【技术实现步骤摘要】
人测序样品追踪标记物、人测序样品交叉污染的监控方法及监控装置
本专利技术涉及生物
，具体而言，涉及一种人测序样品追踪标记物、人测序样品交叉污染的监控方法及监控装置。
技术介绍
二代测序技术(NGS)在双脱氧链终止法(Sanger法)测序的基础上，实现了多通道同时对多个核酸分子进行测序，使测序向着高通量、低成本、高安全性和商业化的方向发展，在分子生物学、临床医学、疾病筛查与检测等方面有着重要应用，为分子水平上的致病基因研究提供了强有力的平台。但同时，二代测序技术需要同时处理大量样本，统一进行标准化文库构建操作，这个过程中不可避免的增加了样本颠倒交换和交叉污染的风险。尽管美国临床病理学会(CAP)发布了防止样本污染的相关文件，并且许多实验室选择对测序结果通过Sanger测序进行二次验证，但仍无法有效解决临床试验样本测序中出现样本污染的问题。尽管测序过程中出现的样本污染概率有限，且污染物所占比例不高，但医疗数据和样本身份的任何混淆都会对基因研究结果产生巨大影响。有证据表明，使用聚合酶链式反应(PCR)扩增的高...
【技术保护点】
1.一种人测序样品追踪标记物，其特征在于，所述标记物的序列来源于詹氏甲烷球菌Methanococcus jannaschii，且与人类参考基因组序列比对结果无匹配。/n
【技术特征摘要】
1.一种人测序样品追踪标记物，其特征在于，所述标记物的序列来源于詹氏甲烷球菌Methanococcusjannaschii，且与人类参考基因组序列比对结果无匹配。
2.根据权利要求1所述的人测序样品追踪标记物，其特征在于，所述标记物的序列长度为60bp～90bp，优选为80bp。
3.根据权利要求1所述的人测序样品追踪标记物，其特征在于，所述标记物包括多条序列，多条所述序列之间互不相同。
4.根据权利要求1所述的人测序样品追踪标记物，其特征在于，所述人测序样品追踪标记物采用HPLC纯化得到，且经过Sanger测序验证序列精确度。
5.一种人测序样品交叉污染的监控方法，其特征在于，包括以下步骤：
向待测样品中加入一种如权利要求1至4中任一项所述的人测序样品追踪标记物，对所述待测样品进行测序，并进行标记物数据分析；
根据所述标记物数据分析监控人测序样品交叉污染的情况。
6.根据权利要求5所述的监控方法，其特征在于，所述监控方法还包括：根据人类单核苷酸多态性的等位基因比率建立交叉污染模型，并通过所述交叉污染模型监测人测序样品交叉污染情况。
7.根据权利要求6所述的监控方法，其特征在于，所述根据人类单核苷酸多态性的等位基因比率建立交叉污染模型，并通过所述交叉污染模型监测人测序样品交叉污染情况包括：
采用人类样本样品的全外显子测序数据进行建模，基于全外显子测序数据的单核苷酸变异分析结果计算每个单核苷酸变异位点的MAF值，取所有覆盖深度在30X～500X的单核苷酸变异位点的MAF值，设定预定的区间长度，统计每个取值区间的频率，绘制MAF的密度分布曲线，根据MAF的密度分布图，确定曲线峰值对应的横坐标，即候选的MAF值，根据预设的判定规则估算污染率。
8.根据权利要求7所述的监控方法，其特征在于，所述预定的区间长度为0.01～0.02，优选为0.01。
9.根据权利要求7所述的监控方法，其特征在于，所述预设的判定规则包括：
若只有1个候选MAF值，当所述候选MAF值小于0.25时，两倍候选MAF值为污染率估算值，否则所述候选MAF值为污染率预估值；
若有两个及以上的MAF值时，如果存在候选MAF值是另外一个候选MAF值的2/0.9～2/1.1倍，则该候选MAF值为污染率预估值；如果存在两个候选MAF值之和为0.475～0.525，则较小的候选MAF值的两倍为污染率预估值；如果存在一个候选MAF值的一半与另外一个候选MAF值之和为0.475～0.525，则该候选MAF值...
【专利技术属性】
技术研发人员：姚佳玥，刘文彬，李艳萍，许洪柱，高长欣，吴国营，
申请(专利权)人：天津诺禾医学检验所有限公司，
类型：发明
国别省市：天津;12
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