粗提液;向DNA粗提液中加入羧基磁珠溶液进行纯化,收集磁珠,用漂洗液漂洗磁珠,用第二洗脱液进行洗脱获得高质量DNA溶液。3.根据权利要求1或2所述的方法,其特征在于,所述研磨在液氮环境中进行。4.根据权利要求1
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3中任一项所述的方法,其特征在于,所述裂解缓冲液的pH为4.0
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6.5;优选地,所述裂解缓冲液中所述醋酸盐的浓度为20
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200mM;优选地,所述裂解缓冲液中所述乙二胺四乙酸二钠的浓度为20
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300mM;优选地,所述裂解缓冲液中所述十二烷基硫酸钠质量百分比为0.5
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5%;优选地,所述裂解缓冲液中所述聚乙烯吡咯烷酮质量体积百分比为0.5
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5%;优选地,所述裂解缓冲液中所述氯化钠的浓度为200
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1500mM;优选地,所述裂解缓冲液中所述醋酸盐包括醋酸钠、醋酸钾或醋酸铵中任意一种;优选地,所述裂解缓冲液中所述聚乙烯吡咯烷酮包括PVPK30、PVPK10或PVP40中任意一种;优选地,所述沉淀液中醋酸盐包括醋酸钠、醋酸钾或醋酸铵中任意一种。5.根据权利要求1
‑
4中任一项所述的方法,其特征在于,所述植物组织样品与裂解缓冲液的质量体积比为1g:(3
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10)mL。6.根据权利要求1
‑
5中任一项所述的方法,其特征在于,所述低温处理包括:3
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10℃条件下放置5
‑
3...
【专利技术属性】
技术研发人员:梁婷婷,董亚晨,
申请(专利权)人:上海美吉生物医药科技有限公司,
类型:发明
国别省市:
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