本发明专利技术公开了一种用于检测早期结直肠癌的血浆游离DNA甲基化生物标记物或其组合物、应用及试剂盒，属于生物检测技术领域。甲基化生物标记物包括cg19419054，cg10566012，cg02088996，cg05413061，cg10514097，cg10406295，cg21517947，cg20675505，cg18412834，cg03734437中的一种或多种组合物。通过联合检测多个结直肠癌相关并且特异的甲基化标记物或其组合物来预测早期结直肠癌，提高了检出率。标记物与年龄及血浆游离DNA浓度结合所训练出的模型在区分良性肠病(息肉)和早期结直肠癌的血浆样本时的预测AUC值可达0.936，具有应用价值。DNA甲基化标记物实为上述位点上下游50bp大小的基因区域并通过计算整个区域的平均甲基化值来增强预测模型的稳定性。定性。定性。
【技术实现步骤摘要】
用于检测早期结直肠癌的血浆游离DNA甲基化生物标记物或其组合物、应用及试剂盒
[0001]本专利技术属于生物检测
，具体涉及一种用于检测早期结直肠癌的血浆游离DNA甲基化生物标记物或其组合物、应用及试剂盒。
技术介绍
[0002][0003]众所周知的是，癌症的早发现早治疗可以极大的提高患者的成活率。I期结直肠癌的死亡率约为10％，而IV期结直肠癌的死亡率可以达到75
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80％。当前结直肠癌早筛的手段有粪便检测，内镜检测，影像学检测和血液检测等几种，然而粪便检测和血液检测存在着灵敏度低的缺点，结肠镜可以检测出远端结肠的癌性病变，整体减低68％
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88％的癌症死亡率，但是对于近端结肠癌性病变没有明显提高，且患者依从性较差。影像学检测可以检测出直径>＝1cm的腺瘤，但是对于更早期的病变灵敏度较低，而且存在辐射，可能诱发癌性病变。因此开发出一种新的便捷的早期癌症筛查方法对于个人，对于社会都有非常重要的意义。
[0004]相关技术公开了一种人血液中与结直肠癌诊断相关的甲基化生物标记物，该方案中公开了其为了使用液体活检进而选择了血液作为样本进行检测的方法。该方案具体实施方式中显示了其对照组使用的是健康人群，由于健康人群与结直肠癌人群差异很大，因而会导致其结果显示出的结直肠癌预测性能偏高。然而，仅通过对比健康人群和结直肠癌人群无法将良性肠病人群和结直肠癌人群区分开来，进而会导致良性肠病人群的过度检测并对其造成不必要的焦虑以及经济损失。本专利技术则通过直接对比良性肠病样本以及结直肠癌样本来进行标记物的筛选和模型的构建，可以更精准的检测结直肠癌的发生并尽可能减少非癌症人群的过度检测。
[0005]DNA甲基化与肿瘤的发生及紧密相关，在肿瘤细胞普遍着DNA甲基化状态的改变，特点是总体甲基化水平降低和局部甲基化水平的升高。而且对于早期肿瘤的发生，甲基化的修饰也起着至关重要的作用。同时相对于其他血液肿瘤标记物来说，血液cfDNA甲基化稳定性更好，可以被稳定检出。因此，检测特定位点血液cfDNA甲基化，可以用于推测身体内结直肠是否存在癌变，从而实现对结直肠癌早筛早诊的目标。
技术实现思路
[0006]为了解决现有技术存在的所检测的甲基化标记物繁多不具有特异性、选取 marker不准确、试剂盒检测结果准确性和稳定性较差的技术问题，本专利技术目的在于提供一种用于检测早期结直肠癌的血浆游离DNA甲基化生物标记物或其组合物、应用及试剂盒。
[0007]本专利技术所采用的技术方案为：一种用于检测早期结直肠癌的血浆游离DNA 甲基化生物标记物或其组合物，所述甲基化生物标记物包括人类基因组中的 cg19419054，cg10566012，cg02088996，cg05413061，cg10514097，cg10406295， cg21517947，
cg20675505，cg18412834，cg03734437中的一种或者多种的组合物；
[0008]其中，所述cg19419054，cg10566012，cg02088996和cg05413061中的一种或者多种的组合物，为结直肠癌甲基化发生下降时的甲基化生物标记物或其组合物；
[0009]所述cg10514097，cg10406295，cg21517947，cg20675505，cg18412834和 cg03734437中的一种或者多种的组合物，为结直肠癌甲基化发生上升时的甲基化生物标记物或其组合物。
[0010]作为优选地，所述cg19419054的DNA甲基化标记物是指人类基因组中 chr6:39779523
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39779573之间的CpG位点；
[0011]作为优选地，所述cg10566012的DNA甲基化标记物是指人类基因组中 chr13:40121121
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40121171之间的CpG位点；
[0012]作为优选地，所述cg02088996的DNA甲基化标记物是指人类基因组中 chr7:41817746
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41817796之间的CpG位点；
[0013]作为优选地，所述cg05413061的DNA甲基化标记物是指人类基因组中 chr3:16225282
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16225332之间的CpG位点。
[0014]作为优选地，所述cg10514097的DNA甲基化标记物是指人类基因组中 chr16:86544762
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86544812之间的CpG位点；
[0015]作为优选地，所述cg10406295的DNA甲基化标记物是指人类基因组中 chr8:41167088
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41167138之间的CpG位点。
[0016]作为优选地，所述cg21517947的DNA甲基化标记物是指人类基因组中 chr8:41167082
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41167132之间的CpG位点；
[0017]作为优选地，所述cg20675505的DNA甲基化标记物是指人类基因组中 chr8:72756787
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72756837之间的CpG位点。
[0018]作为优选地，所述cg18412834的DNA甲基化标记物是指人类基因组中 chr20:61885266
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61885316之间的CpG位点；
[0019]作为优选地，所述cg03734437的DNA甲基化标记物是指人类基因组中 chr8:97173501
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97173551之间的CpG位点。
[0020]作为优选地，所述人类基因组为hg19人类基因组。
[0021]一种用于检测早期结直肠癌的血浆游离DNA甲基化生物标记物或其组合物的应用，所述甲基化生物标记物或其组合物用于结合年龄和血浆cfDNA浓度进行检测。
[0022]一种用于检测早期结直肠癌发生的试剂盒，所述试剂盒包括甲基化生物标记物或其组合物；
[0023]以及还包括甲基化生物标记物或其组合物的探针。
[0024]作为优选地，所述探针用于杂交捕获含有所述甲基化生物标记物或其组合物的DNA序列片段。
[0025]本专利技术的有益效果为：
[0026](一)本专利技术提供了一种用于检测早期结直肠癌的血浆游离DNA甲基化生物标记物或其组合物，所述甲基化生物标记物包括cg19419054，cg10566012， cg02088996，cg05413061，cg10514097，cg10406295，cg21517947，cg20675505， cg18412834，cg03734437中的一种或者多种的组合物。
[0027]其中cg19419054，cg10566012，cg02088996和cg05413061中的一种或者多种的组合物，为结直肠癌甲基化发生下降时的甲基化生物标记物或其组合物，用于总体甲基化水平降低时的检测，具有检测特异性和专一性。
[002本文档来自技高网...
【技术保护点】
【技术特征摘要】
1.一种用于检测早期结直肠癌的血浆游离DNA甲基化生物标记物或其组合物，其特征在于，所述甲基化生物标记物包括人类基因组中的cg19419054，cg10566012，cg02088996，cg05413061，cg10514097，cg10406295，cg21517947，cg20675505，cg18412834，cg03734437中的一种或者多种的组合物；其中，所述cg19419054，cg10566012，cg02088996和cg05413061中的一种或者多种的组合物，为结直肠癌甲基化发生下降时的甲基化生物标记物或其组合物；所述cg10514097，cg10406295，cg21517947，cg20675505，cg18412834和cg03734437中的一种或者多种的组合物，为结直肠癌甲基化发生上升时的甲基化生物标记物或其组合物。2.根据权利要求1所述的用于检测早期结直肠癌的血浆游离DNA甲基化生物标记物或其组合物，其特征在于，所述cg19419054的DNA甲基化标记物是指人类基因组中chr6:39779523
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39779573之间的CpG位点；优选为，所述cg10566012的DNA甲基化标记物是指人类基因组中chr13:40121121
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40121171之间的CpG位点；优选为，所述cg02088996的DNA甲基化标记物是指人类基因组中chr7:41817746
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41817796之间的CpG位点；优选为，所述cg05413061的DNA甲基化标记物是指人类基因组中chr3:16225282
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16225332之间的CpG位点。3.根据权利要求1所述的用于检测早期结直肠癌的血浆游离DNA甲基化生物标记物或其组合物，其特征在于，所述cg10514097的DNA甲基化标记物是指人类基因组中chr16:86544762
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86544812之间的CpG位点；优...
【专利技术属性】
技术研发人员：赫捷，刘骞，高亦博，李典格，丁盟，
申请(专利权)人：北京莱盟君泰国际医疗技术开发有限公司，
类型：发明
国别省市：
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