一种双组分聚合物功能化材料富集提取循环肿瘤DNA的方法技术

技术编号:21448589 阅读:40 留言:0更新日期:2019-06-26 03:13
本发明专利技术提供一种双组分聚合物功能化材料富集提取循环肿瘤DNA的方法,属生物技术领域。本发明专利技术采用分散固相萃取模式,具体步骤如下:1)先采用上样液平衡DNA富集材料,将该DNA富集材料与生物样品以质量比100‑1000:1混合,孵化0.5‑720min,过滤或者离心分离,弃上混合层清液,收集沉淀;2)采用1‑6清洗液与沉淀混合,孵化0.5分钟‑60分钟,过滤或者离心分离,弃上层清液,收集沉淀;3)采用pH 8‑13洗脱液与沉淀混合,孵化0.5分钟‑60分钟,过滤或者离心分离,收集上清液,得ctDNA,上述整个过程在10‑60℃进行,所述DNA富集材料为双组分聚合物。本发明专利技术的方法在提取循环肿瘤DNA方面表现出了高选择性和高通量等特点,可以实现循环肿瘤DNA的有效分离和富集。

【技术实现步骤摘要】
一种双组分聚合物功能化材料富集提取循环肿瘤DNA的方法
本专利技术涉及生物
,尤其涉及一种双组分聚合物功能化材料富集提取循环肿瘤DNA的方法。
技术介绍
循环肿瘤DNA,即ctDNA(circulatingtumorDNA),是指肿瘤细胞经过细胞凋亡或者坏死产生的DNA片段释放进入循环系统。ctDNA存在于血液、滑膜液和脑脊液等体液中。由于ctDNA半衰期为1小时左右,能准确反映肿瘤当前情况,所以ctDNA可以作为组织活检的非侵入性替代方案。另外,ctDNA在癌症早期诊断、预后和测定药物治疗反应中发挥作用。目前主流的ctDNA突变检测技术包括基于PCR扩增技术和基于DNA序列检测技术两类。但是不管哪种测序技术,都需要都对DNA进行富集和提取,以降低对扩增或者后续测序的干扰。ctDNA的主要提取方法主要是基于硅球、磁性小球的固相萃取方法和基于苯酚-氯仿的液液提取方法。主要问题是提取效率和重现性。
技术实现思路
针对上述问题,本专利技术提供一种双组分聚合物功能化材料富集循环肿瘤DNA的方法。一种双组分聚合物功能化材料富集提取循环肿瘤DNA的方法,采用分散固相萃取模式,具体步骤如下:1)本文档来自技高网...

【技术保护点】
1.一种双组分聚合物功能化材料富集提取循环肿瘤DNA的方法,其特征在于采用分散固相萃取模式,具体步骤如下:1)先采用上样液平衡DNA富集材料,将该DNA富集材料与生物样品以质量比100‑1000:1混合,孵化0.5‑720min,过滤或者离心分离,弃上混合层清液,收集沉淀;2)采用1‑6清洗液与沉淀混合,孵化0.5分钟‑60分钟,过滤或者离心分离,弃上层清液,收集沉淀;3)采用pH 8‑13洗脱液与沉淀混合,孵化0.5分钟‑60分钟,过滤或者离心分离,收集上清液,得ctDNA,上述整个过程在10‑60℃进行,所述DNA富集材料为双组分聚合物功能化材料。

【技术特征摘要】
1.一种双组分聚合物功能化材料富集提取循环肿瘤DNA的方法,其特征在于采用分散固相萃取模式,具体步骤如下:1)先采用上样液平衡DNA富集材料,将该DNA富集材料与生物样品以质量比100-1000:1混合,孵化0.5-720min,过滤或者离心分离,弃上混合层清液,收集沉淀;2)采用1-6清洗液与沉淀混合,孵化0.5分钟-60分钟,过滤或者离心分离,弃上层清液,收集沉淀;3)采用pH8-13洗脱液与沉淀混合,孵化0.5分钟-60分钟,过滤或者离心分离,收集上清液,得ctDNA,上述整个过程在10-60℃进行,所述DNA富集材料为双组分聚合物功能化材料。2.根据权利要求1所述的一种双组分聚合物功能化材料富集提取循环肿瘤DNA的方法,其特征在于所述双组分聚合物功能化材料,其结构如下:其中R为羧基、硝基、甲基、甲酸乙酯基或氢;X=0.01-0.5;所述双组分聚合物功能化材料的基底的材料为Si、Cu、Ag、Au、Pt、CuO、Fe3O4、多孔SiO2、多孔Al2O3、多孔TiO2或多孔ZrO2中的任意一种或者两种以上任意比例的混合。3.根据权利要求1所述的一种双组分聚合物功能化材料富集提取循环肿瘤DNA的方法,其特征在于所述双组分聚合物功能化材料的制备方法为:利用原子转移自由基聚合反应机制,将双组分功能共聚物接枝到无机半导体、金属或金属氧化物表面上,使其获得智能响应性聚合物功能表面;所述的无机半导体为Si或SiO2中的任意一种或者两种按任意比例的混合;所述的金属为Au、Ag或Pt中的任意一种或者两种以上任意比例的混合;所述的金属氧化物为CuO、Al2O3、TiO2、ZrO2或Fe3O4中的任意一种或者两种以上任意比例的混合。4.根据权利要求3所述的一种双组分聚合物功能化材料富集提取循环肿瘤DNA的方法,其特征在于,所述双组分聚合物功能化材料的制备方法具体为:在25mL的烧瓶中依次加入0.4mmol异丙基丙烯酰胺,0.1mmol的硫脲功能单体,二者摩尔比为4:1,...

【专利技术属性】
技术研发人员:梁鑫淼李秀玲张小菲
申请(专利权)人:中国科学院大连化学物理研究所
类型:发明
国别省市:辽宁,21

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