ISL1基因启动子变异及其应用与先天性心脏病基因检测试剂盒制造技术

本发明专利技术提供了一种I SL1基因启动子变异及其应用与先天性心脏病基因检测试剂盒，所述I SL1基因启动子变异包括包括Chr5:51382704A>G、Chr5:51382753G>A、Chr5:51383208G>A、Chr5:51383344C>T、Chr5:51383046G>C、Chr5:51383202A>G、Chr5:51383370A>G、Chr5:51383432G>A、Chr5:51382310T>C、Chr5:51382458A>G、Chr5:51382600G>A、Chr5:51382736G>A和/或Chr5:51383447C>G中的一种或多种组合，可在制备先天性心脏病检测制剂或医疗器械方面进行应用，包括但不限于先天性心脏病检测试剂盒，通过检测上述I SL1基因启动子变异在受试者中是否存在，有效确认患者是否具有先天性心脏病相关疾病。具有先天性心脏病相关疾病。具有先天性心脏病相关疾病。

【技术实现步骤摘要】
ISL1基因启动子变异及其应用与先天性心脏病基因检测试剂盒


[0001]本专利技术涉及分子生物学领域，尤其是涉及ISL1基因启动子变异及其应用与先天性心脏病基因检测试剂盒。

技术介绍

[0002]先天性心脏病(congenital heart disease,CHD)是一种严重威胁患者生活健康的先天性畸形，其发病率约1
‑
2％，在所有先天性出生缺陷中居首位。同时，CHD是最常见的致死性畸形，是婴儿死亡的主要原因之一，占死亡胎儿的30％。
[0003]法洛四联症(Tetralogy of Fallot，TOF)是一种常见的复杂性先天性心脏畸形，是儿童紫绀型心脏畸形的主要原因，每10,000例活产婴儿中有3例发生，占所有先天性心脏畸形的7
‑
10％。TOF的基本病理特征包括室间隔缺损、右心室流出道梗阻、主动脉覆盖和右心室肥厚等。如果不及时手术治疗，只有10％的患者可以生长到20岁以上。
[0004]房间隔缺损(Atrial septal defect,ASD)也是最常见的发育性心脏病之一，占儿童CHD的7
‑
10％，成人CHD的25
‑
30％。由于心脏解剖结构的异质性以及多种并发症(主要是心律失常、血栓栓塞、右心衰和部分患者的肺动脉高压)，现阶段对于ASD的最佳诊断和治疗仍然是一个挑战。
[0005]室间隔缺损(Ventricular septal defect，VSD)是最常见的CHD，约占CHD的20％
‑
>35％。尽管某些VSD影响多个家庭成员，但大多数VSD(约80％)都是散发性的。VSD的病因很复杂，目前主流观点认为遗传因素和环境因素在其中起了至关重要的作用。尽管众多学者付出了巨大的努力，但目前VSD的形成机理仍是一个迷。因此，在基因水平上探究VSD的发生机制及其相应的防治已成为当前心血管领域亟待解决的关键课题。
[0006]目前认为大约90％的CHD是遗传因素及环境致畸共同作用的结果。许多流行病学研究认为遗传因素是导致CHD的最重要原因。
[0007]ISL1基因定位于5q11.1染色体上，在标记心脏祖细胞和心脏分化及产生多种功能性心血管细胞谱系过程中起着至关重要的作用。动物实验表明，缺乏isl1的小鼠发生了严重的心脏畸形，包括来自第二心生区的结构的丧失，如右心室、流出道和大部分心房等。越来越多的证据表明，ISL1基因的突变和缺失可导致不同类型的冠心病，包括室间隔缺损、先天性双出口右心室和大动脉转位。基因的启动子区发生变异可能中断转录调控，改变基因的表达。因此，通过对ISL1基因启动子的进一步研究，有望在筛选CHD患者的试剂或仪器方面取得新的突破。

技术实现思路

[0008]本专利技术所要解决的技术问题在于提供一种ISL1基因启动子变异。
[0009]本专利技术所要解决的另一技术问题在于提供上述ISL1基因启动子变异的应用。
[0010]本专利技术所要解决的另一技术问题在于提供应用上述ISL1基因启动子变异的先天
性心脏病基因检测试剂盒。
[0011]本专利技术采用的技术方案是：
[0012]一种ISL1基因启动子变异，包括Chr5:51382704A>G、Chr5:51382753G>A、Chr5:51383208G>A、Chr5:51383344C>T、Chr5:51383046G>C、Chr5:51383202A>G、Chr5:51383370A>G、Chr5:51383432G>A、Chr5:51382310T>C、Chr5:51382458A>G、Chr5:51382600G>A、Chr5:51382736G>A和/或Chr5:51383447C>G中的一种或多种组合。
[0013]上述启动子变异前的原始序列可在NCBI网站查询获得。
[0014]上述ISL1基因启动子变异在制备先天性心脏病检测制剂或医疗器械方面的应用。
[0015]优选的，上述ISL1基因启动子变异的应用，所述医疗器械为先天性心脏病检测试剂盒。
[0016]一种应用上述ISL1基因启动子变异的先天性心脏病基因检测试剂盒，包括：
[0017]一对特异性扩增引物：
[0018]正向：5
′‑
CTGTCTTTGGGAGACCGTAACA
‑3′
[0019]反向：5
′‑
TGCCAATGCTGAAAGAGCCG
‑3′
[0020]高保真Taq酶、dNTP mix和PCR buffer，以及阳性对照质粒：pMD19T
‑
51382704G、pMD19T
‑
51382753A、pMD19T
‑
51383208A、pMD19T
‑
51383344T、pMD19T
‑
51383046C、pMD19T
‑
51383202G、pMD19T
‑
51383370G、pMD19T
‑
51383432A、pMD19T
‑
51382310C、pMD19T
‑
51382458G、pMD19T
‑
51382600A、pMD19T
‑
51382736A和/或pMD19T
‑
51383447G。
[0021]上述先天性心脏病基因检测试剂盒的具体操作方法，采用的反应体系和PCR程序如下：
[0022][0023]本专利技术的有益效果是：
[0024]上述ISL1基因启动子变异通过目的片段扩增引物的设计、PCR反应体系和反应程序的优化，可应用于试剂盒，有效对先天性心脏病患者进行筛选，通过检测上述ISL1基因启动子变异在受试者中是否存在，有效确认患者是否具有先天性心脏病相关疾病。
附图说明
[0025]图1琼脂糖电泳检测提取的人类样本gDNA；
[0026]图2琼脂糖电泳检测PCR扩增获得的ISL1基因启动子片段；
[0027]图3TOF患者中ISL1基因启动子变异位点测序峰图；
[0028]图4ASD患者中ISL1基因启动子变异位点测序峰图；
[0029]图5VSD患者中ISL1基因启动子变异位点测序峰图。
具体实施方式
[0030]为了使本领域的技术人员更好的理解本专利技术的技术方案，下面结合附图及具体实施方式对本专利技术所述技术方案作进一步的详细说明。
[0031]实施例1
[0032]收集人类血液标本数例，提取全部标本的基因组，根据NCBI数据库中收录的ISL1基因启动子区序列，设计上下游引物；优化PCR反应体系和反应程本文档来自技高网...

【技术保护点】

【技术特征摘要】
1.一种ISL1基因启动子变异，其特征在于：包括Chr5:51382704A>G、Chr5:51382753G>A、Chr5:51383208G>A、Chr5:51383344C>T、Chr5:51383046G>C、Chr5:51383202A>G、Chr5:51383370A>G、Chr5:51383432G>A、Chr5:51382310T>C、Chr5:51382458A>G、Chr5:51382600G>A、Chr5:51382736G>A和/或Chr5:51383447C>G中的一种或多种组合。2.权利要求1所述的ISL1基因启动子变异在制备先天性心脏病检测制剂或医疗器械方面的应用。3.根据权利要求2所述的ISL1基因启动子变异的应用，其特征在于：所述医疗器械为先天性心脏病检测试剂盒。4.一种应用权利要求1所述ISL1基因启动子变异的先天性心脏病基因检测试剂盒，其特征在于：包括：一对特异性扩增引物：正向：5
′‑
CTGTCTTTGGG...

【专利技术属性】
技术研发人员：何国伟，尹秀云，陈焕新，陈卓，杨沁，王君，
申请(专利权)人：泰达国际心血管病医院，
类型：发明
国别省市：