【技术实现步骤摘要】
用于病原核酸扩增的引物组、病原核酸检测文库构建方法和病原检测方法
本专利技术涉及病原检测
,具体涉及一种用于病原核酸扩增的引物组、病原核酸检测文库构建方法和病原检测方法。
技术介绍
随着高通量测序技术的进步,测序服务对象和应用细分领域不断拓展,高通量测序的市场规模不断增大。高通量测序技术在病原微生物分型检测、病原微生物鉴定及细菌耐药监测方面进入快速发展,应用前景广阔。(一)病原微生物分型检测方面,例如人乳头瘤病毒核酸分型检测。宫颈癌是全球女性的第二位高发癌,其发病主要与高危型人乳头瘤病毒(HPV)的持续感染有关。每年约有50万新发病例,25万死亡病例,其中发展中国家占2/3。目前已经鉴定出超过200多种HPV型别,其中超过100多种HPV型别会感染皮肤、呼吸道和肛门生殖道粘膜,超过40种HPV型别会感染子宫颈。基于诱导病变的危险程度,可将HPV区分为低危型(例如:HPV6、11、42、43、44型等)和高危型(例HPV16、18、31、33、35、39、45、51、52、56、58、59、68型等)。因 ...
【技术保护点】
1.一种用于病原核酸扩增的引物组,其特征在于,所述引物组包括至少一对多重扩增引物,所述多重扩增引物包括正向引物和反向引物,每条正向引物和反向引物的结构包括通用引物扩增结构序列、样本标签序列和病原核酸特异性结合序列,所述通用引物扩增结构序列用于通用引物扩增,所述样本标签序列用于识别样本来源,所述病原核酸特异性结合序列用于特异性结合病原核酸目标区域。/n
【技术特征摘要】
1.一种用于病原核酸扩增的引物组,其特征在于,所述引物组包括至少一对多重扩增引物,所述多重扩增引物包括正向引物和反向引物,每条正向引物和反向引物的结构包括通用引物扩增结构序列、样本标签序列和病原核酸特异性结合序列,所述通用引物扩增结构序列用于通用引物扩增,所述样本标签序列用于识别样本来源,所述病原核酸特异性结合序列用于特异性结合病原核酸目标区域。
2.根据权利要求1所述的引物组,其特征在于,所述正向引物和反向引物的结构从5’端至3’端依次包括所述通用引物扩增结构序列、所述样本标签序列和所述病原核酸特异性结合序列。
3.根据权利要求1所述的引物组,其特征在于,所述引物组还包括至少一对通用扩增引物,所述通用扩增引物包括正向引物和反向引物,所述正向引物包括与所述多重扩增引物的通用引物扩增结构序列至少部分互补或相同的序列,所述反向引物包括与所述多重扩增引物的通用引物扩增结构序列至少部分互补或相同的序列、文库标签序列以及任选存在的用于环化反应和/或测序所需的结构序列,其中,所述文库标签序列用于识别文库样本来源,所述文库样本是所述多重扩增引物的扩增产物。
4.根据权利要求3所述的引物组,其特征在于,所述通用扩增引物中的反向引物的结构从3’端至5’端依次包括与所述多重扩增引物的通用引物扩增结构序列至少部分互补或相同的序列、所述文库标签序列以及任选存在的用于环化反应和/或测序所需的结构序列。
5.根据权利要求1所述的引物组,其特征在于,所述通用引物扩增结构序列选自LP-F或LP-R所示的任一序列:
LP-F:GACCGCTTGGCCTCCGACTT;
LP-R:ACATGGCTACGATCCGACTT。
6.根据权利要求3所述的引物组,其特征在于,所述通用扩增引物的反向引物...
【专利技术属性】
技术研发人员:邹婧,欧日晶,聂自豪,万纯,
申请(专利权)人:深圳华大智造科技有限公司,
类型:发明
国别省市:广东;44
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