一种用于检测奶牛产奶性状的COL6A1基因SNPs标记及其应用制造技术

本发明专利技术公开了一种用于检测奶牛产奶性状的COL6A1基因SNPs标记及其应用。本发明专利技术提供了检测如下14个SNP位点基因型的物质在鉴定或辅助鉴定奶牛产奶性状中的应用：1:g.145667090C>T、1:g.145668599C>G、1:g.145669859T>C、1:g.145673966T>C、1:g.145676602G>A、1:g.145676653T>C、1:g.145677680C>T、1:g.145677709A>G、1:g.145677953A>G等；各个位点与305天产奶量、乳脂量、乳脂率、乳蛋白量或乳蛋白率相关，可用于奶牛选育。

【技术实现步骤摘要】
一种用于检测奶牛产奶性状的COL6A1基因SNPs标记及其应用
本专利技术涉及一种分子标记及其应用；特别涉及一种用于检测奶牛产奶性状的COL6A1基因SNPs标记及其应用，属于生物

技术介绍
VI型胶原α1链(collagentypeVIalpha1chain,COL6A1)是一个蛋白质超家族。VI型胶原蛋白是细胞外基质蛋白，是微纤维的主要结构成分，由α1(VI)、α2(VI)和α3(VI)链的异源三聚体作为其共同的结构元件。VI型胶原蛋白具有相当重要的意义，在维持各种组织的完整性中发挥作用，是连接细胞与其周围环境的锚定网络(Everts等人，1998年；Kuo等人，1997年)。研究表明，胶原蛋白VI是乳腺细胞外基质的重要组成成分(Siu等人，2008年)。VI型胶原的多域结构不仅使其适合与细胞外环境成分(如II型胶原、核心蛋白聚糖、纤维调节蛋白、透明质酸和纤维连接蛋白)的相互作用，而且可以通过整合素与细胞表面特异性结合(Loeser等人1997)。根据其可能与细胞的相互作用，VI型胶原在各组织中均有表达(Chang和Poo本文档来自技高网...

【技术保护点】
1.用于检测如下14个SNP位点中至少一种SNP位点的基因型的物质在鉴定或辅助鉴定奶牛产奶性状中的应用；/n所述14个SNP位点为SNP位点1:g.145667090C>T、SNP位点1:g.145668599C>G、SNP位点1:g.145669859T>C、SNP位点1:g.145673966T>C、SNP位点1:g.145676602G>A、SNP位点1:g.145676653T>C、SNP位点1:g.145677680C>T、SNP位点1:g.145677709A>G、SNP位点1:g.145677953A>G、SNP位点1:g.1...

【技术特征摘要】
1.用于检测如下14个SNP位点中至少一种SNP位点的基因型的物质在鉴定或辅助鉴定奶牛产奶性状中的应用；
所述14个SNP位点为SNP位点1:g.145667090C>T、SNP位点1:g.145668599C>G、SNP位点1:g.145669859T>C、SNP位点1:g.145673966T>C、SNP位点1:g.145676602G>A、SNP位点1:g.145676653T>C、SNP位点1:g.145677680C>T、SNP位点1:g.145677709A>G、SNP位点1:g.145677953A>G、SNP位点1:g.145682517G>A、SNP位点1:g.145682638A>G、SNP位点1:g.145684727G>A、SNP位点1:g.145686763T>C和SNP位点1:g.145686889C>T。


2.如下14个SNP位点中至少一种SNP位点作为检测靶标在鉴定或辅助鉴定奶牛产奶性状中的应用；
所述14个SNP位点为SNP位点1:g.145667090C>T、SNP位点1:g.145668599C>G、SNP位点1:g.145669859T>C、SNP位点1:g.145673966T>C、SNP位点1:g.145676602G>A、SNP位点1:g.145676653T>C、SNP位点1:g.145677680C>T、SNP位点1:g.145677709A>G、SNP位点1:g.145677953A>G、SNP位点1:g.145682517G>A、SNP位点1:g.145682638A>G、SNP位点1:g.145684727G>A、SNP位点1:g.145686763T>C和SNP位点1:g.145686889C>T。


3.如权利要求1或2所述的应用，其特征在于：所述产奶性状为产奶量和/或乳脂量和/或乳蛋白量。


4.一种鉴定或辅助鉴定奶牛产奶性状的方法，为如下1)-14)中任一种：
1)包括如下步骤：检测供试奶牛COL6A1基因中SNP位点1:g.145667090C>T的基因型；所述SNP位点1:g.145667090C>T的基因型为CC或TT；
所述SNP位点1:g.145667090C>T基因型为TT的供试奶牛的产奶性状优于或辅助优于所述SNP位点1:g.145667090C>T基因型为CC的供试奶牛；
2)包括如下步骤：检测供试奶牛COL6A1基因中SNP位点1:g.145668599C>G的基因型；所述SNP位点1:g.145668599C>G的基因型为GG或CC；
所述SNP位点1:g.145668599C>G基因型为GG的供试奶牛的产奶性状优于或辅助优于所述SNP位点1:g.145668599C>G基因型为CC的供试奶牛；
3)包括如下步骤：检测供试奶牛COL6A1基因中SNP位点1:g.145669859T>C的基因型；所述SNP位点1:g.145669859T>C的基因型为TT或CC；
所述SNP位点1:g.145669859T>C基因型为TT的供试奶牛的产奶性状优于或辅助优于所述SNP位点1:g.145669859T>C基因型为CC的供试奶牛；
4)包括如下步骤：检测供试奶牛COL6A1基因中SNP位点1:g.145673966T>C的基因型；所述SNP位点1:g.145673966T>C的基因型为TT或CC；
所述SNP位点1:g.145673966T>C基因型为TT的供试奶牛的产奶性状优于或辅助优于所述SNP位点1:g.145673966T>C基因型为CC的供试奶牛；
5)包括如下步骤：检测供试奶牛COL6A1基因中SNP位点1:g.145676602G>A的基因型；所述SNP位点1:g.145676602G>A的基因型为AA或GG；
所述SNP位点1:g.145676602G>A基因型为AA的供试奶牛的产奶性状优于或辅助优于所述SNP位点1:g.145676602G>A基因型为GG的供试奶牛；
6)包括如下步骤：检测供试奶牛COL6A1基因中SNP位点1:g.145676653T>C的基因型；所述SNP位点1:g.145676653T>C的基因型为CC或TT；
所述SNP位点1:g.145676653T>C基因型为CC的供试奶牛的产奶性状优于或辅助优于所述SNP位点1:g.145676653T>C基因型为TT的供试奶牛；
7)包括如下步骤：检测供试奶牛COL6A1基因中SNP位点1:g.145677680C>T的基因型；所述SNP位点1:g.145677680C>T的基因型为TT或CC；
所述SNP位点1:g.145677680C>T基因型为TT的供试奶牛的产奶性状优于或辅助优于所述SNP位点1:g.145677680C>T基因型为CC的供试奶牛；
8)包括如下步骤：检测供试奶牛COL6A1基因中SNP位点1:g.145677709A>G的基因型；所述SNP位点1:g.145677709A>G的基因型为AA或GG；
所述SNP位点1:g.145677709A>G基因型为AA的待测奶牛的产奶性状优于或辅助优于所述SNP位点1:g.145677709A>G基因型为GG的待测奶牛；
9)包括如下步骤：检测供试奶牛COL6A1基因中SNP位点1:g.145677953A>G的基因型；所述SNP位点1:g.145677953A>G的基因型为GG或AA；
所述SNP位点1:g.145677953A>G基因型为GG的供试奶牛的产奶性状优于或辅助优于所述SNP位点1:g.145677953A>G基因型为AA的供试奶牛；
10)包括如下步骤：检测供试奶牛COL6A1基因中SNP位点1:g.145682517G>A的基因型；所述SNP位点1:g.145682517G>A的基因型为GG或AA；
所述SNP位点1:g.145682517G>A基因型为GG的供试奶牛的产奶性状优于或辅助优于所述SNP位点1:g.145682517G>A基因型为AA的供试奶牛；
11)包括如下步骤：检测供试奶牛COL6A1基因中SNP位点1:g.145682638A>G的基因型；所述SNP位点1:g.145682638A>G的基因型为AA或GG；
所述SNP位点1:g.145682638A>G基因型为AA的供试奶牛的产奶性状优于或辅助优于所述SNP位点1:g.145682638A>G基因型为GG的供试奶牛；
12)包括如下步骤：检测供试奶牛COL6A1基因中SNP位点1:g.145684727G>A的基因型；所述SNP位点1:g.145684727G>A的基因型为GG或AA；
所述SNP位点1:g.145684727G>A基因型为GG的供试奶牛的产奶性状优于或辅助优于所述SNP位点1:g.145684727G>A基因型为AA的供试奶牛；
13)包括如下步骤：检测供试奶牛COL6A1基因中SNP位点1:g.145686763T>C的基因型；所述SNP位点1:g.145686763T>C的基因型为TT或CC；
所述SNP位点1:g.145686763T>C基因型为TT的供试奶牛的产奶性状优于或辅助优于所述SNP位点1:g.145686763T>C基因型为CC的供试奶牛；
14)包括如下步骤：检测供试奶牛COL6A1基因中SNP位点1:g.145686889C>T的...

【专利技术属性】
技术研发人员：杨宇泽，路永强，唐韶青，孙东晓，林珊，韩博，刘林，麻柱，吕小青，常卓，赵春颖，刘亚楠，
申请(专利权)人：北京市畜牧总站，
类型：发明
国别省市：北京;11