一种识别虾夷扇贝中部着丝粒染色体的探针及其制备方法技术

本发明专利技术提供一种虾夷扇贝中部着丝粒染色体的识别方法，通过结合虾夷扇贝基因组序列信息、SNP连锁图谱信息以及fosmid单克隆解码信息，选取了分布于虾夷扇贝SNP连锁图谱上的三个标记对fosmid文库进行筛选，利用筛选到含有SNP位点的克隆制备带有荧光标记的探针，然后利用这些探针进行荧光原位杂交和共杂交，根据三个含有SNP标记的特异性克隆的荧光信号在虾夷扇贝染色体上的分布，实现了虾夷扇贝三对中部着丝粒染色体的特异性识别。本发明专利技术提供的三个标记实现了对三对中部着丝粒染色体的识别，对虾夷扇贝染色体的区分鉴定、细胞遗传学图谱的构建以及不同物种来源的染色体之间的进化分析都具有重要的意义。

A probe for identifying centromere chromosomes of scallop yessoensis and its preparation method

【技术实现步骤摘要】
一种识别虾夷扇贝中部着丝粒染色体的探针及其制备方法
本专利技术属于贝类染色体研究
，具体涉及一种识别虾夷扇贝中部着丝粒染色体的探针及其制备方法。
技术介绍
虾夷扇贝(Jay，1857)是一种冷水双壳贝类，也是一种重要的水产养殖物种，具有很大的科研价值和经济价值。虾夷扇贝共有19对染色体，包括中部着丝粒染色体、亚中部着丝粒染色、亚端部着丝粒染色体、端部着丝粒染色体四种染色体类型。核型分析结果显示，虾夷扇贝同染色体的大小呈连续分布，形态较为相近，想要单纯地凭借核型分析就实现染色体的识别是不现实的；而染色体的识别对于推动扇贝细胞遗传研究与遗传育种工作具有重要的意义。近年来借助于染色体显带技术，动植物染色体的结构与变化得到了更为精细的分析，这已成为鉴定染色体组或个别染色体、探讨物种进化及分析物种分类等问题的有效手段之一。然而已有研究报道表明该技术在贝类染色体研究中缺乏稳定性。荧光原位杂交技术(Fluorescenceinsituhybridization，FISH)是一种以分子杂交为手段，以荧光显微镜为工具来直观显示DNA序列位置的技术手段。通过应用该技术，染色体和亚染色体区域可以被染本文档来自技高网...

【技术保护点】
1.一种SNP标记，其特征在于，所述的SNP标记包含有：识别一对中部着丝粒染色体的SNP标记，其核苷酸序列为SEQ ID NO:1；识别第二对中部着丝粒染色体的SNP标记，其核苷酸序列为SEQ ID NO:2；识别第三对中部着丝粒染色体的SNP标记，其核苷酸序列为SEQ ID NO:3。

【技术特征摘要】
1.一种SNP标记，其特征在于，所述的SNP标记包含有：识别一对中部着丝粒染色体的SNP标记，其核苷酸序列为SEQIDNO:1；识别第二对中部着丝粒染色体的SNP标记，其核苷酸序列为SEQIDNO:2；识别第三对中部着丝粒染色体的SNP标记，其核苷酸序列为SEQIDNO:3。2.权利要求1所述的SNP标记在制备检测虾夷扇贝中部着丝粒染色体探针中的应用。3.一种检测虾夷扇贝中部着丝粒染色体探针，其特征在于，所述的探针是使用权利要求1所述的SNP标记来筛选虾夷扇贝fosmid单克隆后制备的。4.权利要求3所述的探针的制备方法，其特征在于，所述的方法包括如下的步骤：1)Fosmid单克隆的筛选：将权利要求1所述的SNP标记序列与虾夷扇贝fosmid单克隆解码信息进行了交叉比对，定位获得含有SNP同源序列的fosmid单克隆；2)Fosmid克隆质粒提取：使用酚氯仿/碱裂解的方法提取含有SNP同源序列的fosmid单克隆质粒DNA；3)制备探...

【专利技术属性】
技术研发人员：黄晓婷，杨祖晶，包振民，陆维，胡丽萍，李晅，廖欢，
申请(专利权)人：中国海洋大学，
类型：发明
国别省市：山东,37