用于细菌和真菌的快速鉴定及表型抗微生物药物敏感性试验的组合物和方法技术

本发明专利技术涉及使用聚合酶链式反应(PCR)作为报告子测定以快速且同时进行细菌鉴定及抗微生物药物敏感性(AST)表型试验的组合物和方法。本发明专利技术使用一种已表现出用于多重复用以及处理多种微生物学样品以进行抗微生物药物敏感性试验的能力的策略。感性试验的能力的策略。感性试验的能力的策略。

【技术实现步骤摘要】
【国外来华专利技术】用于细菌和真菌的快速鉴定及表型抗微生物药物敏感性试验的组合物和方法


[0001]本公开涉及分子诊断领域，并且更特别地涉及鉴定和测定来自生物学样品的细菌的抗微生物药物敏感性。

技术介绍

[0002]迫切需要开发快速简便地检测、鉴定和测定临床样品中细菌性病原体的抗微生物药物敏感性的方法，以指导传染病的诊断和治疗。这一需求的一个很好的示例是在血液感染(BSI)领域。BSI位居北美和欧洲七大死因之列，据估计，美国每年发生170万例败血症事件，导致每年270,000人死亡并且每年美国医疗保健费用支出140亿美元。已证明，缩短导向抗微生物治疗的时间改善了败血症患者的发病率和死亡率，从而缩短了住院时间(LOS)并且降低了住院费用。更快获得敏感性结果还将使抗微生物药物降阶梯更迅速，从而减少不良反应并且减少对耐药性的贡献。因此，仍然需要开发一种测定和试验系统，以在BSI中提供快速的表型抗微生物药物敏感性结果，使临床医生能够更快速地提供最合适的抗微生物疗法，从而改善患者预后。
[0003]多微生物血流感染(BSI)被定义为存在至少两种从血培养物中发现的不同本文档来自技高网...

【技术保护点】

【技术特征摘要】
【国外来华专利技术】1.一种方法，其包括在存在至少一种浓度的至少一种抗微生物药物或抗微生物药物类别的情况下执行单次定量实时PCR测定作为报告子，以同时鉴定和确定对至少一种抗微生物药物或一种抗微生物药物类别具有相似或相同的临床折点的细菌或真菌目标群的抗微生物药物敏感性。2.根据权利要求1所述的方法，其中对所述细菌或真菌目标群的鉴定通过检测对所述细菌或真菌目标群具有特异性的信号来进行。3.根据权利要求2所述的方法，其中特异性信号通过使用引物和探针寡核苷酸来检测，与非来自所述细菌或真菌目标群的靶基因相比，所述引物和探针寡核苷酸以更高的选择性与来自所述细菌或真菌目标群的所述靶基因杂交。4.根据权利要求3所述的方法，其中所述靶基因选自rplP、ompA、tuf、rpoB、ddl、ddlA、fdnG、sodA、gyrB、O
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抗原乙酰基转移酶、ecfX、tusA、CPE、sip和nuc。5.根据权利要求1至4中任一项所述的方法，其中所述细菌或真菌目标群包括分类目。6.根据权利要求5所述的方法，其中所述分类目为肠杆菌目。7.根据权利要求1至4中任一项所述的方法，其中所述细菌或真菌目标群代表分类科。8.根据权利要求7所述的方法，其中所述分类科选自肠杆菌科、耶尔森氏菌科、摩根氏菌科或所述科的组合。9.根据权利要求1至4中任一项所述的方法，其中所述细菌或真菌目标群包括分类属。10.根据权利要求9所述的方法，其中所述分类属选自肠球菌属、念珠菌属、假单胞菌属、不动杆菌属、葡萄球菌属、寡养单胞菌属、链球菌属和埃希氏菌属、克雷伯氏菌属、肠杆菌属、沙门氏菌属、柠檬酸杆菌属、沙雷氏菌属、志贺氏菌属、棒杆菌属、微球菌属、芽孢杆菌属、嗜血杆菌属、丙酸杆菌属、拟杆菌属、梭菌属、消化链球菌属、梭杆菌属、巴氏杆菌属、乳杆菌属、气球菌属、普雷沃氏菌属、伯克氏菌属、莫拉氏菌属、弧菌属、李斯特氏菌属、邻单胞菌属、耶尔森氏菌属、摩根氏菌属、普罗维登斯菌属或变形杆菌属。11.根据权利要求1至4中任一项所述的方法，其中所述细菌或真菌目标群代表分类种。12.根据权利要求11所述的方法，其中所述分类种选自粪肠球菌、屎肠球菌、大肠杆菌、肺炎克雷伯氏菌、产酸克雷伯氏菌、阴沟肠杆菌、产气肠杆菌、弗氏柠檬酸杆菌、柯氏柠檬酸杆菌、摩氏摩根氏菌、斯氏普罗维登斯菌、奇异变形杆菌、普通变形杆菌、白色念珠菌、耳念珠菌、铜绿假单胞菌、鲍氏不动杆菌、皮氏不动杆菌、医院不动杆菌、流感嗜血杆菌、单核细胞增多性李斯特氏菌、金黄色葡萄球菌、路邓葡萄球菌、表皮葡萄球菌、嗜麦芽糖寡养单胞菌、肺炎链球菌、无乳链球菌、或酿脓链球菌、类志贺邻单胞菌、副溶血弧菌、创伤弧菌、霍乱弧菌。13.根据权利要求1至12中任一项所述的方法，其进一步包括选自以下的步骤：
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使用额外的引物和探针寡核苷酸来验证对所述细菌或真菌目标群的鉴定，与非来自所述细菌或真菌目标群的第二靶基因相比，所述额外的引物和探针寡核苷酸以更高的选择性与来自所述细菌或真菌目标群的所述第二靶基因杂交；或
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确定抗微生物药物敏感性表型或者毒素或毒力表型的机制；或验证和确定步骤两者。14.根据权利要求1至13中任一项所述的方法，其进一步包括同时鉴定和确定多于一个细菌或真菌目标群的抗微生物药物敏感性，其中每个细菌或真菌目标群对至少一种抗微生物药物或一种抗微生物药物类别具有相似或相同的临床折点。
15.根据权利要求1至14中任一项所述的方法，其中所述细菌或真菌目标群存在于血流感染(BSI)、胃肠道感染、呼吸道感染、泌尿系统感染、鼻感染、直肠感染或伤口感染中。16.根据权利要求6所述的方法，其中所述靶基因选自rplP、gyrB和rpoB。17.根据权利要求6所述的方法，其中与不属于肠杆菌目分类目的所述靶基因相比，以更高的选择性与属于所述肠杆菌目分类目的所述靶基因杂交的所述引物和探针寡核苷酸包含含有SEQ ID NO：1至SEQID NO：16的核苷酸序列。18.根据权利要求17所述的方法，其中与非肠杆菌目中的gyrB相比，以更高的...

【专利技术属性】
技术研发人员：P，
申请(专利权)人：豪夫迈，
类型：发明
国别省市：