基于特异性片段的灰略红链霉菌检测方法技术

一种基于特异性片段的灰略红链霉菌检测方法，通过从堆肥中提取细菌基因组DNA，经过细菌基因组PCR扩增和PCR产物的回收，经序列测定实现在堆肥过程中检测灰略红链霉菌；本发明专利技术可快速、高效、特异性检出环境中的秸秆降解灰略红链霉菌，为制备相关秸秆降解工程菌株奠定了基础。

【技术实现步骤摘要】
基于特异性片段的灰略红链霉菌检测方法
本专利技术涉及的是一种生物工程领域的技术，具体是一种秸秆降解生防功能的灰略红链霉菌(Streptomycesgriseorubens)的检测方法。
技术介绍
现有堆肥发酵生产的关键因素之一是使用有效的微生物菌剂提高发酵效率。灰略红链霉菌JSD-1拥有木质素、纤维素、半纤维素降解酶，可以高效降解秸秆类难降解废弃物，有效提高堆肥温度，发酵周期可从常规的1～2个月缩短至8～10天。在好氧堆肥过程中，需要有效跟踪核心菌株-灰略红链霉菌的存活及迁移情况，以获得更好的菌剂施用效果。
技术实现思路
本专利技术针对现有技术存在的上述不足，提出一种基于特异性片段的灰略红链霉菌检测方法，可快速、高效、特异性检出环境中的秸秆降解灰略红链霉菌，为制备相关秸秆降解工程菌株奠定了基础。本专利技术是通过以下技术方案实现的：本专利技术涉及一种基于特异性片段的灰略红链霉菌检测方法，通过从堆肥中提取细菌基因组DNA，经过细菌基因组PCR扩增和PCR产物的回收，经序列测定实现在堆肥过程中检测灰略红链霉菌。...

【技术保护点】
1.一种基于特异性片段的灰略红链霉菌检测方法，其特征在于，通过从堆肥中提取细菌基因组DNA，经过细菌基因组PCR扩增和PCR产物的回收，经序列测定实现在堆肥过程中检测灰略红链霉菌；/n所述的灰略红链霉菌，具体为灰略红链霉菌(Streptomycesgriseorubens)JSD-1，现保藏于中国微生物菌种保藏管理委员会普通微生物中心(CGMCC)，保藏标号为CGMCCNo.5706，保藏日期为2012年1月9日；/n所述的序列测定，基于灰略红链霉菌的特异性片段实现，其来自灰略红链霉菌(Streptomyces griseorubens)JSD-1的全基因组，该特异性片段具体如Seq ID N...

【技术特征摘要】
1.一种基于特异性片段的灰略红链霉菌检测方法，其特征在于，通过从堆肥中提取细菌基因组DNA，经过细菌基因组PCR扩增和PCR产物的回收，经序列测定实现在堆肥过程中检测灰略红链霉菌；
所述的灰略红链霉菌，具体为灰略红链霉菌(Streptomycesgriseorubens)JSD-1，现保藏于中国微生物菌种保藏管理委员会普通微生物中心(CGMCC)，保藏标号为CGMCCNo.5706，保藏日期为2012年1月9日；
所述的序列测定，基于灰略红链霉菌的特异性片段实现，其来自灰略红链霉菌(Streptomycesgriseorubens)JSD-1的全基因组，该特异性片段具体如SeqIDNo.1～No.13所示。


2.根据权利要求1所述的方法，其特征是，所述的特异性片段，通过...

【专利技术属性】
技术研发人员：张丹，周培，池耀威，初少华，杨夕佳，支月娥，戚志萍，冯洁，
申请(专利权)人：上海交通大学，
类型：发明
国别省市：上海;31