【技术实现步骤摘要】
用于快速检测烟曲霉的序列、试剂盒、方法及应用
本专利技术属于生物化学领域,具体涉及曲霉菌检测方法,特别是一种用于快速检测烟曲霉的序列、试剂盒、方法及应用。
技术介绍
侵袭性肺曲霉病(invasivepulmonaryaspergillosis,IPA)是指曲霉菌菌丝生长侵入肺实质而引起的感染性疾病,具有发病急性、进展迅速、病死率高的特点。烟曲霉是引起IPA最常见的病原菌,文献报道若IPA肺炎症状发生10天后抗真菌治疗,患者死亡率高达90%,而早期抗真菌治疗的死亡率可降低至41%。快速准确鉴定烟曲霉能指导临床选择抗真菌药、争取治疗时间。早期诊断和及时治疗是良好预后的关键。但由于该病缺乏典型的临床表现,早期诊断尤为困难。实验室曲霉菌的鉴定方法主要有病原体分离培养、病理组织鉴定、免疫学检测、核酸检测。但是传统的病原体分离培养耗时长、阳性率低。而病理组织鉴定受到样本采集的限制、免疫学检测灵敏度不高,不能够区分不同的菌种,因此不能鉴定是否烟曲霉感染,而且常常发生假阳性或假阴性。核酸检测方法主要以近就广泛应用的聚合酶链反应(PC ...
【技术保护点】
1.一种用于快速检测烟曲霉的序列,其包括烟曲霉-crRNA序列、以及相应的带有T7启动子的RPA扩增引物序列,其中,所述烟曲霉-crRNA序列的核苷酸序列如SEQ ID NO.1所示,所述RPA扩增引物序列的正向引物核苷酸序列如SEQ ID NO.2所示,所述RPA扩增引物序列的反向引物核苷酸序列如SEQ ID NO.3所示。/n
【技术特征摘要】
1.一种用于快速检测烟曲霉的序列,其包括烟曲霉-crRNA序列、以及相应的带有T7启动子的RPA扩增引物序列,其中,所述烟曲霉-crRNA序列的核苷酸序列如SEQIDNO.1所示,所述RPA扩增引物序列的正向引物核苷酸序列如SEQIDNO.2所示,所述RPA扩增引物序列的反向引物核苷酸序列如SEQIDNO.3所示。
2.根据权利要求1所述的序列,其特征在于,所述RPA扩增引物序列的终浓度为0.1~1μmol/L,所述烟曲霉-crRNA的终浓度为20~200nmol/L。
3.一种试剂盒,其含有根据权利要求1或2所述的用于快速检测烟曲霉的序列,还含有RPA酶预混液、信号报告探针、LwCas13a蛋白、醋酸镁、T7RNA聚合酶混合液和NTP缓冲液混合液。
4.根据权利要求3所述的试剂盒,其特征在于,所述RPA酶预混液中含有磷酸肌酸、肌酸激酶、dNTPs、ATP、DTT、醋酸钾、重组酶uxsX、重组酶uxsY、单链结合蛋白和Bsu聚合酶。
5.一种快速检测烟曲霉的方法,其特征在于包括以下步骤:
步骤一:提取待检测样本的DNA;
步骤二:利用RPA和CRISPR一步法检测体系对烟曲霉核酸进行扩增和信号检测,其中使用根据权利要求1或2所述的用于快速检测烟曲霉的序列。
6....
【专利技术属性】
技术研发人员:叶枫,李征途,李少强,占扬清,成静,
申请(专利权)人:广州医科大学附属第一医院,广州呼吸健康研究院,
类型:发明
国别省市:广东;44
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