一种基于KASP技术对样本SNP位点进行分型的方法技术

本发明专利技术提供一种基于KASP技术对样本SNP位点进行分型的方法，所述方法包括完成样本数量≥22的SNP位点KASP方法分型检测，确定每个SNP位点不同基因型在KASP分型图中的范围；挑出每个SNP位点不同基因型的代表样本和制成标准品；根据不同基因型标准品KASP分型图的范围，确定待测样品的基因分型。本发明专利技术补足了KASP技术一个位点一次性检测不得少于22个样本的空缺。

【技术实现步骤摘要】
一种基于KASP技术对样本SNP位点进行分型的方法
本专利技术涉及生物
，具体涉及一种基于KASP技术对样本SNP位点进行分型的方法。
技术介绍
KASP(KompetitiveAlleleSpecificPCR)，即竞争性等位基因特异性PCR，基于引物末端碱基的特异匹配对指定的SNPs(singlenucleotidepolymorphisms，单核苷酸多态性)及InDels(InsertionsandDeletions，插入和缺失)进行双等位基因判定。因KASP技术对检测样本纯度及浓度(1-10ngDNA即可加入反应)要求不高，且具有高准确度、灵活性及低成本的特性。具体表现有支持低、中、高通量的样本研究，无需合成昂贵的特异性荧光标记引物或探针。KASP技术已被广泛应用于农业方向和医学方面，如动植物的品种改良，疾病筛查及预测、个体化用药及预后等。KASP技术适合小通量、中通量及大通量样本的检测，可灵活应用于98孔板、384孔板和1536孔板的检测。同时，KASP技术基于终点读板法进行基因型判读，即根据样本检测呈现的散点聚成的不同本文档来自技高网...

【技术保护点】
1.一种基于KASP技术对样本SNP位点进行分型的方法，所述方法包括以下步骤：/n步骤1：完成样本数量≥22的SNP位点KASP方法分型检测，确定每个SNP位点不同基因型在KASP分型图中的范围；/n步骤2：对步骤1中不同基因型的KASP分型结果进行Sanger测序验证，从中挑出每个SNP位点不同基因型的代表样本；/n步骤3：挑出每个SNP位点不同基因型的代表样本进行目的片段的分子克隆并制成标准品；和/n步骤4：在低于22个样本的KASP检测中，选用步骤3中得到的待测SNP位点不同基因型的标准品一同进行KASP检测，根据不同基因型标准品KASP分型图的范围，确定待测样品的基因分型。/n

【技术特征摘要】
1.一种基于KASP技术对样本SNP位点进行分型的方法，所述方法包括以下步骤：
步骤1：完成样本数量≥22的SNP位点KASP方法分型检测，确定每个SNP位点不同基因型在KASP分型图中的范围；
步骤2：对步骤1中不同基因型的KASP分型结果进行Sanger测序验证，从中挑出每个SNP位点不同基因型的代表样本；
步骤3：挑出每个SNP位点不同基因型的代表样本进行目的片段的分子克隆并制成标准品；和
步骤4：在低于22个样本的KASP检测中，选用步骤3中得到的待测SNP位点不同基因型的标准品一同进行KASP检测，根据不同基因型标准品KASP分型图的范围，确定待测样品的基因分型。


2.根据权利要求1所述的方法，其特征在于，所述方法在MTHFR基因rs1801133的SNP位点进行分型中的应用。


3.根据权利要求2所述的方法，其特征在于，步骤1中KASP分型检测的引物包括用不同...

【专利技术属性】
技术研发人员：苗慧芳，张延明，杜楠，何彤，冯秀丽，王丽娜，侯全民，
申请(专利权)人：北京诺赛基因组研究中心有限公司，
类型：发明
国别省市：北京;11