长链非编码RNALINC00205在制备诊断或治疗结直肠癌的药物中的应用制造技术

本发明专利技术公开了长链非编码RNA LINC00205在制备诊断或治疗结直肠癌的药物中的应用，属于生物医药技术领域。该长链非编码RNA LINC00205的核苷酸序列如SEQ ID NO:1所示，特别是缺氧诱导高表达的LINC00205，在结直肠癌(CRC)中高表达并与不良的CRC预后相关，其中高表达的LINC00205可促进CRC细胞增殖和肿瘤形成，通过p53的负调控因子BCL6调节尿素循环和多胺合成，其结合miR

【技术实现步骤摘要】
长链非编码RNA LINC00205在制备诊断或治疗结直肠癌的药物中的应用


[0001]本专利技术属于生物医药
，具体涉及长链非编码RNA LINC00205在制备诊断或治疗结直肠癌的药物中的应用。

技术介绍

[0002]结直肠癌(CRC)是最致命的癌症类型之一，具有不同的分子表型和对治疗有很强的耐药性，是一种死亡率非常高的癌症。因此，识别潜在的危险因素、癌症生物标志物和微生物标志物对于CRC的有效治疗具有重要意义。表观遗传修饰与CRC恶性进展有关，包括长链非编码RNA(lncRNAs)解除调控，lncRNAs通过多种生理和病理功能参与癌症，然而lncRNAs 畸变在CRC中的病理生理学机理尚未完全确定。明确lncRNAs的解除调控机理及其下游调控分子机制可促进CRC的诊断和预后，并提供潜在的治疗应用潜力。
[0003]缺氧会促进癌症的形成并导致治疗耐药性，而肿瘤区域通常含氧水平较低(缺氧)，根据对8000多个肿瘤样本的研究，这些缺氧区域会引起促进基因组不稳定或促进远处转移的潜在风险。缺氧诱导因子(HIF)负责调节代谢重编程、先天免疫，如免疫和炎症，以及未折叠蛋白反应(UPR)通路。虽然有报道称缺氧也可以通过调节一些lncRNAs来促进癌症进展，但肿瘤缺氧导致的lncRNA许多分子癌症特征仍有待研究。尿素循环(UC)是一种将含氮代谢物(如氨和谷氨酰胺)分解为尿素的处理机体氮废物的途径。尿素循环失调(UCD)是由UC 酶表达的特异性改变引起的，这是癌症的一种代谢现象。例如，p53抑制尿素的生成和氨的消除，从而抑制肿瘤生长。在正常细胞中，过量的氮被处理为尿素。相比之下，大多数氮被进一步用于癌细胞合成大分子，如嘧啶合成。当p53丢失时，UC加快导致嘧啶合成，从而促进癌症生长。UCD影响癌变、诱变和免疫治疗反应；因此，表征UCD在肿瘤发生中的分子调控对于诊断和治疗至关重要。此外，鸟氨酸脱羧酶1(ODC1)是利用UC中的鸟氨酸进行多胺生物合成的关键酶，在癌症中经常被解除调控，增强的多胺生物合成促进癌症生长。然而，ODC1的过表达及靶向性作用对CRC的作用尚不清楚。

技术实现思路

[0004]本专利技术的第一目的是提供长链非编码RNA作为CRC诊断和预后标志物的应用，所述长链非编码RNA为LINC00205，Ensembl号为ENSG00000223768，首次鉴定并公开其核苷酸序列如SEQ ID NO:1所示，由位于21号染色体的DNA序列编码。
[0005]作为优选，所述LINC00205为缺氧诱导高表达的LINC00205。
[0006]本专利技术的第二目的是提供一种检测长链非编码RNA LINC00205的试剂在制备诊断CRC 的检测试剂中的应用，所述长链非编码RNA LINC00205的核苷酸序列如SEQ ID NO:1所示。
[0007]作为优选，所述长链非编码RNA LINC00205为缺氧诱导高表达的LINC00205。
[0008]本专利技术的第三目的是提供长链非编码RNA LINC00205的抑制剂在制备治疗CRC的
药物中的应用。
[0009]作为优选，所述长链非编码RNA LINC00205的抑制剂为干扰RNA，可以抑制LINC00205 在CRC肿瘤组织中表达。
[0010]作为优选，所述CRC肿瘤组织包括结直肠腺瘤组织和/或CRC癌组织，来源于CRC新发或预后不良的受试者。
[0011]本专利技术首次鉴定Ensembl号为ENSG00000223768的长链非编码RNA LINC00205(以下命名为lncRNA
‑
LVBU)的核苷酸序列如SEQ ID NO:1所示，同时发现缺氧诱导的 lncRNA
‑
LVBU在CRC中高表达，并与不良的CRC癌症预后相关(较差的癌症生存率)；其中高表达的lncRNA
‑
LVBU可以促进CRC细胞增殖和肿瘤形成，通过p53的负调控因子BCL6 调节UC和多胺合成；高表达的lncRNA
‑
LVBU结合miR
‑
10a/34c还可以保护BCL6免受 miR
‑
10a/34c介导的降解，反过来允许BCL6阻断由p53介导参与UC/多胺合成基因(如精氨酸酶1(ARG1)、鸟氨酸转氨基酰酶(OTC)、ODC1)的抑制，证明lncRNA
‑
LVBU可以作为CRC诊断和预后的生物标志物，为制备诊断或治疗CRC的药物提供新的用药途径。
附图说明
[0012]图1是验证lncRNA
‑
LVBU在CRC中高表达并与不良预后密切相关的结果；其中，a： RKO细胞在低氧(1％O2)条件下培养24小时，在指定的时间点收获细胞，分离RNA，通过高通量测序确定lncRNA的表达水平，热图显示的lncRNA在所有时间点与时间0相比，表达变化大于1.5倍，每一行代表一个独立的lncRNA，变化倍数进行log2转换；b：高通量测序结果与GEO数据集(GSE129344和GSE76743)在缺氧条件下上调的lncRNA交集；c： LVBU在正常黏膜和腺瘤组织中的表达水平(GSE41657)，采用不成对学生t检验(数据以均数
±
标准差表示，***p<0.001)；d：LVBU在癌旁正常组织及癌组织中的表达水平(GSE18105)，采用配对学生t检验(数据以均数
±
标准差表示，*p<0.05)；e：基于TCGA数据库中结肠癌组织(COAD)和肝细胞癌组织(HCC)中LVBU表达的Kaplan
‑
Meier总生存(OS)曲线，以中位表达值(COAD)和ROC曲线(HCC)定义高、低表达组，并采用log
‑
rank分析进行显著性检验；f：qRT
‑
PCR检测18对结肠癌和配对正常组织中LVBU的相对mRNA表达水平的瀑布图；g：基于cDNA阵列(不包括粘液癌类型)中COAD LVBU表达的Kaplan
‑
Meier 总生存(OS)曲线，用中位数表达值确定高、低表达组，用log
‑
rank分析进行显著性检验。
[0013]图2是测试HIF
‑
1a结合到LncRNA
‑
LVBU的启动子区促进其转录的结果；其中，a：用 qRT
‑
PCR检测缺氧(1％O2)条件下RKO和HCT116细胞LVBU的表达，Western blot检测缺氧处理后指定时间点HIF
‑
1α的表达(n＝3个独立样本，数据以均数
±
标准偏差表示，**p< 0.01；***p<0.001)；b：在常氧或缺氧条件下，当HIF
‑
1α被敲低时，用qRT
‑
PCR检测LVBU 的表达(n＝3个独立样本，数据以均数
±
标准差表示，**本文档来自技高网...

【技术保护点】

【技术特征摘要】
1.长链非编码RNA作为结直肠癌诊断和预后标志物的应用，所述长链非编码RNA为LINC00205，其核苷酸序列如SEQ ID NO:1所示。2.根据权利要求1所述的应用，其特征在于，所述LINC00205为缺氧诱导高表达的LINC00205。3.一种检测长链非编码RNA LINC00205的试剂在制备诊断结直肠癌的检测试剂中的应用，所述长链非编码RNA LINC00205的核苷酸序列如SEQ ID NO:1所示。4.根据权利要求3所述的应...

【专利技术属性】
技术研发人员：孟祥祺，李孟鸿，
申请(专利权)人：中山大学附属第六医院，
类型：发明
国别省市：