一种用于预测原发性乳腺癌发生风险的DNA甲基化标记物及其筛选方法和应用技术

本发明专利技术公开了一种用于预测原发性乳腺癌发生风险的DNA甲基化标记物及其筛选方法和应用。所述方法包括以下步骤：(1)对样本数据进行甲基化分析，获得与预测原发性乳腺癌发生风险相关的甲基化位点；(2)获得针对所述甲基化位点的甲基化Beta值；(3)基于所述甲基化位点的甲基化Beta值构建原发性乳腺癌发生风险预测模型，并通过计算比值比验证该模型的可行性；(4)采用机器学习方法构建基于所述甲基化位点的原发性乳腺癌发生风险预测模型，计算比值比、AUC、召回率、精确率和F1值，与步骤(3)的预测模型进行相互验证；(5)所述预测模型中甲基化探针对应的甲基化位点即为DNA甲基化标记物。本发明专利技术可提高原发性乳腺癌的检出率，适于大规模推广应用。

【技术实现步骤摘要】
一种用于预测原发性乳腺癌发生风险的DNA甲基化标记物及其筛选方法和应用
本专利技术涉及生物
，具体涉及一种用于预测原发性乳腺癌发生风险的DNA甲基化标记物及其筛选方法和应用。
技术介绍
乳腺癌位居全球女性恶性肿瘤发病率首位，是全世界女性最常见的恶性肿瘤之一。根据2012年数据，乳腺癌发病共1,700,000例，死亡超过500,000例。在中国，每年约268,000名女性诊断为乳腺癌，其中约70,000例患者死于乳腺癌，约占全部女性新诊断恶性肿瘤的15％和女性癌症相关死亡人数的7％(TorreLA,BrayF,SiegelRL,etal.Globalcancerstatistics,2012[J].CA:acancerjournalforclinicians,2015,65(2):87-108；J.A,Merino,Bonilla,etal.Breastcancerinthe21stcentury:Fromearlydetectiontonewtherapies[J].Radiología(EnglishEdition),2017.本文档来自技高网...

【技术保护点】
1.一种用于预测原发性乳腺癌发生风险的DNA甲基化标记物的筛选方法，其特征在于，包括以下步骤：/n(1)对样本数据进行甲基化分析，获得与预测原发性乳腺癌发生风险相关的甲基化位点；/n(2)获得针对所述甲基化位点的甲基化Beta值；/n(3)基于所述甲基化位点的甲基化Beta值构建原发性乳腺癌发生风险预测模型，并通过计算比值比验证该模型的可行性；/n(4)采用机器学习方法构建基于所述甲基化位点的原发性乳腺癌发生风险预测模型，计算比值比、AUC、召回率、精确率和F1值，与步骤(3)的预测模型进行相互验证；/n(5)所述步骤(3)和步骤(4)的预测模型中甲基化探针对应的甲基化位点即为DNA甲基化标记...

【技术特征摘要】
1.一种用于预测原发性乳腺癌发生风险的DNA甲基化标记物的筛选方法，其特征在于，包括以下步骤：
(1)对样本数据进行甲基化分析，获得与预测原发性乳腺癌发生风险相关的甲基化位点；
(2)获得针对所述甲基化位点的甲基化Beta值；
(3)基于所述甲基化位点的甲基化Beta值构建原发性乳腺癌发生风险预测模型，并通过计算比值比验证该模型的可行性；
(4)采用机器学习方法构建基于所述甲基化位点的原发性乳腺癌发生风险预测模型，计算比值比、AUC、召回率、精确率和F1值，与步骤(3)的预测模型进行相互验证；
(5)所述步骤(3)和步骤(4)的预测模型中甲基化探针对应的甲基化位点即为DNA甲基化标记物。


2.根据权利要求1所述的DNA甲基化标记物的筛选方法，其特征在于，与预测原发性乳腺癌发生风险相关的甲基化位点及其对应的甲基化探针如下表所示：








3.根据权利要求1所述的DNA甲基化标记物的筛选方法，其特征在于，所述步...

【专利技术属性】
技术研发人员：张红雨，全源，佟馨宇，李姜，黄清，
申请(专利权)人：武汉百药联科科技有限公司，华中农业大学，
类型：发明
国别省市：湖北;42