【技术实现步骤摘要】
荧光定量的指标确定方法
本专利技术涉及荧光定量检测
,尤其是涉及一种荧光定量的指标确定方法。
技术介绍
目前,诊断传染病标准的核酸定量方法仍然多采用荧光实时定量PCR,其能够量化样品模板的初始值,常被用在基因分析表达、转基因食物检测和癌症检测中。它通常依靠标准曲线或参照基因来测定核酸量,但基于标准曲线的方法需要满足一个苛刻的假设条件,即在所有样本中,每个扩增子的PCR效率是恒定的。而现有文献、实验表明,在很多情况下,这一假设难以达到。同时,在确定样本的Ct值方面,现有方法一般简单将3-15个循环的荧光信号标准偏差10倍对应的阈值作为Ct值确定依据、或者利用sigmoid、Richards等曲线模型,基于LM方法(Levenberg-Marquardt方法)、Akima插值法等纯数学方法进行拟合,得到拟合参数。阈值法只是一种经验做法,而Richards曲线模型拟合等数学方法虽然能得到较好的拟合效果,但计算复杂、无形中也与PCR指数扩增特性脱离了联系。
技术实现思路
本专利技术的目的在于提供一种 ...
【技术保护点】
1.一种荧光定量的指标确定方法,其特征在于,包括:/n采集第一数量个循环对应的初始荧光定量PCR扩增数据;/n对所述第一数量中前第二数量个循环对应的初始PCR扩增数据进行线性拟合,确定扩增曲线基线;/n对所述初始PCR扩增数据去基线,得到目标PCR扩增数据;/n基于所述第一数量中除前第二数量以外的后第三数量个循环对应的目标PCR扩增数据确定PCR的指标。/n
【技术特征摘要】
1.一种荧光定量的指标确定方法,其特征在于,包括:
采集第一数量个循环对应的初始荧光定量PCR扩增数据;
对所述第一数量中前第二数量个循环对应的初始PCR扩增数据进行线性拟合,确定扩增曲线基线;
对所述初始PCR扩增数据去基线,得到目标PCR扩增数据;
基于所述第一数量中除前第二数量以外的后第三数量个循环对应的目标PCR扩增数据确定PCR的指标。
2.根据权利要求1所述的方法,其特征在于,基于所述第一数量中除前第二数量以外的后第三数量个循环对应的目标PCR扩增数据确定PCR的指标的步骤包括:
针对所述第三数量个循环对应的目标PCR扩增数据,基于自适用多项式拟合方式确定目标指数区域;
根据所述目标指数区域确定所述PCR的指标。
3.根据权利要求2所述的方法,其特征在于,针对所述第三数量个循环对应的目标PCR扩增数据,基于自适用多项式拟合方式确定目标指数区域的步骤包括:
确定所述第三数量个循环对应的目标PCR扩增数据中荧光强度连续递增的第四数量个循环;
针对所述第四数量个循环对应的目标PCR扩增数据取对数;
运用自适用多项式拟合方式,找到...
【专利技术属性】
技术研发人员:李冬,杨智,贺贤汉,
申请(专利权)人:杭州博日科技股份有限公司,
类型:发明
国别省市:浙江;33
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