【技术实现步骤摘要】
一种与稻米垩白度相关的单倍型SNP分子标记及其检测方法与应用
[0001]本专利技术属于农业分子生物学领域，具体涉及与一种与稻米垩白度相关的单倍型SNP分子标记及其检测方法与应用。
技术介绍
[0002]垩白是稻米胚乳中白色不透明的部分，为胚乳淀粉粒之间存在空隙引起透光性改变所致。垩白度是稻米中垩白部位的投影面积占整个米粒投影面积的百分比，灌浆期高温尤其是夜间高温对垩白的形成有利)。垩白米严重影响稻米外观品质、加工品质、食味品质和营养品质，并直接关系到稻米的商品性和市场价值，高垩白的稻米现在已没有市场价值。
[0003]粳稻垩白度和透明度普遍优于籼稻，随着各项技术的提高，现在有些籼稻品种垩白度已经不比粳稻差，甚至更好。如两系杂交籼稻品种隆两优华占的垩白度只有不到1%。但籼稻的垩白度变化幅度较大，垩白粒率普遍较高，平均为53.0％，且垩白度高的品种垩白粒率相应的也高。粳稻的垩白米率平均为18.1％，垩白度2.0％。根据现行的稻米质量标准，一级优质米垩白粒率在10%以下，二级为11%
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20%，三级为2
【技术保护点】
【技术特征摘要】
1.一种与稻米垩白度相关的单倍型SNP分子标记，其特征在于，所述单倍型SNP分子标记由SNP1和SNP2组成；所述SNP1所在基因组位置为水稻基因组第5号染色体5365892bp处，多态性为G或A；所述SNP2所在基因组位置为水稻基因组第5号染色体5371716bp处，多态性为G或A。2.根据权利要求1所述的单倍型SNP分子标记在水稻育种中的应用。3.根据权利要求1所述的单倍型SNP分子标记在预测水稻品种垩白度中的应用。4.一种稻米垩白度相关的分子标记的筛选方法，其特征在于，所述筛选方法包括如下步骤：对水稻进行全基因组测序，根据测序结果，采用全基因组关联分析及表型分析的方法，进行水稻垩白度性状关联位点的定位后，进行GWAS分析，在等位基因频率>5%的SNP中挑选与水稻垩白度...
【专利技术属性】
技术研发人员：程计华，田冰川，林鑫，李宙炜，曾琴，贾高峰，彭俊华，
申请(专利权)人：华智生物技术有限公司，
类型：发明
国别省市：
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