一套基于KASP的SNP标记及其应用制造技术

技术编号:24699090 阅读:86 留言:0更新日期:2020-06-30 22:58
本发明专利技术提供了一套基于KASP的SNP标记及其应用,属于分子生物学、种质资源学和分子育种技术领域,所述SNP标记包括CigarSNP01‑1、CigarSNP01‑2、CigarSNP02‑1等共48个标记。采用本发明专利技术提供的SNP标记,完成雪茄烟SNP指纹图谱构建工作,能系统鉴定现有雪茄烟资源,并剔除重复收集的资源,建立雪茄烟品种知识产权保护机制。利用本发明专利技术提供的SNP标记筛选鉴定新收集的雪茄烟资源,审定新培育的雪茄烟品种,并利用到雪茄烟育种工作中。

A set of SNP markers based on kasp and its application

【技术实现步骤摘要】
一套基于KASP的SNP标记及其应用
本专利技术属于分子生物学、种质资源学和分子育种
,尤其涉及一套基于KASP的SNP标记及其应用。
技术介绍
雪茄烟因其独有的风格特色、深厚的文化内涵和更高的吸食安全性,吸引着越来越多的消费者,近年来国内外市场需求日益增长,产业前景广阔。但是,我国雪茄烟研究工作起步晚,基础研究落后,各研究单位引进、收集、交换的雪茄烟资源、品种众多,存在同种异名或者同名异种的现象,非常不利于雪茄烟资源的管理和利用。且雪茄烟具体遗传背景尚不清楚,不能够有效快速的进行雪茄烟常规育种和分子育种工作。因此,对这些资源构建指纹图谱,剔除重复收集、引进的资源,为每份资源赋予独有的身份信息,对雪茄烟资源收集鉴定和品种分子审定意义重大。目前,烟草种质资源依然采用第二代分子标记来进行指纹图谱构建工作。随着分子标记技术和第二代测序技术的快速发展,SNP标记和基因组学理论、方法不断深入到种质资源多样性检测和指纹图谱构建工作中。由于SNP标记具有覆盖全基因组、通量高、位点特异、共显性遗传、错误率低、开发和检测成本低等诸多优势,未来将成为高通量种质资源检测的重要标记类型。近年来,SNP标记已经广泛应用于小麦、水稻、玉米等大宗作物的指纹图谱构建和遗传进化分析上,目前尚未见到基于KASP技术的SNP分子标记来进行雪茄烟资源鉴定和品种审定的报导。
技术实现思路
有鉴于此,本专利技术的目的在于提供一套基于KASP的SNP标记及其应用,采用本专利技术提供的SNP标记,完成雪茄烟SNP指纹图谱构建工作,能系统鉴定现有雪茄烟资源,并剔除重复收集的资源,建立雪茄烟品种知识产权保护机制。利用本专利技术提供的SNP标记筛选鉴定新收集的雪茄烟资源,审定新培育的雪茄烟品种,并利用到雪茄烟育种工作中。为了实现上述专利技术目的,本专利技术提供了以下技术方案:本专利技术提供了一套基于KASP的SNP标记,所述SNP标记包括CigarSNP01-1、CigarSNP01-2、CigarSNP02-1、CigarSNP02-2、CigarSNP03-1、CigarSNP03-2、CigarSNP04-1、CigarSNP04-2、CigarSNP05-1、CigarSNP06-1、CigarSNP06-2、CigarSNP07-1、CigarSNP07-2、CigarSNP08-1、CigarSNP09-1、CigarSNP09-2、CigarSNP10-1、CigarSNP10-2、CigarSNP11-1、CigarSNP11-2、CigarSNP11-3、CigarSNP12-1、CigarSNP12-2、CigarSNP12-3、CigarSNP13-1、CigarSNP13-2、CigarSNP14-1、CigarSNP15-1、CigarSNP15-2、CigarSNP16-1、CigarSNP16-2、CigarSNP17-1、CigarSNP17-2、CigarSNP18-1、CigarSNP18-2、CigarSNP19-1、CigarSNP19-2、CigarSNP20-1、CigarSNP20-2、CigarSNP20-3、CigarSNP21-1、CigarSNP22-1、CigarSNP22-2、CigarSNP23-1、CigarSNP23-2、CigarSNP23-3、CigarSNP24-1和CigarSNP24-2。优选的,所述CigarSNP01-1位于雪茄的染色体Nt01上,物理位置为20189161;所述CigarSNP01-2位于雪茄的染色体Nt01上,物理位置为127733497;所述CigarSNP02-1位于雪茄的染色体Nt02上,物理位置为108245254;所述CigarSNP02-2位于雪茄的染色体Nt02上,物理位置为87338587;所述CigarSNP03-1位于雪茄的染色体Nt03上,物理位置为5854407;所述CigarSNP03-2位于雪茄的染色体Nt03上,物理位置为20901328;所述CigarSNP04-1位于雪茄的染色体Nt04上,物理位置为101426258;所述CigarSNP04-2位于雪茄的染色体Nt04上,物理位置为44511003;所述CigarSNP05-1位于雪茄的染色体Nt05上,物理位置为24187234;所述CigarSNP06-1位于雪茄的染色体Nt06上,物理位置为20171212;所述CigarSNP06-2位于雪茄的染色体Nt06上,物理位置为99243063;所述CigarSNP07-1位于雪茄的染色体Nt07上,物理位置为59134911;所述CigarSNP07-2位于雪茄的染色体Nt07上,物理位置为91456765;所述CigarSNP08-1位于雪茄的染色体Nt08上,物理位置为68017703;所述CigarSNP09-1位于雪茄的染色体Nt09上,物理位置为100690577;所述CigarSNP09-2位于雪茄的染色体Nt09上,物理位置为96986746;所述CigarSNP10-1位于雪茄的染色体Nt10上,物理位置为51896682;所述CigarSNP10-2位于雪茄的染色体Nt10上,物理位置为115185980;所述CigarSNP11-1位于雪茄的染色体Nt11上,物理位置为66259728;所述CigarSNP11-2位于雪茄的染色体Nt11上,物理位置为23822295;所述CigarSNP11-3位于雪茄的染色体Nt11上,物理位置为57168417;所述CigarSNP12-1位于雪茄的染色体Nt12上,物理位置为125890111;所述CigarSNP12-2位于雪茄的染色体Nt12上,物理位置为31687315;所述CigarSNP12-3位于雪茄的染色体Nt12上,物理位置为25943135;所述CigarSNP13-1位于雪茄的染色体Nt13上,物理位置为86466436;所述CigarSNP13-2位于雪茄的染色体Nt13上,物理位置为86466436;所述CigarSNP13-2位于雪茄的染色体Nt13上,物理位置为86466436;所述CigarSNP14-1位于雪茄的染色体Nt14上,物理位置为23358247;所述CigarSNP15-1位于雪茄的染色体Nt15上,物理位置为86671490;所述CigarSNP15-2位于雪茄的染色体Nt15上,物理位置为78242076;所述CigarSNP16-1位于雪茄的染色体Nt16上,物理位置为65433447;所述CigarSNP16-2位于雪茄的染色体Nt16上,物理位置为9110774;所述CigarSNP17-1位于雪茄的染色体Nt17上,物理位置为72622941;所述CigarSN本文档来自技高网...

【技术保护点】
1.一套基于KASP的SNP标记,其特征在于,所述SNP标记包括CigarSNP01-1、CigarSNP01-2、CigarSNP02-1、CigarSNP02-2、CigarSNP03-1、CigarSNP03-2、CigarSNP04-1、CigarSNP04-2、CigarSNP05-1、CigarSNP06-1、CigarSNP06-2、CigarSNP07-1、CigarSNP07-2、CigarSNP08-1、CigarSNP09-1、CigarSNP09-2、CigarSNP10-1、CigarSNP10-2、CigarSNP11-1、CigarSNP11-2、CigarSNP11-3、CigarSNP12-1、CigarSNP12-2、CigarSNP12-3、CigarSNP13-1、CigarSNP13-2、CigarSNP14-1、CigarSNP15-1、CigarSNP15-2、CigarSNP16-1、CigarSNP16-2、CigarSNP17-1、CigarSNP17-2、CigarSNP18-1、CigarSNP18-2、CigarSNP19-1、CigarSNP19-2、CigarSNP20-1、CigarSNP20-2、CigarSNP20-3、CigarSNP21-1、CigarSNP22-1、CigarSNP22-2、CigarSNP23-1、CigarSNP23-2、CigarSNP23-3、CigarSNP24-1和CigarSNP24-2。/n...

【技术特征摘要】
1.一套基于KASP的SNP标记,其特征在于,所述SNP标记包括CigarSNP01-1、CigarSNP01-2、CigarSNP02-1、CigarSNP02-2、CigarSNP03-1、CigarSNP03-2、CigarSNP04-1、CigarSNP04-2、CigarSNP05-1、CigarSNP06-1、CigarSNP06-2、CigarSNP07-1、CigarSNP07-2、CigarSNP08-1、CigarSNP09-1、CigarSNP09-2、CigarSNP10-1、CigarSNP10-2、CigarSNP11-1、CigarSNP11-2、CigarSNP11-3、CigarSNP12-1、CigarSNP12-2、CigarSNP12-3、CigarSNP13-1、CigarSNP13-2、CigarSNP14-1、CigarSNP15-1、CigarSNP15-2、CigarSNP16-1、CigarSNP16-2、CigarSNP17-1、CigarSNP17-2、CigarSNP18-1、CigarSNP18-2、CigarSNP19-1、CigarSNP19-2、CigarSNP20-1、CigarSNP20-2、CigarSNP20-3、CigarSNP21-1、CigarSNP22-1、CigarSNP22-2、CigarSNP23-1、CigarSNP23-2、CigarSNP23-3、CigarSNP24-1和CigarSNP24-2。


2.根据权利要求1所述的SNP标记,其特征在于,所述CigarSNP01-1位于雪茄的染色体Nt01上,物理位置为20189161;
所述CigarSNP01-2位于雪茄的染色体Nt01上,物理位置为127733497;
所述CigarSNP02-1位于雪茄的染色体Nt02上,物理位置为108245254;
所述CigarSNP02-2位于雪茄的染色体Nt02上,物理位置为87338587;
所述CigarSNP03-1位于雪茄的染色体Nt03上,物理位置为5854407;
所述CigarSNP03-2位于雪茄的染色体Nt03上,物理位置为20901328;
所述CigarSNP04-1位于雪茄的染色体Nt04上,物理位置为101426258;
所述CigarSNP04-2位于雪茄的染色体Nt04上,物理位置为44511003;
所述CigarSNP05-1位于雪茄的染色体Nt05上,物理位置为24187234;
所述CigarSNP06-1位于雪茄的染色体Nt06上,物理位置为20171212;
所述CigarSNP06-2位于雪茄的染色体Nt06上,物理位置为99243063;
所述CigarSNP07-1位于雪茄的染色体Nt07上,物理位置为59134911;
所述CigarSNP07-2位于雪茄的染色体Nt07上,物理位置为91456765;
所述CigarSNP08-1位于雪茄的染色体Nt08上,物理位置为68017703;
所述CigarSNP09-1位于雪茄的染色体Nt09上,物理位置为100690577;
所述CigarSNP09-2位于雪茄的染色体Nt09上,物理位置为96986746;
所述CigarSNP10-1位于雪茄的染色体Nt10上,物理位置为51896682;
所述CigarSNP10-2位于雪茄的染色体Nt10上,物理位置为115185980;
所述CigarSNP11-1位于雪茄的染色体Nt11上,物理位置为66259728;
所述CigarSNP11-2位于雪茄的染色体Nt11上,物理位置为23822295;
所述CigarSNP11-3位于雪茄的染色体Nt11上,物理位置为57168417;
所述CigarSNP12-1位于雪茄的染色体Nt12上,物理位置为125890111;
所述CigarSNP12-2位于雪茄的染色体Nt12上,物理位置为31687315;
所述CigarSNP12-3位于雪茄的染色体Nt12上,物理位置为25943135;
所述CigarSNP13-1位于雪茄的染色体Nt13上,物理位置为86466436;
所述CigarSNP13-2位于雪茄的染色体Nt13上,物理位置为86466436;
所述CigarSNP13-2位于雪茄的染色体Nt13上,物理位置为86466436;
所述CigarSNP14-1位于雪茄的染色体Nt14上,物理位置为23358247;
所述CigarSNP15-1位于雪茄的染色体Nt15上,物理位置为86671490;
所述CigarSNP15-2位于雪茄的染色体Nt15上,物理位置为78242076;
所述CigarSNP16-1位于雪茄的染色体Nt16上,物理位置为65433447;
所述CigarSNP16-2位于雪茄的染色体Nt16上,物理位置为9110774;
所述CigarSNP17-1位于雪茄的染色体Nt17上,物理位置为72622941;
所述CigarSNP17-2位于雪茄的染色体Nt17上,物理位置为195888994;
所述CigarSNP18-1位于雪茄的染色体Nt18上,物理位置为10034161;
所述CigarSNP18-2位于雪茄的染色体Nt18上,物理位置为61973096;
所述CigarSNP19-1位于雪茄的染色体Nt19上,物理位置为137571210;
所述CigarSNP19-2位于雪茄的染色体Nt19上,物理位置为22172908;
所述C...

【专利技术属性】
技术研发人员:刘国祥吕洪坤张兴伟李媛向小华刘好宝戴培刚佟英杨爱国冯全福
申请(专利权)人:中国农业科学院烟草研究所中国烟草总公司海南省公司
类型:发明
国别省市:山东;37

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