基于黄牛LOC107131166基因CNV标记的生长性状分子标记辅助选择方法技术

本发明专利技术公开了一种基于黄牛LOC107131166基因CNV标记的生长性状分子标记辅助选择方法：利用QPCR技术，以待测牛基因组DNA为模板，分别用两对引物P1、P2对LOC107131166基因的CNV区域和内参基因BTF3的部分片段进行扩增，最后利用2*2

【技术实现步骤摘要】
基于黄牛LOC107131166基因CNV标记的生长性状分子标记辅助选择方法
本专利技术涉及家畜分子生物学检测领域，具体涉及一种基于QPCR技术检测牛LOC107131166基因CNV标记的方法。
技术介绍
DNA分子标记(DNAmolecularmarker)，是反映个体和种群间基因组特异性的DNA片段。分子标记包括限制性片段长度多态性标记(RestrictionFragmentLengthPolymorphism，RFLP)、随机扩增基因组DNA多态性标记(RandomAmplifiedPolymorphicDNA，RAPD)、扩增片段长度多态性标记(AmplifiedFragmentLengthPolymorphism，AFLP)、微卫星DNA(Microsatellite，MS)和单核苷酸多态性标记(SingleNucleotidePolymorphisms，SNP)。拷贝数变异(CNV)是指长度为1kb至数Mb的有关DNA片段拷贝数突变，包括DNA单一片段的扩增、缺失、插入、倒置等，也包括复杂的染色体扩增、缺失和插入的本文档来自技高网...

【技术保护点】
1.一种检测牛LOC107131166基因拷贝数变异的方法，其特征在于：包括以下步骤：/n以待测牛基因组DNA为模板，通过实时定量PCR分别扩增LOC107131166基因的拷贝数变异区域以及作为内参的BTF3基因的部分片段，然后根据定量结果鉴定牛LOC107131166基因的拷贝数变异类型。/n

【技术特征摘要】
1.一种检测牛LOC107131166基因拷贝数变异的方法，其特征在于：包括以下步骤：
以待测牛基因组DNA为模板，通过实时定量PCR分别扩增LOC107131166基因的拷贝数变异区域以及作为内参的BTF3基因的部分片段，然后根据定量结果鉴定牛LOC107131166基因的拷贝数变异类型。


2.如权利要求1所述一种检测牛LOC107131166基因拷贝数变异的方法，其特征在于：所述的拷贝数变异区域位于LOC107131166基因参考基因组序列AC_000179.1的52332801位到52340800位。


3.如权利要求1所述一种检测牛LOC107131166基因拷贝数变异的方法，其特征在于：所述的拷贝数变异类型是根据2*2-ΔΔCt将定量结果分为的三类：多拷贝型，2*2-ΔΔCt>2；缺失型，2*2-ΔΔCt<2；正常型，2*2-ΔΔCt＝2。


4.如权利要求1所述一种检测牛LOC107131166基因拷贝数变异的方法，其特征在于：所述的拷贝数变异区域的部分片段的扩增引物对为：
上游引物F1：5’-GGTGGAATCCCCACACTCAG-3’
下游引物R1：5’-GAGAGTCACGAGCCCTCAAC-3’；
所述的BTF3基因的部分片段的扩增引物对为...

【专利技术属性】
技术研发人员：刘贤，黄永震，丁晓婷，蔡雯雯，丁涵，徐美芳，彭巍，黄殷琪，李欣淼，吴胜军，李志明，张子敬，王二耀，茹宝瑞，
申请(专利权)人：河南省畜牧总站，
类型：发明
国别省市：河南;41