多病毒特异性的T细胞免疫疗法制造技术

本文提供与多病毒特异性的T细胞免疫疗法相关的组合物和方法。

Multivirus-specific T-cell immunotherapy

【技术实现步骤摘要】
【国外来华专利技术】多病毒特异性的T细胞免疫疗法相关申请本申请要求于2016年7月18日提交的美国临时专利申请序列号62/363,669的优先权的权益，其特此通过引用被整体并入。背景过继性免疫疗法涉及将疾病特异性的细胞毒性T细胞(CTL)植入或输注入个体中，其目的是为了识别、靶向和破坏疾病相关性细胞。过继性免疫疗法已经成为用于治疗许多疾病和紊乱(包含癌症、感染性疾病和自身免疫疾病)的有希望的途径。概述在某些方面，本文提供与用于过继性免疫疗法的多病毒特异性的细胞毒性T细胞(CTL)的生成和应用有关的组合物和方法。在某些实施方案中，本文提供与核酸、运载体和重组腺病毒有关的组合物和方法，所述核酸、运载体和重组腺病毒含有编码来自不同病毒(例如，如多表位蛋白)的两个或更多个T细胞表位的核酸序列，所述来自不同病毒的两个或更多个T细胞表位由CTL识别，并且在病毒感染和/或癌症的预防和/或治疗中是有用的。在某些实施方案中，本文提供呈递来自不同病毒的两个或更多个T细胞表位的抗原呈递细胞(APC)。在一些实施方案中，本文提供CTL的群体，所述CTL的群体共同包括T细胞受体(TCR)，所述T细胞受体(TCR)识别来自不同病毒的两个或更多个T细胞表位。在某些方面，本文提供核酸运载体(例如，腺病毒表达运载体)和/或重组腺病毒，所述核酸运载体和/或重组腺病毒包括编码两个或更多个T细胞表位(例如，表1中列出的T细胞表位中的两个或更多个)的核酸序列，其中两个或更多个T细胞表位包括来自至少两种不同病毒(例如，EB病毒(EBV)、巨细胞病毒(CMV)、多瘤BK病毒(BKV)和/或腺病毒(ADV))的T细胞表位。在一些实施方案中，表位是HLAI类-限制性T细胞表位。在一些实施方案中，运载体或重组腺病毒编码至少2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29、30、31、32、33、34、35、36、37或38个T细胞表位(例如，表1中列出的表位中的至少2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29、30、31、32、33、34、35、36、37或38个)。在一些实施方案中，运载体或重组腺病毒编码来自EBV的T细胞表位(例如，LMP2a表位、EBNA3A表位、EBNA3B表位、EBNA1表位、BZLF1表位、和/或BMLF1表位)。在一些实施方案中，运载体或重组腺病毒编码来自CMV的T细胞表位(例如，pp50表位、pp65表位、IE-1表位、和/或pp150表位)。在一些实施方案中，运载体或重组腺病毒编码来自BKV的T细胞表位(例如，大T抗原表位和/或VP1表位)。在一些实施方案中，运载体或重组腺病毒编码来自ADV的T细胞表位(例如，六邻体蛋白表位、DNA聚合酶表位、和/或DNA结合蛋白表位)。在一些实施方案中，T细胞表位包括来自至少三种或四种不同病毒(例如，EB病毒(EBV)、巨细胞病毒(CMV)、多瘤BK病毒(BKV)和腺病毒(ADV))的表位。在一些实施方案中，运载体或重组腺病毒可以编码来自上述病毒的任何组合和/或来自其他病毒的T细胞表位。在一些实施方案中，运载体或重组腺病毒编码至少2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29、30、31、32、33、34、35、36、37或38个T细胞表位(例如，表1中列出的表位中的至少2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29、30、31、32、33、34、35、36、37或38个)。在一些实施方案中，由本文所描述的运载体或重组腺病毒编码的T细胞表位被编码为多表位蛋白(即，包括多个T细胞表位的单链氨基酸残基，所述多个T细胞表位在自然界中不直接连接)。在一些方面，多表位蛋白包括与SEQIDNO:1具有至少80％、81％、82％、83％、84％、85％、86％、87％、88％、89％、90％、91％、92％、93％、94％、95％、96％、97％、98％、99％或100％序列一致性的氨基酸序列。在一些实施方案中，编码T细胞表位(例如，多表位蛋白中的T细胞表位)的序列是密码子优化的。在一些方面，本文提供生成本文公开的重组腺病毒的方法。在一些实施方案中，方法包含将本文所描述的核酸运载体转染到细胞系(例如，HEK293细胞)中，并且然后在条件下培养经转染的细胞系，使得细胞系产生重组腺病毒。在一些实施方案中，方法还包含分离重组腺病毒。在一些方面，本文提供包括本文公开的运载体、重组腺病毒、或多表位的治疗组合物(疫苗组合物或其他药物组合物)和使用治疗组合物治疗或预防病毒感染或癌症的方法。在一些方面，本文提供APC，所述APC呈递两个或更多个T细胞表位(例如，表1中列出的T细胞表位中的两个或更多个)，其中两个或更多个T细胞表位包括来自至少两种不同病毒(例如，EB病毒(EBV)、巨细胞病毒(CMV)、多瘤BK病毒(BKV)和/或腺病毒(ADV))的T细胞表位。在一些实施方案中，表位是HLAI类-限制性T细胞表位。在一些实施方案中，APC呈递来自EBV的T细胞表位(例如，LMP2a表位、EBNA3A表位、EBNA3B表位、EBNA1表位、BZLF1表位、和/或BMLF1表位)。在一些实施方案中，APC呈递来自CMV的T细胞表位(例如，pp50表位、pp65表位、IE-1表位、和/或pp150表位)。在一些实施方案中，APC呈递来自BKV的T细胞表位(例如，大T抗原表位和/或VP1表位)。在一些实施方案中，APC呈递来自ADV的T细胞表位(例如，六邻体蛋白表位、DNA聚合酶表位、和/或DNA结合蛋白表位)。在一些实施方案中，T细胞表位包括来自至少三种或四种不同病毒(例如，EB病毒(EBV)、巨细胞病毒(CMV)、多瘤BK病毒(BKV)和腺病毒(ADV))的表位。在一些实施方案中，APC呈递来自上述病毒的任何组合和/或来自其他病毒的T细胞表位。在一些实施方案中，APC呈递至少2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29、30、31、32、33、34、35、36、37或38个T细胞表位(例如，表1中列出的表位中的至少2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29、30、31、32、33、34、35、36、37或38个)。在一些方面，本文提供CTL的群体，所述CTL的群体共同包括识别两个或更多个T细胞表位(例如，表1中列出的T细胞表位中的两个或更多个)的T细胞受体，其中两个或更多个T细胞表位包括来自至少两种不同病毒(例如，EB病毒(EBV)、巨细胞病毒(CMV)、多瘤BK病毒(BKV)和/或腺病毒(ADV))的T本文档来自技高网...

【技术保护点】
1.一种编码表1中列出的T细胞表位中的两个或更多个的核酸运载体，其中所述两个或更多个T细胞表位包括来自至少两种不同病毒的T细胞表位。

【技术特征摘要】
【国外来华专利技术】2016.07.18 US 62/363,6691.一种编码表1中列出的T细胞表位中的两个或更多个的核酸运载体，其中所述两个或更多个T细胞表位包括来自至少两种不同病毒的T细胞表位。2.如权利要求1所述的运载体，其中所述运载体是腺病毒表达运载体。3.如权利要求1或2所述的运载体，其中所述两个或更多个T细胞表位是HLAI类限制性T细胞表位。4.如权利要求1至3中任一项所述的运载体，其中所述运载体编码表1中列出的T细胞表位中的至少三个。5.如权利要求1至3中任一项所述的运载体，其中所述运载体编码表1中列出的T细胞表位中的至少五个。6.如权利要求1至3中任一项所述的运载体，其中所述运载体编码表1中列出的T细胞表位中的至少十个。7.如权利要求1至3中任一项所述的运载体，其中所述运载体编码表1中列出的T细胞表位中的至少十五个。8.如权利要求1至3中任一项所述的运载体，其中所述运载体编码表1中列出的T细胞表位中的至少二十个。9.如权利要求1至3中任一项所述的运载体，其中所述运载体编码表1中列出的T细胞表位中的至少二十五个。10.如权利要求1至3中任一项所述的运载体，其中所述运载体编码表1中列出的T细胞表位中的至少三十个。11.如权利要求1至10中任一项所述的运载体，其中所述T细胞表位包括来自至少三种不同病毒的T细胞表位。12.如权利要求1至10中任一项所述的运载体，其中所述T细胞表位包括来自至少四种不同病毒的T细胞表位。13.如权利要求1至12中任一项所述的运载体，其中所述运载体编码来自EB病毒(EBV)的T细胞表位。14.如权利要求13所述的运载体，其中所述来自EBV的T细胞表位是LMP2a表位。15.如权利要求13所述的运载体，其中所述来自EBV的T细胞表位是EBNA3A表位。16.如权利要求13所述的运载体，其中所述来自EBV的T细胞表位是EBNA3B表位。17.如权利要求13所述的运载体，其中所述来自EBV的T细胞表位是BMLF1表位。18.如权利要求13所述的运载体，其中所述来自EBV的T细胞表位是EBNA1表位。19.如权利要求13所述的运载体，其中所述来自EBV的T细胞表位是BZLF1表位。20.如权利要求1至19中任一项所述的运载体，其中所述运载体编码来自巨细胞病毒(CMV)的T细胞表位。21.如权利要求20所述的运载体，其中所述来自CMV的T细胞表位是pp50表位。22.如权利要求20所述的运载体，其中所述来自CMV的T细胞表位是pp65表位。23.如权利要求20所述的运载体，其中所述来自CMV的T细胞表位是IE-1表位。24.如权利要求20所述的运载体，其中所述来自CMV的T细胞表位是pp150表位。25.如权利要求1至24中任一项所述的运载体，其中所述运载体编码来自多瘤BK病毒(BKV)的T细胞表位。26.如权利要求25所述的运载体，其中所述来自BKV的T细胞表位是大T抗原表位。27.如权利要求25所述的运载体，其中所述来自BKV的T细胞表位是VP1表位。28.如权利要求1至27中任一项所述的运载体，其中所述运载体编码来自腺病毒(ADV)的T细胞表位。29.如权利要求28所述的运载体，其中所述来自ADV的T细胞表位是六邻体蛋白表位。30.如权利要求28所述的运载体，其中所述来自ADV的T细胞表位是DNA聚合酶表位。31.如权利要求28所述的运载体，其中所述来自ADV的T细胞表位是DNA结合蛋白表位。32.如权利要求1至31中任一项所述的运载体，其中所述运载体编码来自EBV和CMV的T细胞表位。33.如权利要求1至31中任一项所述的运载体，其中所述运载体编码来自EBV和BKV的T细胞表位。34.如权利要求1至31中任一项所述的运载体，其中所述运载体编码来自EBV和ADV的T细胞表位。35.如权利要求1至31中任一项所述的运载体，其中所述运载体编码来自CMV和ADV的T细胞表位。36.如权利要求1至31中任一项所述的运载体，其中所述运载体编码来自CMV和BKV的T细胞表位。37.如权利要求1至31中任一项所述的运载体，其中所述运载体编码来自BKV和ADV的T细胞表位。38.如权利要求1至31中任一项所述的运载体，其中所述运载体编码来自EBV、CMV和BKV的T细胞表位。39.如权利要求1至31中任一项所述的运载体，其中所述运载体编码来自EBV、CMV和ADV的T细胞表位。40.如权利要求1至31中任一项所述的运载体，其中所述运载体编码来自CMV、BKV和ADV的T细胞表位。41.如权利要求1至31中任一项所述的运载体，其中所述运载体编码来自ADV、BKV和EBV的T细胞表位。42.如权利要求1至31中任一项所述的运载体，其中所述运载体编码来自EBV、CMV、BKV和ADV的T细胞表位。43.如权利要求42所述的运载体，其中所述运载体编码表1中列出的38个T细胞表位。44.如权利要求1至43中任一项所述的运载体，其中由所述运载体编码的所述T细胞表位被编码为多表位蛋白。45.如权利要求44所述的运载体，其中所述多表位蛋白包括与SEQIDNO:1至少80％一致的序列。46.如权利要求44所述的运载体，其中所述多表位蛋白包括与SEQIDNO:1至少90％一致的序列。47.如权利要求44所述的运载体，其中所述多表位蛋白包括SEQIDNO:1的序列。48.如权利要求1至47中任一项所述的运载体，其中编码所述T细胞表位的序列是密码子优化的。49.一种生成重组腺病毒的方法，所述方法包括：(a)将权利要求1至48中任一项所述的核酸运载体转染到细胞系中；(b)在条件下培养经转染的细胞系，使得所述细胞系产生重组腺病毒；以及(c)分离所述重组腺病毒。50.如权利要求49所述的方法，其中所述细胞系是HEK293细胞系。51.根据权利要求49或50所述的方法生成的重组腺病毒。52.一种包括权利要求1至48中任一项所述的运载体的细胞。53.如权利要求52所述的细胞，其中所述细胞是HEK293细胞。54.一种包括权利要求1至48中任一项所述的运载体的疫苗组合物。55.一种在受试者中治疗或预防病毒感染的方法，所述方法包括向所述受试者施用权利要求54所述的疫苗组合物。56.如权利要求55所述的方法，其中所述病毒感染是EBV感染、CMV感染、BKV感染或ADV感染。57.一种在受试者中治疗或预防癌症的方法，所述方法包括向所述受试者施用权利要求54所述的疫苗组合物。58.一种多表位蛋白，所述多表位蛋白包括与SEQIDNO:1至少80％一致的序列。59.一种多表位蛋白，所述多表位蛋白包括与SEQIDNO:1至少90％一致的序列。60.一种多表位蛋白，所述多表位蛋白包括与SEQIDNO:1一致的序列。61.一种包括权利要求58至60中任一项所述的多表位蛋白的组合物。62.一种重组腺病毒，所述重组腺病毒包括编码表1中列出的T细胞表位中的两个或更多个的核酸，其中所述两个或更多个T细胞表位包括来自至少两种不同病毒的T细胞表位。63.如权利要求62所述的重组腺病毒，其中所述两个或更多个T细胞表位是HLAI类限制性T细胞表位。64.如权利要求62或63所述的重组腺病毒，其中所述核酸编码表1中列出的T细胞表位中的至少三个。65.如权利要求62或63所述的重组腺病毒，其中所述核酸编码表1中列出的T细胞表位中的至少五个。66.如权利要求62或63所述的重组腺病毒，其中所述核酸编码表1中列出的T细胞表位中的至少十个。67.如权利要求62或63所述的重组腺病毒，其中所述核酸编码表1中列出的T细胞表位中的至少十五个。68.如权利要求62或63所述的重组腺病毒，其中所述核酸编码表1中列出的T细胞表位中的至少二十个。69.如权利要求62或63所述的重组腺病毒，其中所述核酸编码表1中列出的T细胞表位中的至少二十五个。70.如权利要求62或63所述的重组腺病毒，其中所述核酸编码表1中列出的T细胞表位中的至少三十个。71.如权利要求62至70中任一项所述的重组腺病毒，其中...

【专利技术属性】
技术研发人员：R·肯纳，V·达萨里，
申请(专利权)人：昆士兰医学研究所理事会，
类型：发明
国别省市：澳大利亚,AU