MdARF3基因启动子缺失片段及其在检测苹果属植物矮化中的应用制造技术

本发明专利技术公开了MdARF3基因启动子缺失片段及其在检测苹果属植物矮化中的应用。本发明专利技术提供了检测苹果属植物的砧木致矮能力的方法，包括：检测待测苹果属植物的基因组中是否含有MdARF3基因启动子缺失片段，基因组中不含有MdARF3基因启动子缺失片段的待测苹果属植物的砧木致矮能力高于基因组中含有MdARF3基因启动子缺失片段的待测苹果属植物；所述MdARF3基因启动子缺失片段为苹果属植物基因组MdARF3基因起始密码子ATG中的A的上游方向第‑1061位至第‑992位。MdARF3基因启动子片段缺失现象与矮化性状正相关，利用该片段的缺失和存在可快速筛选后代中的矮化植株，在植物的矮化性领域中具有重要意义。

Deletion of the promoter of mdarf3 gene and its application in the detection of dwarfing in Malus

【技术实现步骤摘要】
MdARF3基因启动子缺失片段及其在检测苹果属植物矮化中的应用
本专利技术属于生物
，涉及MdARF3基因启动子缺失片段及其在检测苹果属植物矮化中的应用。
技术介绍
苹果矮化密植栽培因具有结果早、品质好、管理方便、品种更新快、经济效益高等优点，已成为现代苹果生产发展的趋势。到目前为止，矮化砧木的利用仍是实现苹果矮化密植栽培的主要途径。苹果矮化砧木的致矮机制可能是在根系与地上部之间细胞分裂素和生长素相互调控的结果，即矮化砧木根系细胞分裂素合成的减少，造成了地上部细胞分裂素供应不足，从而导致树体营养生长减弱，引起地上部生长素合成减少。在苹果矮化自根砧M9根系的DNA中克隆得到生长素响应因子ARF3基因。该基因的mRNA全长为3905bp，包含10个外显子和9个内含子。该基因编码一个708个氨基酸的多肽，由3个结构域组成：1个氨基端的DNA结合结构域(DBD)，1个中间结构域(MR)，包括激活结构域(AD)和抑制结构域(RD)以及1个羟基末端的二聚结构域(CTD)。
技术实现思路
本专利技术的目的是提供一种M本文档来自技高网...

【技术保护点】
1.MdARF3基因启动子缺失片段作为分子标记在如下任一中的应用：/n(A1)检测或辅助检测苹果属植物的砧木致矮能力高低，或制备用于检测或辅助检测苹果属植物的砧木致矮能力高低的产品；/n(A2)检测或辅助检测苹果属植物矮化状态，或制备用于检测或辅助检测苹果属植物矮化状态的产品；/n(A3)检测或辅助检测待测苹果属植物是否为矮化植物，或制备用于检测或辅助检测待测苹果属植物是否为矮化植物的产品；/n(A4)检测或辅助检测待测苹果属植物能否用作矮化砧木，或制备用于检测或辅助检测待测苹果属植物能否用作矮化砧木的产品；/n所述MdARF3基因启动子缺失片段为苹果属植物基因组MdARF3基因起始密码子AT...

【技术特征摘要】
1.MdARF3基因启动子缺失片段作为分子标记在如下任一中的应用：
(A1)检测或辅助检测苹果属植物的砧木致矮能力高低，或制备用于检测或辅助检测苹果属植物的砧木致矮能力高低的产品；
(A2)检测或辅助检测苹果属植物矮化状态，或制备用于检测或辅助检测苹果属植物矮化状态的产品；
(A3)检测或辅助检测待测苹果属植物是否为矮化植物，或制备用于检测或辅助检测待测苹果属植物是否为矮化植物的产品；
(A4)检测或辅助检测待测苹果属植物能否用作矮化砧木，或制备用于检测或辅助检测待测苹果属植物能否用作矮化砧木的产品；
所述MdARF3基因启动子缺失片段为苹果属植物基因组MdARF3基因起始密码子ATG中的A的上游方向第-1061位至第-992位；以MdARF3基因起始密码子ATG中的A记作第+1位。


2.用于检测MdARF3基因启动子缺失片段的物质在如下任一中的应用：
(A1)检测或辅助检测苹果属植物的砧木致矮能力高低，或制备用于检测或辅助检测苹果属植物的砧木致矮能力高低的产品；
(A2)检测或辅助检测苹果属植物矮化状态，或制备用于检测或辅助检测苹果属植物矮化状态的产品；
(A3)检测或辅助检测待测苹果属植物是否为矮化植物，或制备用于检测或辅助检测待测苹果属植物是否为矮化植物的产品；
(A4)检测或辅助检测待测苹果属植物能否用作矮化砧木，或制备用于检测或辅助检测待测苹果属植物能否用作矮化砧木的产品；
所述MdARF3基因启动子缺失片段为苹果属植物基因组MdARF3基因起始密码子ATG中的A的上游方向第-1061位至第-992位；以MdARF3基因起始密码子ATG中的A记作第+1位。


3.根据权利要求2所述的应用，其特征在于：所述用于检测MdARF3基因启动子缺失片段的物质为用于扩增所述MdARF3基因启动子缺失片段的引物对。


4.根据权利要求3所述的应用，其特征在于：所述引物对中的上游引物根据苹果属植物基因组中位于所述MdARF3基因启动子缺失片段上游的序列设计，下游引物根据苹果属植物基因组中位于所述MdARF3基因启动子缺失片段下游的序列设计；
进一步地，所述引物对由SEQIDNo.4所示的单链DNA分子和SEQIDNo.5所述的单链DNA分子组成。


5.如下任一方法：
方法1：一种检测或辅助检测苹果属植物的砧木致矮能力高低的方法，包括如下步骤(B1)和(B2)：
(B1)检测待测苹果属植物的基因组中是否含有MdARF3基因启动子缺失片段；
(B2)根据(B1)结果，按照如下确定所述待测苹果属植物的砧木致矮能力高低：基因组中不含有所述MdARF3基因启动子缺失片段的待测苹果属植物的砧木致矮能力高于或候选高于基因组中含有所述MdARF3基因启动子缺失片段的待测苹果属植物的砧木致矮能力；
所述MdARF3基因启动子缺失片段为苹果属植物基因组MdARF3基因起始密码子ATG中的A的上游方向第-1061位至第-992位；以MdARF3基因起始密码子ATG中的A记作第+1位；
方法2：一种检测或辅助检测苹果属植物矮化状态的方法，包括如下步骤(C1)和(C2)：
(C1)检测待测苹果属植物的基因组中是否含有MdARF3基因启动子缺失片段；
(C2)根据(C1)结果，按照如下(c1)和/或(c2)确定所述待测苹果属植物矮化状态：
(c1)基因组中不含有所述MdARF3基因启动子缺失片段的待测苹果属植物的株高低于或候选低于基因组中含有所述MdARF3基因启动子缺失片段的待测苹果属植物的株高；
(c2)基因组中不含有所述MdARF3基因启动子缺失片段的待测苹果属植物的主干直径小于或候选小于基因组中含有所述MdARF3基因启动子缺失片段的待测苹果属...

【专利技术属性】
技术研发人员：韩振海，冯轶，王忆，吕佳红，高敏，许雪峰，张新忠，吴婷，
申请(专利权)人：中国农业大学，
类型：发明
国别省市：北京;11