本发明专利技术公开了影响罗氏沼虾生长性状的SNP标记，SNP标记包括UGP2(UTP
【技术实现步骤摘要】
影响罗氏沼虾生长性状的SNP标记及其应用
[0001]本专利技术涉及生物学相关
更具体地说，本专利技术涉及2个影响罗氏沼虾生长性状SNP标记及其应用。
技术介绍
[0002]罗氏沼虾(Macrobruchium rosenbergii)人称“淡水虾王”，在我国淡水养殖业中占据重要的地位。据《2021中国渔业统计年鉴》数据显示，2020年中国罗氏沼虾淡水养殖产量为16.19万吨，较2019年增长了15.96％，涨幅位居四大淡水品种之首。因其具有类似于海虾的鲜嫩口感和味道，以及美如蟹黄般的生殖腺，深受广大消费者欢迎。但近来年出现了种质退化、“铁虾”现象频发，使罗氏沼虾产业面临极大地挑战，严重制约了罗氏沼虾的可持续发展。
[0003]分子标记辅助育种在水生生物中得到了广泛的应用，因此挖掘影响罗氏沼虾生长性状的分子标记，建立分子标记辅助育种技术，有效地将常规育种与分子育种结合起来，可对生长性状进行遗传改良，培育罗氏沼虾新品种(系)，进而从根本上解决罗氏沼虾种质退化的难题，推动我国罗氏沼虾产业发展。
技术实现思路
[0004]本专利技术的一个目的是提供影响罗氏沼虾生长性状的SNP标记及其应用，可利用该SNP标记进行罗氏沼虾的分子标记辅助育种。
[0005]为了实现本专利技术的这些目的和其它优点，根据本专利技术的一个方面，本专利技术提供了SNP标记，SNP标记包括UGP2基因上的c.3693A>G位点和c.3672T>C位点。
[0006]进一步地，所述SNP标记与罗氏沼虾的体重、体长、头胸甲宽、头胸甲长、腹节长、第三腹节宽相关。
[0007]根据本专利技术的另一个方面，还提供了引物对，引物对用于检测所述的SNP标记；用于检测c.3693A>G位点的所述引物对具有SEQIDNO:1～2所示的核苷酸序列；用于检测c.3672T>C位点的所述引物对具有SEQIDNO:3～4所示的核苷酸序列。
[0008]根据本专利技术的另一个方面，还提供了用于检测SNP标记的试剂盒，包括所述的引物对。
[0009]根据本专利技术的另一个方面，还提供了SNP标记的用途，用于筛选不同生长性状的罗氏沼虾。
[0010]根据本专利技术的另一个方面，还提供了SNP标记的用途，用于罗氏沼虾的分子标记辅助育种。
[0011]本专利技术至少包括以下有益效果：
[0012]本专利技术提供了UGP2基因上的c.3693A>G位点和c.3672T>C位点，该两个位点与罗氏沼虾的体重、体长、头胸甲宽、头胸甲长、腹节长、第三腹节宽相关，使得该两个位点可以为筛选、培育罗氏沼虾新品种(系)提供参考。
[0013]本专利技术的其它优点、目标和特征将部分通过下面的说明体现，部分还将通过对本专利技术的研究和实践而为本领域的技术人员所理解。
具体实施方式
[0014]下面结合实施例对本专利技术做进一步的详细说明，以令本领域技术人员参照说明书文字能够据以实施。
[0015]应当理解，本文所使用的诸如“具有”、“包含”以及“包括”术语并不排除一个或多个其它元件或其组合的存在或添加。
[0016]本申请的实施例提供了SNP标记，SNP标记包括UGP2(UTP
‑
glucose
‑1‑
phosphate uridylyltransferase2)基因上的c.3693A>G位点和c.3672T>C位点；A>G和T>C表示碱基的转换。
[0017]在另一些实施例中，所述SNP标记与罗氏沼虾的体重、体长、头胸甲宽、头胸甲长、腹节长、第三腹节宽相关；具体而言，c.3693A>G与罗氏沼虾的体重、体长、头胸甲宽、头胸甲长、腹节长极显著关联(P<0.01)，与第三腹节宽未达到显著关联水平。位点c.3672T>C与罗氏沼虾的体重、体长、头胸甲宽、头胸甲长、腹节长极显著关联(P<0.01)，与第三腹节宽达显著关联水平(P<0.05)。。
[0018]本申请的实施例还提供了引物对，引物对用于检测所述的SNP标记；
[0019]用于检测c.3693A>G位点的所述引物对具有SEQIDNO:1～2所示的核苷酸序列，具体为F:CATCGGTCATTTCAGCAGCA；R:TCAGTGCCTCATCTAATTTTCCA；
[0020]用于检测c.3672T>C位点的所述引物对具有SEQIDNO:3～4所示的核苷酸序列，具体为F:CAGCTCACACCACCTGTCAT；R:ACTTGTAAGGTCAAGTGGAGAAAC。
[0021]本申请的实施例还提供了用于检测SNP标记的试剂盒，包括所述的引物对，上一实施例的引物对和其它化学试剂组成试剂盒，用于检测SNP标记，其它化学试剂可以是Taq酶、Big
‑
dye测序反应试剂盒等。
[0022]本申请的实施例还提供了SNP标记的用途，用于筛选不同生长速度的罗氏沼虾，根据SNP标记的检测结果，筛选出生长速度快的罗氏沼虾；
[0023]本申请的实施例还提供了SNP标记的用途，用于罗氏沼虾的育种；根据筛选出的生长速度不同的罗氏沼虾进行各类基因型的罗氏沼虾培育；可进行优势基因型(c.3693A>G的AA型和c.3672T>C的TT型)个体的筛选，进行罗氏沼虾的分子标记辅助育种，实现生长性状的遗传改良，对培育高产罗氏沼虾新品种(系)具有广阔的应用价值。
[0024]以下以一个具体实施例说明。
[0025]1试验材料
[0026]1.1遗传效应分析所用试验动物
[0027]本实施例以不同生长速度家系的250尾虾为试验群体，进行SNP标记的遗传效应分析，见表1～2。采集其肌肉组织于
‑
20℃低温保存，用于提取基因组DNA。
[0028]表1用于关联分析的5个不同家系间罗氏沼虾的体重比较
[0029]家系样本量(尾)变异范围均值(g
±
SEM)19354.18
‑
15.569.04
±
0.31
a
18405.27
‑
13.438.55
±
0.26
a
06504.50
‑
15.507.91
±
0.40
bc
15453.17
‑
11.136.39
±
0.23
e
09803.23
‑
14.006.32
±
0.27
ef
[0030]表2用于关联分析的5个不同家系间罗氏沼虾的体长比较
[0031]家系样本量(尾)变异范围均值(cm<本文档来自技高网...
【技术保护点】
【技术特征摘要】
1.SNP标记，其特征在于，SNP标记包括UGP2基因上的c.3693A>G位点和c.3672T>C位点。2.如权利要求1所述的SNP标记，其特征在于，所述SNP标记与罗氏沼虾的体重、体长、头胸甲宽、头胸甲长、腹节长、第三腹节宽相关。3.引物对，其特征在于，引物对用于检测权利要求1或2所述的SNP标记；用于检测c.3693A>G位点的所述引物对具有...
【专利技术属性】
技术研发人员：姜建萍，
申请(专利权)人：广西壮族自治区药用植物园，
类型：发明
国别省市：
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