免疫组库标准物质序列及其设计方法和应用技术

本发明专利技术涉及一种免疫组库标准物质序列及其设计方法和应用，属于免疫组库检测技术领域。该免疫组库标准物质序列，由5’端到3’依次包括：V基因参考序列、CDR3模拟序列、J基因参考序列和C基因参考序列；所述CDR3模拟序列在真实样本中出现的概率≤0.01％，所述CDR3模拟序列包括1‑3段识别标签序列以及0‑1段水印序列；所述标签序列用于识别区分所述免疫组库标准物质序列，所述水印序列用于标识所述免疫组库标准物质序列的来源。该序列通过人工设计合成，为模拟淋巴细胞受体基因的免疫组库标准物质，可通过该标准物质作为模拟样品，进行多重PCR引物体系的调整和验证，从而减小多重PCR带来的偏差，更精准的反应样本的免疫组库各克隆分布情况。

【技术实现步骤摘要】
免疫组库标准物质序列及其设计方法和应用
本专利技术涉及免疫组库检测
，特别是涉及一种免疫组库标准物质序列及其设计方法和应用。
技术介绍
免疫组库(ImmuneRepertoire，IR)被定义为在任何特定时间下，机体适应性免疫系统的T淋巴细胞表面受体和B淋巴细胞表面受体(抗体)的总和。机体的适应性免疫主要是由淋巴细胞(包括T淋巴细胞和B淋巴细胞)发挥功能，具备抗原特异性的特点，这种抗原特异性是由淋巴细胞表面的抗原受体所决定的。T细胞主要参与细胞免疫，其特异性由T细胞受体(Tcellreceptor，TCR)编码基因的特异性决定；B细胞主要通过抗体参与体液免疫，其特异性由B细胞受体(Bcellreceptor，BCR)或称抗体(immunoglubin，IG)编码基因的特异性决定。BCR由两条重链和两条轻链构成，TCR由含量占绝大部分的α、β链(95％～99％)和含量较低的γ、δ链(1％～5％)组成，每条链又由多个V、D、J、C基因共同编码。在人体细胞的染色体上，每条链都有数十种V基因、D基因和J基因的编码基因，在T/B细胞本文档来自技高网...

【技术保护点】
1.一种免疫组库标准物质序列，其特征在于，由5’端到3’依次包括：V基因参考序列、CDR3模拟序列、J基因参考序列和C基因参考序列；所述CDR3模拟序列在真实样本中出现的概率≤0.01％，所述CDR3模拟序列包括1-3段识别标签序列以及0-1段水印序列；所述标签序列用于识别区分所述免疫组库标准物质序列，所述水印序列用于标识所述免疫组库标准物质序列的来源。/n

【技术特征摘要】
1.一种免疫组库标准物质序列，其特征在于，由5’端到3’依次包括：V基因参考序列、CDR3模拟序列、J基因参考序列和C基因参考序列；所述CDR3模拟序列在真实样本中出现的概率≤0.01％，所述CDR3模拟序列包括1-3段识别标签序列以及0-1段水印序列；所述标签序列用于识别区分所述免疫组库标准物质序列，所述水印序列用于标识所述免疫组库标准物质序列的来源。


2.根据权利要求1所述的免疫组库标准物质序列，其特征在于，每段所述识别标签序列的长度为6-50bp，所述水印序列的长度为为9-30bp。


3.根据权利要求1所述的免疫组库标准物质序列，其特征在于，所述CDR3模拟序列前、中、后段的GC含量均趋近于真实样本中的GC含量。


4.根据权利要求3所述的免疫组库标准物质序列，其特征在于，当所述免疫组库标准物质序列为IGH序列，则所述CDR3模拟序列前、中、后段的GC含量分别是0.60±0.04、0.54±0.04和0.48±0.05；
当所述免疫组库标准物质序列为TRB序列，则所述CDR3模拟序列前、中、后段的GC含量分别是0.64±0.04，0.61±0.03和0.52±0.04。


5.根据权利要求1所述的免疫组库标准物质序列，其特征在于，所述CDR3模拟序列由5’端到3’端依次为C(Z)i(X)jNEQIMW或C(Z)i(X)jNEQIMF；
其中，C表示CDR3起始保守氨基酸半胱氨酸所对应密码子的核苷酸；
W表示CDR3终止保守氨基酸色氨酸所对应密码子的核苷酸；
F表示CDR3终止保守氨基酸苯丙氨酸所对应密码子的核苷酸；
NEQIM分别表示天冬酰胺、谷氨酸、谷氨酰胺、异亮氨酸、甲硫氨酸所对应密码子的核苷酸；
Z、X独立地任选自：腺嘌呤、鸟嘌呤、胞嘧啶或胸腺嘧啶；
i、j选自：6-50的自然数。


6.根据权利要求5所述的免疫组库标准物质序列，其特征在于，所述C基因参考序列之后还设有识别标签序列，所述识别标签序列为(Z)i序列或(X)j序列。


7.根据权利要求1所述的免疫组库标准物质序列，其特征在于，所述CDR3模拟序列中，包括两段识别标签序列(Z)i(X)j；
当所述免疫组库标准物质序列为IGH序列，所述(Z)i(X)j序列选自SEQIDNo:1-SEQIDNo:53所示序列；
当所述免疫组库标准物质序列为TRB序列，所述(Z)i(X)j序列选自SEQIDNo:54-SEQIDNo:100所示序列。


8.根据权利要求1所述的免疫组库标准物质序列，其特征在于，所述C基因参考序列保留5’端的前100-1500bp，删除后续核苷酸。


9.根据权利要求1所述的免疫组库标准物质序列，其特征在于，对所述V基因参考序列和J基因参考序列进行排列组合，得到若干免疫组库标准物质序列。

【专利技术属性】
技术研发人员：王谢，苏政，杨凡，
申请(专利权)人：深圳泛因医学有限公司，
类型：发明
国别省市：广东;44