用于指导肾病综合征CYP3A5非表达型患儿使用他克莫司的多态性位点制造技术

本发明专利技术涉及生物医学领域，具体而言，用于指导肾病综合征CYP3A5非表达型患儿使用他克莫司的多态性位点。所多态性位点为IL2RA rs12722489、MYH9 rs2239781、MYH9 rs4821478、ACTN4 rs56113315、ACTN4 rs62121818、ACTN4 rs3745859以及INF2 rs1128880位点中的至少一种。这些位点与肾病综合征CYP3A5非表达型患儿的他克莫司药动学密切相关，且其检测属于外周血指标，可方便获取，方便将来推广使用。

The polymorphic site of tacrolimus used to guide the use of CYP3A5 non expression children with nephrotic syndrome

【技术实现步骤摘要】
用于指导肾病综合征CYP3A5非表达型患儿使用他克莫司的多态性位点
本专利技术涉及生物医学领域，具体而言，涉及用于指导肾病综合征CYP3A5非表达型患儿使用他克莫司的多态性位点。
技术介绍
他克莫司(FK506)是治疗儿童难治性肾病综合征的一线治疗药物。但是该药治疗窗窄(血药谷浓度需要控制在5～10ng/mL)、药动学个体差异大(口服生物利用度约为3％～77％，儿童半衰期约为8h～16.8h)，给药剂量难以把握，一直是困扰FK506临床用药的关键问题。临床医生往往需要进行1～3个月的“试错型”摸索，才能使患儿的FK506谷浓度达到合适的治疗范围内，患儿的疗效才能得到保障。而在如此长的时间内，患儿可能延误治疗导致肾脏的进一步损害，甚至可能出现重症感染、肾衰等严重并发症，并蒙受经济、身体、精神损失。因此，找出影响FK506药动学个体差异大的真正原因，挖掘能够准确预测FK506稳态血药浓度的生物标志物，建立FK506的前瞻性浓度预测模型，做到患者给药前就明确合适的初始剂量，是实现FK506个体化给药急需解决的关键问题。药物药动学个体差异产生的重要原因是编码相关药物代谢酶、转运体、药物靶点及相关表达调控因子的基因出现多态性所致。目前，国内外有关FK506个体化用药研究主要集中在器官、血液移植人群的药物代谢酶(CYP3A)、转运体(MDR1编码的P-gp)的基因多态性上。而对肾病综合征人群的研究很少，仅仅涉及到FK506的代谢酶编码基因CYP3A5*3、转运体编码基因MDR1C3435T、MDR11236C>T、MDR12677G>T/A等几个SNPs。而目前文献一致公认、且也获得器官移植指南推荐的仅是CYP3A5*3会显著影响FK506的血药浓度，其他SNPs对FK506的药动学的影响仍存在争议。而通过上述有限的几个SNPs并不能充分解释FK506的药动学个体差异。另外，肾病综合征是肾小球滤过膜通透性增加，血液中蛋白从尿中丢失从而导致血浆白蛋白降低、尿蛋白升高的综合征。而FK506是蛋白结合率约为99％的药物。因此，FK506在肾综人群中的药动学行为势必与健康人群、器官移植人群不同，FK506可能与血浆蛋白结合从损伤的肾小球滤过膜漏到尿液中，从而显著的改变了自身的药动学过程。那么肾小球滤过膜上相关蛋白的编码基因多态性是否会影响FK506的药动学呢？目前有文献报道了肾脏足细胞NPHS2R229Q多态性可能影响FK506的血药浓度。而尚未见肾小球其他足细胞相关蛋白编码基因多态性影响FK506的药动学的研究报道，也未见报道FK506代谢酶、转运体、靶蛋白的相关转录调控因子、炎症细胞因子的编码基因多态性对肾综患儿的FK506浓度的影响。因此，有必要挖掘上述SNPs对FK506血药浓度的影响，充分明确FK506药动学个体差异大的原因。找到可能影响FK506血药浓度的生物标志物后，建立浓度预测模型，才能给医生、药师提供一种可靠、方便的用药决策支持。目前，国内外相关研究大多仍采用传统分析方法如多重线性回归建立浓度模型，但传统方法对于多维度复杂变量模型的拟合欠佳、模型泛化性差等。仅有的群体药动学模型纳入的影响因素太少，仅仅纳入了年龄、体重及一个药动学位点(CYP3A5*3)，不足以解释实际临床浓度的个体差异。已有研究只用了传统的统计方法逻辑回归法来分析建模，而该方法不适用于一些复杂、多维、有相互作用的变量的建模，因而得到的模型拟合性能较差，存在欠拟合或过拟合的现象。此外群体药动学必须采集多个时间点的血标本，才能建立性能较佳的模型。这些临床结果或模型泛化性能差，难以推广。故而通过现有技术难以分析得到哪些基因多态性位点是主要影响FK506药物给药剂量的位点，进而无法给出准确的用药指导建议。
技术实现思路
传统的统计方法逻辑回归法来分析建模，而该方法不适用于一些复杂、多维、有相互作用的变量的建模。本专利技术首次采用机器学习算法建立并验证他克莫司稳定期稳态血药谷浓度的预测模型，该机器学习算法对数据进行更为合理的预处理和重要性排序，有效降低数据噪音；并且针对不同数据的特点将多种建模方法进行比对分析，从而找出在训练数据上表现优异(例如trainningerror足够小，且模型的VC维低、自由度适中)的机器学习模型。通过该方法，本专利技术首次能够对莫司药动学数据进行大规模复杂数据的高通量分析，并针对CYP3A5不同表达类型更为灵活、更有针对性地调整学习模型，从而首次实现较全面、精准地分析中国肾病综合征患儿的他克莫司药动学通路蛋白、药效学通路蛋白、肾病相关蛋白、转录调控因子等相关编码基因多态性与他克莫司稳定期血药谷浓度间的相关性，进而提供了一种肾病综合征CYP3A5非表达型患儿使用他克莫司的客观用药指导方法。具体的，本专利技术涉及IL2RArs12722489、MYH9rs2239781、MYH9rs4821478、ACTN4rs56113315、ACTN4rs62121818、ACTN4rs3745859以及INF2rs1128880位点中的至少一种的检测剂在制备用于肾病综合征CYP3A5非表达型患儿使用他克莫司的用药指导试剂盒中的应用。IL2RArs12722489、MYH9rs2239781、MYH9rs4821478、ACTN4rs56113315、ACTN4rs62121818、ACTN4rs3745859以及INF2rs1128880位点与肾病综合征CYP3A5非表达型患儿的他克莫司药动学密切相关，且其检测属于外周血指标，可方便获取，方便将来推广使用。附图说明为了更清楚地说明本专利技术具体实施方式或现有技术中的技术方案，下面将对具体实施方式或现有技术描述中所需要使用的附图作简单地介绍，显而易见地，下面描述中的附图是本专利技术的一些实施方式，对于本领域普通技术人员来讲，在不付出创造性劳动的前提下，还可以根据这些附图获得其他的附图。图1为本专利技术所用模型的构建和验证的流程示意图；图2为本专利技术一个实施例中CYP3A5非表达型人群中IL2RArs12722489不同基因型与CDR(他克莫司的剂量校正谷浓度)之间的关系；图3为本专利技术一个实施例中CYP3A5非表达型人群中MYH9rs2239781不同基因型与CDR之间的关系；图4为本专利技术一个实施例中CYP3A5非表达型人群中MYH9rs4821478不同基因型与CDR之间的关系；图5为本专利技术一个实施例中CYP3A5非表达型人群中ACTN4rs56113315不同基因型与CDR之间的关系；图6为本专利技术一个实施例中CYP3A5非表达型人群中ACTN4rs62121818不同基因型与CDR之间的关系；图7为本专利技术一个实施例中CYP3A5非表达型人群中ACTN4rs3745859不同基因型与CDR之间的关系；图8为本专利技术一个实施例中CYP3A5非表达型人群中INF2rs1128880不同基因型与CDR之间的关系；图9为本专利技术一个实施例中根据训练集和测试集R2绘制的最佳特征变量图。具本文档来自技高网...

【技术保护点】
1.IL2RA rs12722489、MYH9 rs2239781、MYH9 rs4821478、ACTN4 rs56113315、ACTN4rs62121818、ACTN4 rs3745859以及INF2 rs1128880位点中的至少一种的检测剂在制备用于肾病综合征CYP3A5非表达型患儿使用他克莫司的用药指导试剂盒中的应用。/n

【技术特征摘要】
1.IL2RArs12722489、MYH9rs2239781、MYH9rs4821478、ACTN4rs56113315、ACTN4rs62121818、ACTN4rs3745859以及INF2rs1128880位点中的至少一种的检测剂在制备用于肾病综合征CYP3A5非表达型患儿使用他克莫司的用药指导试剂盒中的应用。


2.根据权利要求1所述的应用，其特征在于，所述试剂盒中还含有可用于指导他克莫司用药的其他基因多态性位点的检测剂。


3.根据权利要求2所述的应用，其特征在于，所述其他基因多态性位点为CYP3A5*3。


4.根据权利要求1所述的应用，其特征在于，所述肾病综合征患儿的年龄在14岁以下。


5.根据权利要求4所述的应用，其特征在于，所述肾病综合征患儿的年龄在10岁以下。


6.根据权利要求1所述的应用，其特征在于，所述肾病...

【专利技术属性】
技术研发人员：莫小兰，李嘉丽，陈秀娟，黄民，梁会营，孙新，谭梅，何艳玲，
申请(专利权)人：广州市妇女儿童医疗中心，
类型：发明
国别省市：广东;44