一种酒精相关性肝细胞癌疾病进展和预后风险的预测装置及其预测模型的训练方法制造方法及图纸

本发明专利技术公开了一种酒精相关性肝细胞癌疾病进展和预后风险的预测装置及其预测模型的训练方法，涉及疾病治疗技术领域。本发明专利技术发现多个m6A调控基因，如LRPPRC和RBM15B的表达水平与酒精相关性肝细胞癌的疾病进展以及预后风险显著相关，基于多个m6A调控基因构建的风险预测模型能够有效、准确地预测酒精相关性肝细胞癌的疾病进展和预后，相比与现有技术而言，本发明专利技术提供的风险预测模型更可靠，其预测结果更具有参考价值。结果更具有参考价值。结果更具有参考价值。

【技术实现步骤摘要】
一种酒精相关性肝细胞癌疾病进展和预后风险的预测装置及其预测模型的训练方法


[0001]本专利技术涉及疾病治疗
，具体而言，涉及一种酒精相关性肝细胞癌疾病进展和预后风险的预测装置及其预测模型的训练方法。

技术介绍

[0002]肝癌是最常见的癌症之一，也是癌症相关死亡的第四大原因，全世界每年报告的病例超过85万例。肝细胞癌最常见的危险因素是病毒感染、酒精中毒和代谢综合征。酒精可显著增加细胞质mtDNA的释放，导致肝细胞凋亡和炎症。过量饮酒导致脂肪酸的合成，促进脂肪肝进展，导致肝硬化和肝癌。此外，慢性酒精摄入可引起活性氧物种和DNA损伤，进一步促进肿瘤干细胞相关基因突变的激活，导致A
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HCC的预后不良，其死亡率是一般人群的4倍。
[0003]现有的肝细胞癌预测模型无法稳定准确地对肝细胞癌进行预测，鉴于此，特提出本专利技术。

技术实现思路

[0004]本专利技术的目的在于提供一种酒精相关性肝细胞癌疾病进展和预后风险的预测装置及其预测模型的训练方法。
[0005]本专利技术是这样实现的：第一方面，本专利技术实施例提供了一种检测m6A调控基因表达水平的试剂在制备用于预测酒精相关性肝细胞癌疾病进展和/或预后风险的试剂盒中的应用，所述m6A调控基因包括LRPPRC和RBM15B中的至少一种。
[0006]第二方面，本专利技术实施例提供了一种预测酒精相关性肝细胞癌疾病进展和/或预后风险的试剂盒，其包括用于检测m6A调控基因表达水平的试剂；所述m6A调控基因包括如前述实施例所述的应用中的m6A调控基因。
[0007]第三方面，本专利技术实施例提供了一种酒精相关性肝细胞癌疾病进展和/或预后风险预测模型的训练方法，其包括：获取训练样本m6A调控基因表达水平的检测结果以及所述训练样本对应的标注结果，所述m6A调控基因包括如前述实施例所述的应用中的m6A调控基因；将所述训练样本的m6A调控基因表达水平的检测结果输入预先构建好的预测模型中，获取训练样本的预测结果；其中，所述预测模型用于根据样本m6A调控基因表达水平预测样本酒精相关肝细胞癌疾病进展和/或预后风险；基于所述标注结果和所述预测结果对构建的所述预测模型进行参数更新。
[0008]第四方面，本专利技术实施例提供了一种预测酒精相关性肝细胞癌疾病进展和/或预后风险的预测装置，其包括获取模块和预测模块。获取模块，用于获取待测样本m6A调控基因表达水平的检测结果；所述m6A调控基因包括如前述实施例所述的应用中的m6A调控基因；预测模块，用于将所述检测结果输入由前述实施例所述的训练方法训练好的酒精相关性肝细胞癌疾病进展和/或预后风险 预测模型中，获得待测样本的预测结果。
[0009]第五方面，本专利技术实施例提供了一种酒精相关性肝细胞癌疾病进展和/或预后风险预测模型的训练装置，其包括获取模块、处理模块和参数更新模块。获取模块，用于获取训练样本m6A调控基因表达水平的检测结果以及所述训练样本对应的标注结果，所述m6A调控基因包括如前述实施例所述的应用中的m6A调控基因；处理模块，用于将所述训练样本的m6A调控基因表达水平的检测结果输入预先构建好的预测模型中，获取训练样本的预测结果；其中，所述预测模型用于根据样本m6A调控基因表达水平预测样本酒精相关肝细胞癌疾病进展和/或预后风险；参数更新模块，用于根据所述标注结果和所述预测结果对构建的所述预测模型进行参数更新。
[0010]第六方面，本专利技术实施例提供了一种电子设备，所述电子设备包括处理器和存储器；所述存储器用于存储程序，当所述程序被所述处理器执行时，使得所述处理器实现如前述实施例所述的酒精相关性肝细胞癌疾病进展和/或预后风险预测模型的训练方法，或如下酒精相关性肝细胞癌疾病进展和/或预后风险的预测方法：获取待测样本m6A调控基因表达水平的检测结果；所述m6A调控基因包括如前述实施例所述的应用中的m6A调控基因；将所述检测结果输入由前述实施例所述的训练方法训练好的酒精相关性肝细胞癌疾病进展和/或预后风险预测模型中，获得待测样本的预测结果。
[0011]第七方面，本专利技术实施例提供了一种计算机可读介质，所述计算机程序被处理器执行时实现如前述实施例所述的酒精相关性肝细胞癌疾病进展和/或预后风险预测模型的训练方法，或如下酒精相关性肝细胞癌疾病进展和/或预后风险的预测方法：获取待测样本m6A调控基因表达水平的检测结果；所述m6A调控基因包括如前述实施例所述的应用中的m6A调控基因；将所述检测结果输入由前述实施例所述的训练方法训练好的酒精相关性肝细胞癌疾病进展和/或预后风险 预测模型中，获得待测样本的预测结果。
[0012]本专利技术具有以下有益效果：本专利技术发现多个m6A调控基因（如LRPPRC和RBM15B）的表达水平与酒精相关性肝细胞癌的疾病进展以及预后风险显著相关，基于多个m6A调控基因构建的风险预测模型能够有效、准确地预测酒精相关性肝细胞癌的疾病进展和预后，相比与现有技术而言，本专利技术提供的风险预测模型更可靠，其预测结果更具有参考价值。
附图说明
[0013]为了更清楚地说明本专利技术实施例的技术方案，下面将对实施例中所需要使用的附图作简单地介绍，应当理解，以下附图仅示出了本专利技术的某些实施例，因此不应被看作是对范围的限定，对于本领域普通技术人员来讲，在不付出创造性劳动的前提下，还可以根据这些附图获得其他相关的附图。
[0014]图1为实施例1中GeneMANIA的21个m6A相关基因的蛋白
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蛋白相互作用；图2为实施例1中KIAA1429、LRPPRC、RBM15B、YTHDF2的高低表达的生存差异分析；图3为实施例1中具有累积分布函数的一致聚类模型，LASSO回归算法构建的用于计算风险分数的模型；图4为实施例1中选择4个基因构建预测模型时，惩罚力度最大，误差值最小；图5为实施例1中A
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HCC患者的总生存曲线；图6为实施例1中TCGA队列不同临床特征和时间预测准确率的ROC曲线；
图7为实施例1中TCGA队列风险预测模型对A
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HCC的诊断敏感性高于常见的肝细胞癌诊断标志物（AFP，SERPINA1，TM6SF2和PNPLA3）；图8为实施例1中多变量列线图预测A
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HCC患者的总生存时间。
具体实施方式
[0015]为使本专利技术实施例的目的、技术方案和优点更加清楚，下面将对本专利技术实施例中的技术方案进行清楚、完整地描述。实施例中未注明具体条件者，按照常规条件或制造商建议的条件进行。所用试剂或仪器未注明生产厂商者，均为可以通过市售购买获得的常规产品。
[0016]本专利技术提供了检测m6A调控基因表达水平的试剂在制备用于预测酒精相关性肝细胞癌（A
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HCC）疾病进展和/或预后风险的试剂盒中的应用，所述m6A调控基因包括LRPPRC和RBM15B中的至少一种。
[0017]在优选的实施方式中，所述m6A调控基因还包括KIAA1429和YTHDF2中的至少一种。
[0018]本文档来自技高网...

【技术保护点】

【技术特征摘要】
1.检测m6A调控基因表达水平的试剂在制备用于预测酒精相关性肝细胞癌疾病进展和/或预后风险的试剂盒中的应用，其特征在于，所述m6A调控基因包括LRPPRC和RBM15B中的至少一种。2.根据权利要求1所述的应用，其特征在于，所述m6A调控基因还包括KIAA1429和YTHDF2中的至少一种。3.一种预测酒精相关性肝细胞癌疾病进展和/或预后风险的试剂盒，其特征在于，其包括用于检测m6A调控基因表达水平的试剂；所述m6A调控基因包括如权利要求1或2所述的检测m6A调控基因表达水平的试剂在制备用于预测酒精相关性肝细胞癌疾病进展和/或预后风险的试剂盒中的应用中的m6A调控基因。4.一种酒精相关性肝细胞癌疾病进展和/或预后风险预测模型的训练方法，其特征在于，其包括：获取训练样本m6A调控基因表达水平的检测结果以及所述训练样本对应的标注结果；所述m6A调控基因包括如权利要求1或2所述的检测m6A调控基因表达水平的试剂在制备用于预测酒精相关性肝细胞癌疾病进展和/或预后风险的试剂盒中的应用中的m6A调控基因；将所述训练样本的m6A调控基因表达水平的检测结果输入预先构建好的预测模型中，获取训练样本的预测结果；其中，所述预测模型用于根据样本m6A调控基因表达水平预测样本酒精相关肝细胞癌疾病进展和/或预后风险；基于所述标注结果和所述预测结果对构建的所述预测模型进行参数更新。5.根据权利要求4所述的酒精相关性肝细胞癌疾病进展和/或预后风险预测模型的训练方法，其特征在于，所述预测模型包括：风险预测模块，用于根据样本m6A调控基因表达水平，获取样本患有酒精相关性肝细胞癌的风险分数。6.根据权利要求5所述的酒精相关性肝细胞癌疾病进展和/或预后风险预测模型的训练方法，其特征在于，所述预测模型还包括：生存期预测模块，用于根据患者的临床信息以及风险分数，获取样本的总生存期。7.根据权利要求6所述的酒精相关性肝细胞癌疾病进展和/或预后风险预测模型的训练方法，其特征在于，所述生存期预测模块包括能够根据样本的临床信息以及风险分数获取样本的总生存期的列线图；所述列线图是针对训练样本的临床信息以及风险分数进行多变量分析，根据多变量分析的结果绘制而成的。8.根据权利要求7所述的酒精相关性肝细胞癌疾病进展和/或预后风险预测模型的训练方法，其特征在于，所述临床信息包括：年龄、性别、疾病等级以及疾病分期中的至少一种。9.一种预测酒精相关性肝细胞癌疾病进展和/或预后风险的预测装置，其特征在于，其包括：获取模块，用于获取待测样本m6A调控基因表达水平的检测结果；所述m6A调控基因包括如权利要求1或2所述的检测m6A调控基因表达水平的试剂在制备用于预测酒精相关性肝细胞癌疾病进展和/或预后风险的试剂盒中的应用中的m6A调控基因；预测模块，用于将所述检测结果输入由权利要求4~8任一项所述的酒精相关性肝细胞癌疾病进展和/或预后风险预测模型的训练方法训练好的酒精相关性肝细胞癌疾病进展和/或预后风险预测模型中，获得待测样本的预测结果。
10.根据权利要求9所述的预测酒精相关性肝细胞癌疾病进展和/或预后风险的预测装置，其特征在于，所述预测模块通过将待测样本m6A调控基因表达水平的检测结果代入计算公式中，获取待测样本患有酒精相关性干细胞癌的风险分数；计算公式为：风险分数=(Coef
KIAA1429
×
KIAA1429)+(Coef
LRPPRC
×
LRPPRC)+(Coef RBM15B<...

【专利技术属性】
技术研发人员：高毅，张悦，翁骏，曾繁鸿，
申请(专利权)人：广东乾晖生物科技有限公司，
类型：发明
国别省市：