缢蛏抗副溶血弧菌相关SNPs分子标记及其扩增引物和应用制造技术

本发明专利技术公开了缢蛏抗副溶血弧菌相关的SNPs分子标记及其扩增引物和应用，特点是运用高通量测序技术和生物信息学分析手段筛选到24个位于ABC转运蛋白家族基因上的SNP位点对缢蛏抗副溶血弧菌感染具有显著相关性，通过引物设计和高分辨率熔解曲线分型技术可对其中的6个SNP位点进行分型，6个SNP标记优势等位基因，其SEQ ID NO:1‑SEQ ID NO:6所示，并公开了其扩增引物以及该分子标记在缢蛏抗副溶血弧菌亲本选育中的应用，优点是快速、准确、有效地利用SNP标记检测缢蛏抗病个体，为缢蛏抗病品系标记辅助选育工作提供了可靠的分子标记。

Molecular Markers of Anti-Vibrio parahaemolyticus Related SNPs and Their Amplified Primers and Applications in Vermicularis constricta

【技术实现步骤摘要】
缢蛏抗副溶血弧菌相关SNPs分子标记及其扩增引物和应用
本专利技术属于分子生物学DNA标记技术，具体涉及缢蛏抗副溶血弧菌相关基因腺苷三磷酸结合盒转运蛋白的SNPs分子标记及其扩增引物和应用。
技术介绍
缢蛏（Sinonovaculaconstricta）是一种广温广盐的滩涂贝类，是我国四大养殖贝类之一，在我国沿海自北向南均有分布，然而数代的繁育养殖导致近交衰退，缢蛏种质逐年下降，在养殖过程中面临着生长速度变缓、抗逆性不强、病害增多、产品质量下降等诸多问题，且呈现愈演愈烈的趋势。近年来，随着持续的集约化养殖，蛏病的发生日益频繁，大批死亡现象时有发生，对缢蛏的养殖产业造成了一定的破坏性影响。因此，进行缢蛏遗传改良，培育具有优质、高产、抗病等优良性状的新品种，已成为缢蛏养殖业亟待解决的问题。腺苷三磷酸结合盒转运蛋白（ATP-bindingcassettetransporter，ABC转运蛋白）是一类广泛分布在原核和真核生物中并具有多种功能的膜蛋白超级家族，其主要功能是利用ATP水解产生的能量进行逆浓度梯度跨膜转运过程。ABC转运蛋白的底物类型涵盖有机、无机小分子和部分有机大分子化合物，在细本文档来自技高网...

【技术保护点】
1.一种缢蛏抗副溶血弧菌相关的SNPs分子标记，其特征在于所述的分子标记位于ABC转运蛋白基因家族中，所述的分子标记分别为：第一个SNP标记命名Sc3488，其位于unigene0003488的第583个碱基处，突变类型为：G/A，其核苷酸序列如序列表SEQ ID NO:1所示，第二个SNP标记命名Sc15480，其位于unigene0015480的第513个碱基处，突变类型为：A/G；其核苷酸序列如序列表SEQ ID NO:2所示，第三个SNP标记命名Sc21269，其位于unigene0021269的第504个碱基处，突变类型为：G/T；其核苷酸序列如序列表SEQ ID NO:3所示，第四...

【技术特征摘要】
1.一种缢蛏抗副溶血弧菌相关的SNPs分子标记，其特征在于所述的分子标记位于ABC转运蛋白基因家族中，所述的分子标记分别为：第一个SNP标记命名Sc3488，其位于unigene0003488的第583个碱基处，突变类型为：G/A，其核苷酸序列如序列表SEQIDNO:1所示，第二个SNP标记命名Sc15480，其位于unigene0015480的第513个碱基处，突变类型为：A/G；其核苷酸序列如序列表SEQIDNO:2所示，第三个SNP标记命名Sc21269，其位于unigene0021269的第504个碱基处，突变类型为：G/T；其核苷酸序列如序列表SEQIDNO:3所示，第四个SNP标记命名Sc30664，其位于unigene0030664的第609个碱基处，突变类型为：C/T；其核苷酸序列如序列表SEQIDNO:4所示，第五个SNP标记命名Sc39666，其位于unigene0039666的第1396个碱基处，突变类型为：G/A；其核苷酸序列如序列表SEQIDNO:5所示，第六个SNP标记命名Sc60136，其位于unigene0060136的第88个碱基处583，突变类型为：A/G；其核苷酸序列如序列表SEQIDNO:6所示。2.权利要求1所述的缢蛏抗副溶血弧菌相关的SNPs分子标记的扩增引物，其特征在于6个SNP标记的扩增引物分别为：Sc3488-F:GCTATGGGGAGAAGCTCAAAGT，Sc3488-R:AGCCACCGATCACCAGACGT；Sc15480-F:TGTATGAATCCTGGAGAAAAGC，Sc15480-R:GTCCGAGTCCCTACGGCTTG；Sc21269-F:CTCTGTCACAGCCTTCCATTAC，Sc21269-R:AGAGTTTGAGCACAGAAAGATTG；Sc30664-F:CTTTGTGCGCCATTCAGTG，Sc30664-R:CATCATCATCGCCATCGTGT；Sc39666-F:TGGAAACCGAAGGAGCTAC，Sc39666-R:TGAACAAACCCAATGAGC；Sc60136-F:GGTCGCACAGCCTGAATGAT，Sc60136-R:TATGTTTGCGGG...

【专利技术属性】
技术研发人员：李成华，赵雪琳，伏建平，邵铱娜，
申请(专利权)人：宁波大学，
类型：发明
国别省市：浙江,33