【技术实现步骤摘要】
一种高通量测序污染检测用分子标签组及其应用
本专利技术涉及生物信息学和生物
,特别是涉及一种高通量测序污染检测用分子标签组及其应用。
技术介绍
二代测序与一代测序、PCR等检测手段相比,检测周期相对较长,检测过程也更为复杂,一个检测周期包括样本预处理、核酸提取、文库构建、测序、数据分析等步骤。整个检测周期,从样本到数据,经历多个检测环节和多个检测人员,一旦发生了样本混淆、样本相互污染等情况,将产生错误的数据分析结果。因此,样本溯源和污染识别,是产生正确的二代测序结果的前提和保证。二代测序中常用的样本溯源方法,是给不同样本加上不同的标签,得以在数据中识别并拆分。具体的说,二代测序在文库构建过程中,会在文库两端加上测序平台通用接头,以使得文库可以在测序平台上被测序。通用接头包含了一段用于在测序下机数据中识别区分样本的标签序列,同一次测序反应中,不同文库会加上不同的标签序列,使得数据分析人员得以在下机数据中,将不同样本文库的数据拆分开,单独进行后续分析。如果实验过程中,不同文库之间的标签序列发生了交叉污染,将导致数据 ...
【技术保护点】
1.一种高通量测序污染检测用分子标签组,其特征在于,/n所述分子标签组中包括若干不同的分子标签;不同的分子标签长度不同;所述分子标签为核酸片段。/n
【技术特征摘要】
1.一种高通量测序污染检测用分子标签组,其特征在于,
所述分子标签组中包括若干不同的分子标签;不同的分子标签长度不同;所述分子标签为核酸片段。
2.如权利要求1所述的高通量测序污染检测用分子标签组,其特征在于,还包括以下特征中的一项或多项:
1)所述分子标签的序列与样本的同源性低;优选的,同源性低于90%;
2)所述分子标签包括相同段和长度特异性段,所述相同段的长度相同,碱基排列顺序相同;
3)所述分子标签组中各分子标签均来源于同一分子标签源片段。
3.如权利要求2所述的高通量测序污染检测用分子标签组,其特征在于,还包括以下特征中的一项或多项:
1)所述分子标签组包括两个以上长度不同的分子标签;
2)所述分子标签源片段来自病毒基因组序列。
4.如权利要求3所述的高通量测序污染检测用分子标签组,其特征在于,所述分子标签源片段来源于病毒phix174的基因组序列,优选的,所述分子标签源片段的序列如SEQIDNO:18所示。
5.如权利要求4所述的高通量测序污染检测用分子标签组,其特征在于,所述分子标签组中的分子标签序列选自SEQIDNO:1~17中的一个或多个。
6.如权利要求1所述的高通量测序污染检测用分子标签组,其特征在于,所述分子标签长度为100bp-20kb。
7.如权利要求6所述的高通量测序污染检测用分子标签组,其特征在于,测序样本为片段化DNA时,所述分子标签为短片段分子标签,所述短片段分子标签的长度为100-300bp;测序样本为gDNA时,所述分子标签为长片段分子标签,所述长片段分子标签的长度为1kb~20kb。
8.一种高通量测序污染的检测方法,其特征在于,所述方法至少包括如下步骤:在每个样本中引入选自权利要求1-7中任一项所述的分子标签组中的一个或多个分子标签,其中,各样本引入的分子标签中,至少包括一个特有分子标签,所述特有...
【专利技术属性】
技术研发人员:杨敬敏,唐嘉婕,林健,朱学萍,高鹏飞,
申请(专利权)人:上海韦翰斯生物医药科技有限公司,
类型:发明
国别省市:上海;31
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