TREM组合物及其用途制造技术

本发明专利技术总体上涉及具有非天然存在的修饰的基于tRNA的效应子分子及其相关方法。的基于tRNA的效应子分子及其相关方法。

【技术实现步骤摘要】
【国外来华专利技术】TREM组合物及其用途
[0001]相关申请的交叉引用
[0002]本申请要求2020年4月14日提交的美国临时申请63/009,669的优先权，该申请的全部内容特此通过引用并入。

技术介绍

[0003]转移核糖核酸(tRNA)是复杂的、天然存在的RNA分子，其具有多种功能，包含蛋白质的起始和延伸。

技术实现思路

[0004]本披露的特征在于基于经修饰的tRNA的效应子分子(TREM，例如，TREM或TREM片段)以及相关组合物及其用途。如本文所披露，TREM是可以介导多种细胞过程的复杂分子。本文披露的TREM包含至少一个修饰(例如，非天然存在的修饰)，例如，在组分核苷酸(例如核酶或糖)上或在核苷酸间区域内，例如，TREM主链。在一个方面，本文提供了TREM，其包含式A的序列：[L1]‑
[ASt结构域1]‑
[L2]‑
[DH结构域]‑
[L3]‑
[ACH结构域]‑
[VL结构域]‑
[TH结构域]‑
[L4]‑
[ASt结构域2]，其中[L1]和[VL结构域]是独立地任选的；[L1]、[ASt结构域1]、[L2]‑
[DH结构域]、[L3]、[ACH结构域]、[VL结构域]、[TH结构域]、[L4]、和[ASt结构域2]包含含有非天然存在的修饰的核苷酸。
[0005]在实施例中，TREM：(a)能够：(i)支持蛋白质合成，(ii)被合成酶加载，(iii)被延长因子结合，(iv)将氨基酸引入肽链，(v)支持延长，或(vi)支持起始；(b)包含至少X个没有非天然存在的修饰的连续核苷酸，其中X大于3、4、5、6、7、8、9或10；(c)包含一种类型(例如A、T、C、G或U)的至少3个但少于所有的核苷酸包含相同的非天然存在的修饰；(d)包含一种类型(例如A、T、C、G或U)的至少X个不包含非天然存在的修饰的核苷酸，其中X＝1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29、30、31、32、33、34、35、36、37、38、39、40、41、42、43、44、45、46、47、48、49或50；(e)包含一种类型(例如A、T、C、G或U)的不超过5、10或15个包含非天然存在的修饰的核苷酸；和/或(f)包含一种类型(例如A、T、C、G或U)的不超过5、10或15个不包含非天然存在的修饰的核苷酸。
[0006]在实施例中，TREM包含特征(a)(i)。在实施例中，TREM包含特征(a)(ii)。在实施例中，TREM包含特征(a)(iii)。在实施例中，TREM包含特征(a)(iv)。在实施例中，TREM包含特征(a)(v)。在实施例中，TREM包含特征(a)(vi)。在实施例中，TREM包含特征(b)。在实施例中，TREM包含特征(c)。在实施例中，TREM包含特征(d)。在实施例中，TREM包含特征(e)。在实施例中，TREM包含特征(f)。在实施例中，TREM包含特征(a)
‑
(f)中的所有及其组合。
[0007]在实施例中，包含非天然存在的修饰的TREM结构域具有功能，例如，本文所述的结构域功能。
[0008]在一个方面，本文提供TREM核心片段，其包含式B的序列：
[0009][L1]y
‑
[ASt结构域1]x
‑
[L2]y
‑
[DH结构域]y
‑
[L3]y
‑
[ACH结构域]x
‑
[VL结构域]y
‑
[TH结构域]y
‑
[L4]y
‑
[ASt结构域2]x
，
[0010]其中x＝1并且y＝0或1；并且[ASt结构域1]、[ACH结构域]、和[ASt结构域2]之一包含具有非天然存在的修饰的核苷酸。
[0011]在实施例中，TREM具有支持蛋白质合成的能力。在实施例中，TREM具有能够被合成酶加载的能力。在实施例中，TREM具有被延长因子结合的能力。在实施例中，TREM具有将氨基酸引入肽链的能力。在实施例中，TREM具有支持延长的能力。在实施例中，TREM具有支持起始的能力；
[0012]在实施例中，包含非天然存在的修饰的[ASt结构域1]和/或[ASt结构域2]具有起始或延长多肽链的能力。
[0013]在实施例中，包含非天然存在的修饰的[ACH结构域]具有介导密码子配对的能力。
[0014]在实施例中，对于[L1]、[L2]、[DH结构域]、[L3]、[VL域]、[TH结构域]、[L4]中任一个、二个、三个、四个、五个、六个、全部或组合，y＝1。
[0015]在实施例中，对于[L1]、[L2]、[DH结构域]、[L3]、[VL域]、[TH结构域]、[L4]中任一个、二个、三个、四个、五个、六个、全部或组合，y＝0。
[0016]在实施例中，对于接头[L1]，y＝1，并且L1包含具有非天然存在的修饰的核苷酸。
[0017]在实施例中，对于接头[L2]，y＝1，并且L2包含具有非天然存在的修饰的核苷酸。
[0018]在实施例中，对于接头[DH结构域(DHD)]，y＝1，并且DHD包含具有非天然存在的修饰的核苷酸。在实施例中，包含非天然存在的修饰的DHD具有通过介导识别氨酰基
‑
tRNA合成酶的能力。
[0019]在实施例中，对于接头[L3]，y＝1，并且L3包含具有非天然存在的修饰的核苷酸。
[0020]在实施例中，对于接头[VL结构域(VLD)]，y＝1，并且VLD包含具有非天然存在的修饰的核苷酸。
[0021]在实施例中，对于接头[TH结构域(THD)]，y＝1，并且THD包含具有非天然存在的修饰的核苷酸。在实施例中，包含非天然存在的修饰的THD具有介导识别核糖体的能力。
[0022]在实施例中，对于接头[L4]，y＝1，并且L4包含具有非天然存在的修饰的核苷酸。
[0023]另一方面，本披露提供了包含TREM部分的TREM片段，其中TREM包含式A的序列：
[0024][L1]‑
[ASt结构域1]‑
[L2]‑
[DH结构域]‑
[L3]‑
[ACH结构域]‑
[VL域]‑
[TH结构域]‑
[L4]‑
[ASt结构域2]，并且其中TREM片段包含非天然存在的修饰。
[0025]在实施例中，TREM片段包含以下中的一种、两种、三种或全部或任何组合：(a)一半TREM(例如，来自ACH结构域中的切割，例如，在反密码子序列中的切割，例如，5'一半或3'一半)；(b)5'片段(例如，包含5'末端的片段，例如来自DH结构域或ACH结构域中的切割)；(c)3
’
片段(例如，包含3
’
末端的本文档来自技高网...

【技术保护点】

【技术特征摘要】
【国外来华专利技术】1.一种TREM，其包含式A的序列：[L1]
‑
[ASt结构域1]
‑
[L2]
‑
[DH结构域]
‑
[L3]
‑
[ACH结构域]
‑
[VL结构域]
‑
[TH结构域]
‑
[L4]
‑
[ASt结构域2]，其中：独立地，[L1]和[VL结构域]是任选的；[L1]、[ASt结构域1]、[L2]
‑
[DH结构域]、[L3]、[ACH结构域]、[VL结构域]、[TH结构域]、[L4]和[ASt结构域2]中之一包含具有非天然存在的修饰的核苷酸，并且该非天然存在的修饰存在于核苷酸(例如，经修饰的核苷酸)上与例如本文所述的表15
‑
22的任一行中的经修饰的位置对应的位置处。2.如权利要求1所述的TREM，其中该非天然存在的修饰存在于核苷酸糖的2'
‑
位置上或核苷酸间区域内(例如，主链修饰)。3.如权利要求2所述的TREM，其中该非天然存在的修饰选自2
‑
O
‑
甲基(2
‑
OMe)、2'
‑
卤代(例如2'F或2'Cl)、2'
‑
O
‑
甲氧基乙基(2'MOE)、或2'脱氧修饰。4.如权利要求3所述的TREM，其中该非天然存在的修饰是2'OMe修饰。5.如权利要求3所述的TREM，其中该非天然存在的修饰是2'卤代(例如，2'F或2'Cl)修饰。6.如权利要求3所述的TREM，其中该非天然存在的修饰是2'MOE修饰。7.如权利要求3所述的TREM，其中该非天然存在的修饰是2'
‑
脱氧修饰。8.如权利要求2所述的TREM，其中该非天然存在的修饰存在于该核苷酸间区域中(例如，主链修饰)。9.如权利要求8所述的TREM，其中该非天然存在的修饰是硫代磷酸酯修饰。10.如权利要求2所述的TREM，其中该非天然存在的修饰存在于SEQ ID NO:622的核苷酸1
‑
76、SEQ ID NO:993的核苷酸1
‑
85或SEQ ID NO:1079的核苷酸1
‑
75的任一个上或内。11.如权利要求2所述的TREM，其中该非天然...

【专利技术属性】
技术研发人员：T阿纳斯塔西亚迪斯，DCD巴特勒，N库比卡，Q李，
申请(专利权)人：旗舰先锋创新VI有限责任公司，
类型：发明
国别省市：