一种表达CD38靶向抑制因子的多能干细胞及其衍生物与应用制造技术

本发明专利技术公开了一种表达CD38靶向抑制因子的多能干细胞及其衍生物与应用。该多能干细胞或其衍生物的基因组中导入CD38抑制因子的表达序列，所述CD38抑制因子为靶向CD38的shRNA和/或shRNA

【技术实现步骤摘要】
一种表达CD38靶向抑制因子的多能干细胞及其衍生物与应用


[0001]本专利技术属于基因工程
，具体涉及一种表达CD38靶向抑制因子的多能干细胞及其衍生物与应用。

技术介绍

[0002]CD38是45kD的II型跨膜糖蛋白，也是一种双功能胞外酶。CD38分子在多发性骨髓瘤(multiple myeloma，MM)细胞表面呈现一致性的高表达，而在其他淋巴细胞或者髓系细胞上则呈现低表达，而且，CD38分子也可以同时在部分非血液细胞上表达。CD38还具有细胞粘附作用，因此，通过靶向CD38来治疗MM，并以此为基础开发单抗、抗体偶联药物、双特异性抗体、CAR
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T等疗法都具有重要意义。现有研究显示，通过靶向CD38分子可以有效杀伤骨髓瘤细胞，而靶向CD38的抗体Daratumumab已被FDA批准用于多发骨髓瘤的治疗，但现有的治疗方法都不可避免的会导致白细胞减少从而产生比较严重的不良反应，因此，靶向CD38的抗体实际应用受到了极大的限制了。
[0003]外泌体是指直径在40
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100nm的盘状囊泡。多种细胞在正常及病理状态下均可分泌外泌体。其主要来源于细胞内内溶酶体微粒内陷形成的多囊泡体，经多囊泡体外膜与细胞膜融合后释放到胞外基质中。当其由宿主细胞被分泌到受体细胞中时，外泌体可通过其携带的蛋白质、核酸、脂类等来调节受体细胞的生物学活性。目前已经尝试用外泌体携带siRNA、化学小分子药物等进行基因治疗和肿瘤治疗等研究。
[0004]另一方面，在细胞治疗领域，同种异体的免疫兼容问题依然是一大难题。近年已有许多报道通过敲除B2M、CIITA等基因，实现HLA
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I和HLA
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II细胞表面或本身基因的缺失表达，进而使细胞具备免疫耐受或逃逸T/B细胞特异性免疫应答，产生免疫兼容的通用型PSCs，为更广泛的通用型PSCs源细胞、组织、器官应用奠定了重要的基础。也有报道细胞过表达CTLA4
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Ig、PD
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L1从而抑制同种异的免疫排斥。然而，这些方案要么免疫兼容不彻底，仍有通过其他途径发生同种异体的免疫排斥；要么彻底消除同种异体免疫排斥应答，但使供体源移植物的细胞本身同时丧失了抗原提呈的能力，这给受体带来了极大的致瘤性和病毒感染等疾病的风险。
[0005]为此，也有报道，不直接敲除B2M，而敲除HLA
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A、HLA
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B或一并敲除CIITA的同时，保留HLA
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C，并构建12个覆盖人群超过90％的HLA
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C免疫配型抗原，以此达到移植物的细胞仍具备一定程度的抗原提呈功能，并且同时能够通过HLA
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C抑制NK细胞的固有免疫应答。但这类细胞，一来，HLA
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I类抗原提呈的抗原类型缩小了三分之二以上，能够提呈的抗原完整性极大地不可逆的缩小，对于各种肿瘤、病毒以及其他疾病抗原的提呈具有极大的偏向性，仍然保留了相当程度的致瘤和病毒感染等疾病的风险，在CIITA同时敲除的情况下其致病风险更高；二来，12种高频率免疫配型的HLA
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C抗原种族差异很大，通过我们核实计算部分地区仅能占到70％的比例，而中国、印度等人口大国目前尚未有权威的大样本量的HLA数据展示，这样制备出来的通用型PSCs使用仍受到巨大的配型空缺考验；第三，这种方法会经历数次反复的基因编辑工作，按每次基因编辑至少两轮单细胞分离培养计，整个过程至少需要
六轮以上的单细胞分离培养，这些流程不可避免且极大概率地因多次基因编辑脱靶或染色质不稳定或因大量单细胞传代增殖造成细胞各种不可预测的突变，进而诱发致癌、代谢疾病等各种问题。由此可见，这类免疫兼容方案亦为“过渡时期”的权宜之计，仍有许多问题没有更好的解决。
[0006]此外，还有人设计通过诱导自杀基因在供体组织、细胞致病后诱导杀死，这样做的后果将产生严重的组织坏死、细胞因子风暴等不可预知的疾病风险问题，并且这类设计的细胞杀死后将不复存在合适的供体细胞、组织和器官又是一大难题。

技术实现思路

[0007]本专利技术的目的在于提供一种多能干细胞或其衍生物。
[0008]本专利技术的另一目的在于提供上述多能干细胞或其衍生物及其分泌的外泌体在制备抗肿瘤治疗制剂或药物中的应用。
[0009]本专利技术的另一目的在于提供一种外泌体。
[0010]本专利技术所采取的技术方案是：
[0011]本专利技术的第一个方面，提供：
[0012]一种多能干细胞或其衍生物，该多能干细胞或其衍生物的基因组导入有CD38抑制因子的表达序列；该CD38抑制因子为靶向CD38的shRNA和shRNA
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miR中的至少一种。
[0013]进一步地，上述靶向CD38的shRNA和shRNA
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miR的序列如SEQ ID NO.1所示。
[0014]本专利技术的第二个方面，提供：
[0015]一种多能干细胞或其衍生物，该多能干细胞或其衍生物的基因组导入有CD38抑制因子的表达序列；该CD38抑制因子为靶向CD38的shRNA和shRNA
‑
miR中的至少一种。
[0016]上述多能干细胞或其衍生物基因组的B2M基因和/或CIITA基因被敲除。
[0017]当B2M和CIITA基因被敲除后，其完全消除HLA
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I和HLA
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II类分子产生的影响，因此，其肿瘤治疗效果最佳。
[0018]本专利技术的第三个方面，提供：
[0019]一种多能干细胞或其衍生物，该多能干细胞或其衍生物的基因组导入有CD38抑制因子的表达序列；该CD38抑制因子为靶向CD38的shRNA和shRNA
‑
miR中的至少一种。
[0020]上述多能干细胞或其衍生物的基因组中导入有第一核酸分子；且，上述多能干细胞或其衍生物中的免疫应答相关基因的3
’
UTR区域导入有第二核酸分子；上述第一核酸分子编码介导RNA干扰的小核酸分子，上述小核酸分子特异性靶向第二核酸分子的转录产物，且上述小核酸分子不靶向所述多能干细胞或其衍生物的任何其他的mRNA或lncRNA。
[0021]本技术方案中，所述第一核酸分子编码的小核酸分子能够与免疫应答相关基因3
’
UTR区域导入的第二核酸分子的转录产物特异性结合，从而启动RNA干扰程序，将免疫应答相关基因的mRNA降解或沉默，从而阻断免疫应答相关基因的表达，进而使得此类细胞具有免疫兼容的特性，可以消除或者降低同种异体免疫排斥应答反应。而且，该RNA干扰程序只作用于此类被改造过的多能干细胞或其衍生物，因此，当此类细胞或衍生物被移植到受体中时，由第一核酸分子编码的小核酸分子与免疫应答相关基因的3
’
UTR处导入的第二核酸分子所介导的免疫应答相关基因的RNA干扰，只作用于供体细胞，而不会对受体的细胞的基因本文档来自技高网...

【技术保护点】

【技术特征摘要】
1.一种多能干细胞或其衍生物，其特征在于，所述多能干细胞或其衍生物的基因组中导入有CD38抑制因子的表达序列；所述CD38抑制因子为靶向CD38的shRNA和shRNA
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miR中的至少一种。2.根据权利要求1所述的多能干细胞或其衍生物，其特征在于，所述靶向CD38的shRNA和shRNA
‑
miR的序列如SEQ ID NO.1所示。3.根据权利要求1所述的多能干细胞或其衍生物，其特征在于，所述多能干细胞或其衍生物基因组的B2M基因和/或CIITA基因被敲除。4.根据权利要求1所述的多能干细胞或其衍生物，其特征在于：所述多能干细胞或其衍生物的基因组中还导入有第一核酸分子；且，所述多能干细胞或其衍生物中的免疫应答相关基因的3
’
UTR区域还导入有第二核酸分子；所述第一核酸分子编码介导RNA干扰的小核酸分子，所述小核酸分子特异性靶向第二核酸分子的转录产物，且所述小核酸分子不靶向所述多能干细胞或其衍生物的任何其他的mRNA或lncRNA。5.根据权利要求4所述的多能干细胞或其衍生物，其特征在于，所述小核酸分子包括短干扰核酸、短干扰RNA、双链RNA，优选为miRNA、shRNA、shRNA
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miR中的至少一种。6.根据权利5所述的多能干细胞或其衍生物，其特征在于，所述多能干细胞或其衍生物来源于人类；所述小核酸分子的序列为来源于不靶向人类任何mRNA或lncRNA的非人类物种的随机序列。7.根据权利要求4所述的多能干细胞或其衍生物，其特征在于，所述第二核酸分子包括至少3个重复的小核酸分子序列的反向互补序列，优选为6～10个重复的小核酸分子序列的反向互补序列。8.根据权利要求1所述的多能干细胞或其衍生物，其特征在于，所述多能干细胞或其衍生物的基因组中还导入至少一种免疫兼容分子的表达序列，所述免疫兼容分子用于调控多能干细胞细胞或其衍生物中与免疫应答相关的基因的表达。9.根据权利要求4或8所述的多能干细胞或其衍生物，其特征在于，所述与免疫应答相关的基因包括：(1)主要组织相容性复合体基因，包括HLA
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A、HLA
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B、HLA
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C、HLA
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DRA、HLA
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DRB1、HLA
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DRB3、HLA
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DRB4、HLA
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DRB5、HLA
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DQA1、HLA
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DQB1、HLA
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DPA1和HLA
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DPB1中的至少一种；(2)主要组织相容性复合体相关基因，包括B2M和CIITA中的至少一种。10.根据权利要求8所述的多能干细胞或其衍生物，其特征在于，所述免疫兼容分子包括以下的至少一种：(1)免疫耐受相关基因，包括CD47和HLA
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G中的至少一种；(2)HLA
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C类分子，包括人群中比例合计超过90％的HLA
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C复等位基因，或者超过90％的HLA
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C复等位基因与B2M构成的融合蛋白基因；(3)靶向主要组织相容性复合体基因的shRNA和/或shRNA
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miR，所述主要组织相容性复合体基因包括HLA
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A、HLA
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B、HLA
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C、HLA
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DRA、HLA
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DRB1、HLA
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DRB3、HLA
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DRB4、HLA
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DRB5、HLA
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DQA1、HLA
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DQB1、HLA
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DPA1和HLA
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DPB1中的至少一种；(4)靶向主要组织相容性复合体相关基因的shRNA和/或shRNA
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miR，所述主要组织相容
性复合体相关基因包括B2M和CIITA中的至少一种。11.根据权利要求10所述的多能干细胞或其衍生物，其特征在于：靶向B2M的shRNA和/或shRNA
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miR的靶序列选自SEQ ID NO.9～SEQ ID NO.11中的一种；靶向CIITA的shRNA和/或shRNA
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miR的靶序列选自SEQ ID NO.12～SEQ ID NO.14中的一种；靶向HLA
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A的shRNA和/或shRNA
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miR的靶序列选自SEQ ID NO.15～SEQ ID NO.17中的一种；靶向HLA
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B的shRNA和/或shRNA
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miR的靶序列选自SEQ ID NO.18～SEQ ID NO.20中的一种；靶向HLA
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C的shRNA和/或shRNA
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miR的靶序列选自SEQ ID NO.21～SEQ ID NO.23中的一种；靶向HLA
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DRA的shRNA和/或shRNA
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miR的靶序列选自SEQ ID NO.24～SEQ ID NO.26中的一种；靶向HLA
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DRB1的shRNA和/或shRNA
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miR的靶序列选自SEQ ID NO.27～SEQ ID NO.29中的一种；靶向HLA
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DRB3的shRNA和/或shRNA
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miR的靶序列选自SEQ ID NO.30～SEQ ID NO.31中的一种；靶向HLA
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DRB4的shRNA和/...

【专利技术属性】
技术研发人员：王淋立，陈月花，杨建国，莫健，
申请(专利权)人：王淋立，
类型：发明
国别省市：