本发明专利技术涉及制造或形成候选人工受体的结构单元。结构单元可以提供一个或多个结构特性如正电荷、负电荷、酸、碱、电子受体、电子供体、氢键供体、氢键受体、自由电子对、π电子、电荷极化、亲水性、疏水性等。结构单元可以是庞大的或者它可以是小的。(*该技术在2024年保护过期,可自由使用*)
【技术实现步骤摘要】
【国外来华专利技术】本申请是以Receptors LLC(一家美国国家公司)作为除了美国以外的所有国家指定申请人,和美国公民Robert E.Carlson作为仅对美国指定的申请人的名义提出的PCT国际专利申请,并对提交于2003年9月3日的美国临时专利申请Nos.60/499,752,60/499,965,和60/500,081,以及提交于2003年12月2日的60/526,511,60/526,699,60/526,703,60/526,708,和60/527,190声明优先权
技术介绍
高度灵敏和特异性地结合配体的人工受体的制备是研究的活跃领域,所述配体如蛋白质、肽、糖类、微生物、污染物、药物等。常规方法中没有一种特别成功;由于低结合亲和力,这些方法仅达到不高的灵敏度和特异性。抗体、酶和天然受体通常具有108-1012的结合常数,其导致纳摩尔级灵敏度和靶向特异性。作为对比,常规人工受体典型地具有约103-105的结合常数,具有可预测的毫摩尔级灵敏度结果和有限的特异性。正在推行几种常规方法试图获得高灵敏和特异性的人工受体。这些方法包括,例如,亲和力分离、分子印迹以及对合成的或半合成受体的推理性和/或组合性设计和合成。这些推理性或组合性方法已经受限于被评估受体相对较少的数量和/或它们对均匀设计策略的依赖,即仅集中在一种结构单元上的设计策略。常规组合方法在标准显微镜载玻片上形成包含10,000或100,000个分离的点的微阵列。然而,这些用于组合合成的常规方法每点只提供单一分子。在每个点使用单一结构单元使每个点仅提供单一可能的受体。制备数千个可能的受体将需要合成数千个结构单元。另外,目前对导致有效结合的原理的有限理解和受体可能结构的巨大数量阻碍了这些常规方法,使该方法有问题。仍然需要制备人工受体的方法和材料,使得该受体将目的合成的效率、微阵列的空间分辨率和组合展示的指数幂(exponential power)结合在一起。专利技术概述本专利技术涉及人工受体,人工受体或候选人工受体的阵列或微阵列,以及制备它们的方法。阵列的每个成员包含多个结构单元化合物,典型地,这些化合物被固定于支持体上的点中。本专利技术还包括结构单元,结构单元的组合,结构单元的阵列,和由这些结构单元与支持体一起构建的受体。本专利技术还包括使用这些阵列和受体的方法。本专利技术涉及用于制备和形成候选人工受体的结构单元。结构单元可以提供一种或多种结构特性,如正电荷,负电荷,酸,碱,电子受体,电子供体,氢键供体,氢键受体,自由电子对,π电子,电荷极化,亲水性,疏水性等。结构单元可以是庞大的或者它可以是小的。例如,结构单元可包含一个或多个羧基、胺、羟基、酚、羰基和硫醇基团,它们可以成为一个识别部分。例如,结构单元可包含一个或多个部分,它们具有正电荷,负电荷,酸,碱,电子受体,电子供体,氢键供体,氢键受体,自由电子对,π电子,电荷极化,亲水性,疏水性等。附图简述附图说明图1示意性地举例说明一个受体实施方案的二维表示,该方案依照本专利技术使用4种不同结构单元来制备配体结合位点。图2示意性地举例说明一个4结构单元分子构型实施方案的二维和三维表示,每个结构单元包含一个识别元件、一个构架、和一个与支持体偶联的接头(固定/锚定)。图3示意性地举例说明本方法和人工受体的一个实施方案,该方案使用重排和交换结构单元。图4示意性地举例说明一种方法的一个实施方案,该方法评价候选人工受体与试验配体的结合,试验配体例如一个分子或细胞。图5示意性地举例说明本方法的一个实施方案,该方案使用候选人工受体阵列。图6示意性地举例说明在一个工作人工受体阵列上的某种结合模式。图7示意性地举例说明一种方法的一个实施方案,该方法用于形成一种检测试验配体的方法或系统。图8示意性地举例说明一种方法的一个实施方案,该方法用于检测破坏靶分子结合相互作用的试剂。图9示意性地举例说明一种方法的一个实施方案,该方法用于检测破坏复合物结合相互作用的试剂,该复合物包含一个靶分子。图10示意性地举例说明干扰(disrupt)蛋白的候选干扰物(disruptor)蛋白复合物。图11示意性地举例说明一种方法的一个实施方案,该方法使用当前的人工受体产生或作为一个亲合支持体。图12A-B示意性地举例说明评价一个候选人工受体阵列与试验配体的结合以及选择一个或多个用于结合或操作试验配体的工作人工受体阵列。图13示意性地举例说明从候选人工受体中鉴定一种先导(lead)人工受体。图14示意性地举例说明本专利技术的一个实施方案的一个被标记微阵列的伪彩荧光图。图15示意性地举例说明一个二维作图,其数据来自与藻红蛋白接触和/或结合的候选人工受体。图16示意性地举例说明一个三维作图,其数据来自与藻红蛋白接触和/或结合的候选人工受体。图17示意性地举例说明一个二维作图,其数据来自与卵清蛋白荧光衍生物接触和/或结合的候选人工受体。图18示意性地举例说明一个三维作图,其数据来自与卵清蛋白荧光衍生物接触和/或结合的候选人工受体。图19示意性地举例说明一个二维作图,其数据来自与牛血清白蛋白荧光衍生物接触和/或结合的候选人工受体。图20示意性地举例说明一个三维作图,其数据来自与牛血清白蛋白荧光衍生物接触和/或结合的候选人工受体。图21示意性地举例说明一个二维作图,其数据来自与乙酰化辣根过氧化物酶接触和/或结合的候选人工受体。图22示意性地举例说明一个三维作图,其数据来自与乙酰化辣根过氧化物酶接触和/或结合的候选人工受体。图23示意性地举例说明一个二维作图,其数据来自与辣根过氧化物酶TCDD衍生物接触和/或结合的候选人工受体。图24示意性地举例说明一个三维作图,其数据来自与辣根过氧化物酶TCDD衍生物接触和/或结合的候选人工受体。图25示意性地举例说明图16中所示数据的一个子集。图26示意性地举例说明图16中所示数据的一个子集。图27示意性地举例说明图16中所示数据的一个子集。图28示意性地举例说明藻红蛋白的结合数据与组成人工受体的结构单元的logP的相关性。图29示意性地举例说明藻红蛋白的结合数据与组成人工受体的结构单元的logP的相关性。图30示意性地举例说明一个比较两组数据的二维作图,一组数据来自与藻红蛋白接触或结合的候选人工受体,另一组来自与牛血清白蛋白荧光衍生物接触或结合的候选人工受体。图31、32和33示意性地举例说明分别来自图16、20和18的数据子集,并证明按照本专利技术制备的人工受体阵列产生了被三种分析物所区分的受体,这三种分析物是藻红蛋白、牛血清白蛋白和卵清蛋白。图34示意性地举例说明对照板扫描荧光信号的灰度图,对照板通过在与试验配体孵育前用有机溶剂洗脱结构单元来制备。图35示意性地举例说明实验板扫描荧光信号的灰度图,实验板通过在23℃下与1.0μg/ml霍乱毒素B共同孵育而制备。图36示意性地举例说明实验板扫描荧光信号的灰度图,实验板通过在3℃下与1.0μg/ml霍乱毒素B共同孵育而制备。图37示意性地举例说明实验板扫描荧光信号的灰度图,实验板通过在43℃下与1.0μg/ml霍乱毒素B共同孵育而制备。图38-40示意性地举例说明对荧光信号的作图,该荧光信号来自图35-37所示的候选人工受体。图41示意性地举例说明对荧光信号的作图,该荧光信号来自本研究中所用结构单元本文档来自技高网...
【技术保护点】
制备异质结构单元阵列的方法,该方法包括: 在固相支持体上形成多个点,这些点包括多个结构单元; 将多个结构单元偶联到所述点中的所述固相支持体上; 其中一个或多个结构单元独立地包含: 一个或多个羧基,胺,羟基,酚,羰基或硫醇基; 一个或多个部分具有正电荷、负电荷、酸、碱、电子受体、电子供体、氢键供体、氢键受体、自由电子对、π电子、电荷极化、亲水性、或亲脂部分。
【技术特征摘要】
【国外来华专利技术】...
【专利技术属性】
技术研发人员:RE卡尔森,
申请(专利权)人:受体有限责任公司,
类型:发明
国别省市:US[美国]
还没有人留言评论。发表了对其他浏览者有用的留言会获得科技券。