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检测DNA芯片假阳性、假阴性杂交信号的新方法技术

技术编号:2600652 阅读:484 留言:0更新日期:2012-04-11 18:40
本实用新型专利技术公开了一种检测DNA芯片假阳性、假阴性杂交信号的新方法。它是将DNA芯片放置于温控杂交盒中,加入含待测靶基因的杂交液于杂交盒内,按需设置芯片的杂交温度和时间,漂洗温度和时间,由计算机控制定时对杂交荧光信号进行扫描,利用荧光显微镜或共聚焦显微镜记录几个不同温度下DNA芯片的荧光图像。本发明专利技术的优点:可以检测出DNA芯片杂交信号中的假阳性、假阴性信号,提高DNA芯片检测结果的准确性,还可以缩短检测时间,实验简单易行。(*该技术在2019年保护过期,可自由使用*)

【技术实现步骤摘要】

本专利技术涉及一种检测DNA芯片假阳性、假阴性杂交信号的方法。现有技术中,DNA芯片采用同一温度、一次性杂交,然后利用荧光显微镜(或共聚焦显微镜、DNA芯片专用扫描仪)检测DNA芯片的各个探针区域的荧光强度。通过给定的荧光强度的域值来判断杂交信号的有无或高低。如某一区域的荧光强度高于域值,则认为该区域的荧光信号为阳性信号;如低于域值,则认为是阴性信号。如美国AFFYMATRIX公司的GenChip系统(http//www.affymatrix.com)。其具体实验方法如下1.利用化学方法把特异性寡核苷酸链固定于玻璃片或硅片上。2.荧光标记的待测靶基因溶解于杂交液中;然后把杂交液铺满于DNA芯片上,在一定温度下杂交一段时间。3.在一定温度下洗去未杂交的靶基因及非特异性吸附的靶基因。4.在荧光检测仪器上获得DNA芯片上的荧光图像。5.利用计算机图像分析软件,计算不同区域的荧光强度积分值。按预先确定的积分荧光强度域值,给出阳性信号区域。如上所述,这种DNA芯片的杂交方法和信号检测方法存在以下几个方面的问题1.由于DNA芯片的寡核苷酸探针的碱基组成不同,因而其最适杂交温度也不相同(不同本文档来自技高网...

【技术保护点】
一种检测DNA芯片假阳性,假阴性杂交信号的新方法,其特征在于将DNA芯片放置于温控杂交盒中,加入含待测靶基因的杂交液于杂交盒内,按需设置芯片的杂交温度和时间,漂洗温度和时间,由计算机控制定时对杂交荧光信号进行扫描,利用荧光显微镜或共聚焦显微镜记录几个不同温度下DNA芯片的荧光图像,当杂交完成后,增加DNA芯片的溶液温度检测双链解链速度,如果所有温度下,某一区域荧光强度均匀低于某一域值,则认为该区域的信号为阴性信号;如在某一温度下荧光强度高于域值,则根据动态杂交曲线或动态解链曲线进行判断。

【技术特征摘要】

【专利技术属性】
技术研发人员:杨梦甦雷国华
申请(专利权)人:杨梦甦
类型:发明
国别省市:HK[中国|香港]

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