致癌CHD1L的具有抗结肠直肠癌的临床前活性的小分子抑制剂制造技术

技术编号:36518397 阅读:16 留言:0更新日期:2023-02-01 15:51
使用CHD1L抑制剂治疗CHD1L驱动的癌症,包括TCF转录驱动的癌症和EMT驱动的癌症。已经鉴定出抑制CHD1L ATP酶和抑制CHD1L依赖性TCF转录的CHDL1的小分子抑制剂。CHD1L抑制剂防止TCF复合体与Wnt响应元件和启动子位点结合。更具体地,CHD1L抑制剂诱导EMT的逆转。CHD1L抑制剂可用于治疗各种癌症,尤其是CRC和m

【技术实现步骤摘要】
【国外来华专利技术】致癌CHD1L的具有抗结肠直肠癌的临床前活性的小分子抑制剂
[0001]相关申请的交叉引用
[0002]本申请要求于2020年3月24日提交的美国临时申请62/994,259和2021年1月20日提交的美国临时申请63/139,394的权益,两者均通过引用全部并入本文。
[0003]关于美国政府支持的声明
[0004]这项专利技术是在国防部(DoD)授予的资助号W81XWH1810142的政府资助下完成的。美国政府对这项专利技术拥有某些权利。

技术介绍

[0005]基因组的完整性通过染色质结构的构象变化来维持,染色质结构的构象变化调节DNA对于基因表达和复制的可接近性。染色质结构通过组蛋白的翻译后修饰和核小体的重排来维持[Lorch等人,2010;Kumar等人,2016;Swygert等人,2014]。ATP依赖的染色质重塑剂是通过改变组蛋白组成,以及通过沿DNA驱逐或移位核小体来改变染色质的酶。它们的活性通过调节基因表达和DNA对于复制、转录和DNA修复的可接近性在细胞功能中发挥关键作用[Erdel等人,2011;Brownlee等人,2015]。染色质重塑的失调与人类疾病,尤其是癌症有关[Zhang等人,2016;Valencia&Kadoch,2019]。
[0006]在过去十年中,被称为CHD1L(染色质域解旋酶/ATP酶DNA结合蛋白1样)的染色质重塑剂,也被称为ALC1(在肝癌1中扩增),已成为一种与显著的人类癌症病理相关的癌基因(Ma等人,2008;Cheng等人,2013]。CHD1L还参与多药耐药性,从耐药外排泵(如ABCB1)的上调[Li等人,2019]到PARP1介导的DNA修复[Pines等人,2012;Tsuda等人,2017]和抗细胞凋亡活性[Li等人,2013;Chen等人,2009]。此外,CHD1L的扩增或过表达与患者的不良预后相关,包括低的总体生存率(OS)和转移性疾病[He等人,2015;Hyeon等人,2013;Su等人,2014;Mu等人,2015;Su等人,2015;Li等人,2013;He等人,2012;Chen等人,2010]。CHD1L过表达也与肿瘤进展有关,并可作为患者生存率低的预测因子[Ji等人,2013]。CHD1L的多功能致癌机制使其成为癌症中的一个有吸引力的靶标。虽然CHD1L的癌症驱动机制已在肝癌[Li等人,2019]、乳腺癌[Wu等人,2014]和肺癌[Li等人,2019]中进行了研究,但对结肠直肠癌(CRC)中与CHD1L相关的病理机制知之甚少。
[0007]CRC是每年诊断出的第三大最常见的癌症,CRC患者死亡率居世界第二[Jemal等人,2011]。CRC的早期发现结合手术和基于5

氟尿嘧啶(5FU)的联合化疗对总体生存率的改善微乎其微[Jemal等人,2011;Fakih,2015]。目前的化疗和靶向治疗对转移性CRC(mCRC)基本无效,5年的总体生存率低至11%证明了这一点[Jemal等人,2011;Fakih,2015]。本领域尚未满足识别和表征涉及CRC肿瘤进展和转移的病理学的靶标的需求。
[0008]大多数CRC患者的Wnt信号传导通路发生突变,导致T细胞因子/淋巴增强因子转录或TCF复合体异常[Kinzler&Voelstein,1996;Cancer Genome Atlas,2012]。这种突变可以导致组成型β

连环蛋白的易位和TCF转录的反式激活[Clevers,2006;Korinek等人,1997]。TCF复合体由TCF4(又称TCFL2)调控,其通过与一系列共激活因子(如β

连环蛋白、PARP1和
CREB结合蛋白(CBP))的相互作用而激活[Shitashige等人,2008]。最近,TCF4被证明是腺瘤(即息肉)和晚期mCRC的早期转移的特异性驱动因子[Hyeo等人,2013;Su等人,2014]。
[0009]据报告,TCF转录作为上皮细胞

间充质转化(EMT)的主调节因子发挥作用[S
á
nchez

Till
á
等人,2011;Zhou等人,2016;Abraham等人,2019]。这一过程可以将相对良性的上皮肿瘤细胞转化为间充质细胞,其具有增加的癌干细胞(CSC)干性(stemness)和驱动mCRC的其他恶性特性[Chaffer等人,2016]。最近有报道称,某些CRC驱动基因的改变在原发性和转移性肿瘤对中很常见[Hu等人,2019]。更具体地,据报道,异常的TCF4是mCRC的特异性驱动因子[Hu等人,2019],以及CRC可以在早期腺瘤(即,息肉[另见Magri&Bardelli,2019])中转移,这可能是由TCF驱动的EMT引起[Chaffer等人,2016;Chaffer&Weinberg,2011]。这些报告表明TCF转录是CRC进展和转移的所有阶段的驱动力。
[0010]EMT是许多人类疾病的主要驱动力,特别是实体肿瘤进展、对药物和放射治疗的抗性、免疫应答和免疫治疗的逃避以及转移的促进[Chaffer等人2016;Chaffer&Weinberg,2011;Scheel&Weinberg,2012]。
[0011]由于Wnt信号传导通路和TCF转录在癌症和其他疾病中的重要性[Clevers,2006],已经对抑制Wnt信号传导通路和TCF转录的小分子药物进行了检测[Lee等人,2011;Polakis,2012]。考虑的治疗策略包括受体靶标(例如Frizzled);防止Wnt配体分泌(例如porcupine);抑制β

连环蛋白破坏复合体(例如tankyrases);以及使用β

连环蛋白和共激活剂(如CBP)的蛋白质

蛋白质抑制(PPI)。虽然临床试验可能正在进行中,但尚未有针对Wnt/TCF通路的药物获得临床批准[Lu等人,2016]。相比之下,本专利技术描述了一种新的治疗策略,特别是用于鉴定用于治疗Wnt/TCF驱动的CRC的小分子药物,其中CHD1L被鉴定为调节CRC中的恶性表型的TCF转录所需的DNA结合因子。
[0012]例如,美国专利9616047报道了β

连环蛋白的小分子抑制剂或β

连环蛋白/TCF

4复合体的破坏物,据说其可以减弱结肠癌的发生。其中报道的β

连环蛋白的抑制剂包括七叶亭,以及指定为HI

B1

HI

B20、HI

B22

HI

B

24、HI

B26、HI

B32和HI

B34的化本文档来自技高网
...

【技术保护点】

【技术特征摘要】
【国外来华专利技术】1.一种治疗TCF转录驱动的癌症的方法,其包括向有此需要的患者施用对CHD1L的抑制或对异常TCF转录的抑制有效的量的CHD1L抑制剂。2.根据权利要求1所述的方法,其中,所述CHD1L抑制剂是式I的化合物、盐或溶剂化物:或其盐、或其溶剂化物,其中,B环是具有一个、两个或三个5元或6元环的杂芳环或环体系,其中的任何两个或三个环可以是稠环,其中所述环是碳环、杂环、芳环或杂芳环,并且至少一个所述环是杂芳基;在所述B环中,每个X独立地选自N或CH,且至少一个X是N;R
P
是伯胺或仲胺基团[

N(R2)(R3)]或

(M)
x

P基团,其中P是

N(R2)(R3)或芳基或杂芳基基团,其中x是0或1,表示不存在或存在M,且M是任选取代的连接基团

(CH2)
n



N(R)(CH2)
n

,其中每个n独立地是1

6(包括端值)的整数;Y是选自由

O



S



N(R1)



CON(R1)



N(R1)CO



SO2N(R1)



N(R1)SO2‑
组成的组的二价原子或基团;L1是任选的1至4个碳的连接基团,其任选地被取代,并且是饱和的或包含双键(其可以是顺式或反式),其中x是0或1,表示不存在或存在L1;A环是具有一个、两个或三个环的碳环或杂环或环体系,其中的两个或三个环可以稠合,每个环具有3

10个碳原子和任选的1

6个杂原子,并且其中每个环任选地是饱和的、不饱和的或芳族的;Z是含有至少一个被R

基团取代的氮的二价基团,其中在实施方案中,Z是选自以下的二价基团:

N(R

)



CON(R

)



N(R

)CO



CSN(R

)



N(R

)CS



N(R

)CON(R

)



SO2N(R

)



N(R

)SO2‑


CH(CF3)N(R

)



N(R

)CH(CF3)



N(R

)CH2CON(R

)CH2‑


N(R

)COCH2N(R

)CH2‑
、或所述二价Z基团包含具有至少一个氮环成员的5元或6元杂环,例如,
L2是任选的1至4个碳的连接基团,其任选地被取代,并且是饱和的或包含双键(其可以是顺式或反式),其中z是0或1,表示不存在或存在L1;R选自由氢、脂族基团、碳环基基团、芳基基团、杂环基基团和杂芳基基团组成的组,其中的每个基团任选地被取代;每个R

独立地选自由氢、脂族基团、碳环基基团、芳基基团、杂环基基团和杂芳基基团组成的组,其中的每个基团任选地被取代;R1选自由氢、脂族基团、碳环基基团、芳基基团、杂环基基团和杂芳基基团组成的组,其中的每个基团任选地被取代;R2和R3独立地选自由氢、脂族基团、碳环基基团、芳基基团、杂环基基团和杂芳基基团组成的组,其中的每个基团任选地被取代,或R2和R3与它们所连接的N一起形成任选取代的5

10元杂环,该5

10元杂环为饱和的环、部分不饱和的环、或芳环;R
A
和R
B
分别代表所示A和B环或环体系上的氢或1

10个非氢取代基,其中R
A
和R
B
取代基独立地选自氢、卤素、羟基、氰基、硝基、氨基、单取代或双取代的氨基(

NR
C
R
D
)、烷基、烯基、环烷基、环烯基、芳基、杂环基、烷氧基、酰基、卤代烷基、

COOR
C


OCOR
C


CONR
C
R
D


OCONR
C
R
D


NR
C
COR
D


SR
C


SOR
C


SO2R
C


SO2NR
C
R
D
,其中烷基、烯基、环烷基、环烯基、芳基、杂环基、烷氧基和酰基任选地被取代;每个R
C
和R
D
选自氢、烷基、烯基、环烷基、环烯基、杂环基、芳基或杂芳基,其中的每个基团任选地被一个或多个卤素、烷基、烯基、卤代烷基、烷氧基、芳基、杂芳基、杂环基、芳基取代的烷基、或杂环基取代的烷基取代;以及R
H
是任选取代的芳基或杂芳基基团;其中,任选取代包括用一个或多个卤素、硝基、氰基、氨基、单

或二

C1

C3烷基取代的氨基、C1

C3烷基、C2

C4烯基、C3

C6环烷基、C3

C6

环烯基、C1

C3卤代烷基、C6

C12芳基、C5

C12杂芳基、C3

C12杂环基、C1

C3烷氧基、C1

C6酰基、

COOR
E


OCOR
E


CONR
E
R
F


OCONR
E
R
D


NR
E
COR
F


SR
E


SOR
E


SO2R
E


SO2NR
E
R
F
取代,其中烷基、烯基、环烷基、环烯基、芳基、杂环基、烷氧基和酰基任选地被取代,以及每个R
E
和R
F
选自氢、C1

C3烷基、C2

C4烯基、C3

C6环烷基、C3

C6环烯基、C1

C3卤代烷基、C6

C12芳基、C5

C12杂芳基、C3

C12杂环基、C1

C3烷氧基、C1

C6酰基,其中的每个基团任选地被一个或多个卤素、硝基、氰基、氨基、单

或二

C1

C3烷基取代的氨基、C1

C3烷基、C2

C4烯基、C3

C6环烷基、C3

C6

环烯基、C1

C3卤代烷基、C6

C12芳基、C5

C12杂芳基、C3

C12杂环基、C1

C3烷氧基和C1

C6酰基取代。3.根据权利要求1所述的方法,其中所述CHD1L抑制剂不是PARP抑制剂、拓扑异构酶的抑制剂,也不是β

连环蛋白的抑制剂。
4.根据权利要求1所述的方法,其中所述CHD1L抑制剂是式XX的化合物、盐或溶剂化物:及其盐或其溶剂化物,其中:R
10


NRy

CO

(L2)y

R
12


CO

NRy

(L2)y

R
12
,其中y是0或1,表示不存在或存在L2,L2是任选的1

6个碳原子的连接基团,该连接基团任选地被取代,并且其中所述连接基团的一个或两个碳任选被O、NH、NRy或S替代,其中Ry是氢或1

3个碳的烷基,并且R
12
是芳基基团、环烷基基团、杂环基基团或杂芳基基团,其中的每个任选地被取代;R
N
是氨基部分

N(R2)(R3),其中R2和R3是氢或任选取代的烷基基团,或R2和R3与它们所连接的氮一起形成5

10元杂环,该5

10元杂环是饱和的或部分不饱和的;以及R1、R6‑
R9代表氢或任选的取代基。5.一种预防CHD1L驱动的、EMT驱动的或TCF转录驱动的癌症中的肿瘤生长、侵袭和/或转移的方法,其通过向有此需要的患者施用对CHD1L的抑制或对异常TCF转录的抑制有效的量的CHD1L抑制剂。6.根据权利要求5所述的方法,其中所述CHD1L抑制剂是式I或式XX中任一个的化合物、盐或溶剂化物。7.根据权利要求5所述的方法,其中所述CHD1L抑制剂不是PARP抑制剂、拓扑异构酶的抑制剂,也不是β

连环蛋白的抑制剂。8.一种用于治疗CRC的方法,所述CRC包括mCRC,所述方法包括向有此需要的患者施用对异常TCF转录的抑制有效的量的CHD1L抑制剂。9.根据权利要求8所述的方法,其中所述CHD1L抑制剂是式I或式XX的化合物、盐或溶剂化物。10.根据权利要求8所述的方法,其中所述CHD1L抑制剂不是PARP抑制剂、拓扑异构酶的抑制剂,也不是β

连环蛋白的抑制剂。11.一种治疗耐药性癌症的方法,其包括向有此需要的患者施用对CHD1L的抑制或对异常TCF转录的抑制有效的量的CHD1L抑制剂,并与所述癌症已对其产生抗性的已知治疗联合。12.根据权利要求11所述的方法,其中...

【专利技术属性】
技术研发人员:D
申请(专利权)人:科罗拉多州立大学董事会法人团体
类型:发明
国别省市:

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