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DNA分子大小测量方法技术

技术编号:24196608 阅读:90 留言:0更新日期:2020-05-20 11:12
一种DNA分子大小测量方法,包括下列步骤:提供一DNA分子大小测量装置,包括:一覆盖基板;一基板,设置于覆盖基板上且包括一第一孔洞及一第二孔洞;以及一第一狭缝型流道,设置于覆盖基板与基板间,其中第一狭缝型流道的两端分别与第一孔洞及第二孔洞连接;通过第一孔洞加入包括一DNA分子的一样品于第一狭缝型流道,其中DNA分子由第一孔洞朝第二孔洞的方向移动;探测及记录DNA分子的分布的强度及面积;以及分析强度及面积,以得到DNA分子的大小。

DNA molecular size measurement method

【技术实现步骤摘要】
DNA分子大小测量方法
本专利技术涉及一种DNA分子大小测量方法。特别是,本专利技术涉及一种可测量具有千碱基对(basepair)至百万碱基对的DNA分子大小的方法。
技术介绍
DNA分子大小测量为目前分子生物研究的重要及常见的步骤;特别是,对于DNA指纹分析(DNAfingerprinting)、限制酶定位法(restrictionmapping)、流行病基因型分型(epidemiologicgenotyping)及次世代定序的使用而言为必需的步骤。然而,目前各种分离步骤对于长度约1,000~10,000,000碱基对(kbp~10Mbp)的大DNA片段的分子大小测量,仍存在有许多挑战。凝胶电泳(Gelelectrophoresis)及脉冲场凝胶电泳(Pulsed-fieldgelelectrophoresis(PFGE))分别为分离分子量小的DNA(<kbp)及大的DNA(>kbp)的标准方法。虽然PFGE可使用随时间变化的驱动电压,以随着长的DNA移动而展开DNA来分离DNA,但此方法须14小时以分离50kbp的DNA,故相当耗时本文档来自技高网...

【技术保护点】
1.一种DNA分子大小测量方法,包括下列步骤:/n提供一DNA分子大小测量装置,包括:/n一覆盖基板;/n一基板,设置于该覆盖基板上且包括一第一孔洞及一第二孔洞;以及/n一第一狭缝型流道,设置于该覆盖基板与该基板间,其中该第一狭缝型流道的两端分别与该第一孔洞及该第二孔洞连接;/n通过该第一孔洞加入包括一DNA分子的一样品于该第一狭缝型流道,其中该DNA分子由该第一孔洞朝该第二孔洞的方向移动;/n探测及记录该DNA分子的分布的强度及面积;以及/n分析该强度及该面积,以得到该DNA分子的大小。/n

【技术特征摘要】
20181109 US 62/757,7901.一种DNA分子大小测量方法,包括下列步骤:
提供一DNA分子大小测量装置,包括:
一覆盖基板;
一基板,设置于该覆盖基板上且包括一第一孔洞及一第二孔洞;以及
一第一狭缝型流道,设置于该覆盖基板与该基板间,其中该第一狭缝型流道的两端分别与该第一孔洞及该第二孔洞连接;
通过该第一孔洞加入包括一DNA分子的一样品于该第一狭缝型流道,其中该DNA分子由该第一孔洞朝该第二孔洞的方向移动;
探测及记录该DNA分子的分布的强度及面积;以及
分析该强度及该面积,以得到该DNA分子的大小。


2.如权利要求1所述的方法,其中该DNA分子的分布的强度及面积是以下式(I-1)进行分析:
S=A×(I-I0)/m;(I-1)
其中,I0为该强度的一平均强度的一最小值,m为该强度及该面积的图的线性拟合的斜率,A为该面积,I为该平均强度,而S为该DNA分子的有效大小。


3.如权利要求2所述的方法,其中该DNA分子的有效大小与该DNA分子的大小成正比。


4.如权利要求1所述的方法,其中该DNA分子大小测量装置还包括一第二狭缝型流道,设置于该覆盖基板与该基板间,其中该第二狭缝型流道的两端分别与该基板的一第三孔洞及一第四孔洞连接,且该方法包括下列步骤:
在加入包括该DNA分子的该样品时,通过该第三孔洞加入包括参考DNA分子的一DNA梯状条带于该第二狭缝型流道,其中该参考DNA分子由该第三孔洞朝该第四孔洞的方向移动;
探测及记录该DNA梯状条带中的该参考DNA分子的分布的强度及面积;以及
分析该DNA梯状条带中的该参考DNA分子的分布的强度及面积。


5.如权利要求4所述的方法,其中该参考DNA分子的分布的强度及面积与该DNA分子的分布的强度及面积,分别以下式(I-1)进行分析:
S=A×(I-I0)/m;(I-1)
其中,I0为该参考DNA分子的强度的平均强度的最小值或该DN...

【专利技术属性】
技术研发人员:周家复叶佳唯林以立
申请(专利权)人:中央研究院
类型:发明
国别省市:中国台湾;71

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