In the invention, SSR molecular marker technology is used to develop and screen SSR primers with strong specificity and high polymorphism in orchid plants, and 120 orchid genomic DNA collected from 9 populations are detected by the selected primers to analyze their genetic diversity and population genetic characteristics. 91 SSR DNA sequences were obtained by magnetic bead enrichment method, and 72 primers were successfully designed to screen polymorphic primers. Finally, 8 primers with stable amplification, high specificity and polymorphism were screened out. The invention analyzes the genetic diversity of orchids from the molecular and morphological level, reveals the main source of the genetic differentiation of orchids, and conducts cluster analysis on 9 Wild Orchid populations collected in yuguichuan, so as to explain the influence of geographical location on the genetic differentiation of orchid populations.
【技术实现步骤摘要】
兰属植物SSR引物,及其在居群遗传多样性分析中的应用
本专利技术涉及分子标记领域,具体地说,涉及兰属植物SSR标记及其应用。
技术介绍
SSR也被称为STMS、SSRP,是一种微卫星标记。该技术也是以PCR技术为基础的,因其需要提前知道样本DNA序列,因此根据序列设计出的引物具有非常强的特异性。微卫星侧翼序列保守,通过PCR扩增后,并通过琼脂糖凝胶电泳或者聚丙烯酰胺凝胶电泳分离扩增产物以检测多态性。SSR标记的优点:(1)SSR技术是共显性标记,能够区分杂合子、纯合子,可获得较多信息;(2)多态性高、重复性好、稳定性强。缺点是实验成本高,耗时长,需要大量的人力物力,这也是限制SSR标记发展的一个重要原因。虽然SSR标记技术耗时费力,但因其极高的特异性而广受研究者的欢迎。刘艳丽将SSR分子标记应用到鉴别中草药伪品的研究中,SSR的长度差异以及等位基因数目的变化会显示出伪品与正品之间的差异。徐礼羿等采用SSR标记技术评估了大叶种茶树的遗传多样性以及居群结构,构想了大叶种茶树居群可能的来源。SSR标记普遍并广泛存在于植物基因组DNA中,因其重复单元的长度、数量等存在多态性,因此可以利用这种特性根据SSR序列两翼的保守序列设计引物,采用PCR技术在植物基因组DNA中扩增出具有多态性的DNA序列片段。SSR标记引物具有特异性,因此必须提前获取所研究植物的基因组序列,利用SSR标记搜索工具找到相对应的SSR标记,才能够设计出成对的具有特异性的SSR引物,因此SSR标记的开发是SSR分子标记技术的难点。由郭大龙对开发SSR标记的方法总结归纳得出:(1)从公共的DNA序列 ...
【技术保护点】
1.一种兰属植物SSR引物,其特征在于,选自下述引物对中的一对或多对,其中,引物对1的序列如SEQ ID No.1和SEQ ID No.2所示,引物对2的序列如SEQ ID No.3和SEQ ID No.4所示,引物对3的序列如SEQ ID No.5和SEQ ID No.6所示,引物对4的序列如SEQ ID No.7和SEQ ID No.8所示,引物对5的序列如SEQ ID No.9和SEQ ID No.10所示,引物对6的序列如SEQ ID No.11和SEQ ID No.12所示,引物对7的序列如SEQ ID No.13和SEQ ID No.14所示,引物对8的序列如SEQ ID No.15和SEQ ID No.16所示。
【技术特征摘要】
1.一种兰属植物SSR引物,其特征在于,选自下述引物对中的一对或多对,其中,引物对1的序列如SEQIDNo.1和SEQIDNo.2所示,引物对2的序列如SEQIDNo.3和SEQIDNo.4所示,引物对3的序列如SEQIDNo.5和SEQIDNo.6所示,引物对4的序列如SEQIDNo.7和SEQIDNo.8所示,引物对5的序列如SEQIDNo.9和SEQIDNo.10所示,引物对6的序列如SEQ...
【专利技术属性】
技术研发人员:李政,李志能,寇帅,眭顺照,李名扬,李先源,
申请(专利权)人:西南大学,
类型:发明
国别省市:重庆,50
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