The invention discloses a method for identifying Holly Germplasm by using SSR molecular markers of transcriptome sequencing, which belongs to the field of biotechnology. The method of the invention includes: PCR amplification with SSR molecular markers, wherein the SSR molecular markers are one or more of the following 10 SSR molecular marker primers: IL 1, IL 2, IL 3, IL 4, IL 5, IL 6, IL 7, IL 8, IL 9, IL 10, respectively. This method has the advantages of high detection rate, better resolution, stability, reliability, simplicity and high efficiency.
【技术实现步骤摘要】
一种利用转录组测序的SSR分子标记鉴定冬青种质的方法
本专利技术属于生物技术学领域，具体涉及一组基于冬青转录组测序序列而开发的多对SSR标记引物、PCR扩增及其专用于从DNA水平对冬青属植物种质的快速鉴定及亲缘关系分析的应用。
技术介绍
冬青属植物多为常绿阔叶树种，具有光泽且浓密革质叶片，树冠优美，花多且密，果色鲜艳，具有很高园林观赏价值。此外，冬青属植物主要观赏期在秋冬季节，能够极大程度地弥补冬季园林景观单调萧条的缺陷。中国是冬青属植物资源大国，约200余种，其具有重要的经济价值以及优异的观赏价值，具有巨大的潜在开发应用前景。冬青属植物是多年生植物，生命周期长，且有部分种质性状相似，仅从当代的表型较难区分种质，故开展分子生物学分子标记辅助鉴定种质资源与杂交亲本选择，促进冬青园艺品种的选育，以加快冬青属资源的开发利用，变得越来越重要。目前，冬青属植物遗传背景并不清晰，这给冬青属植物种质鉴定、杂交育种、新种质挖掘等带来了很大困难，同时由于冬青基因组及转录组数据的缺乏，造成冬青属植物生长发育，抗逆性研究、分子标记开发和遗传图谱构建等相对滞后，冬青属植物遗传多样性等方面...
【技术保护点】
1.一种利用转录组测序的SSR分子标记鉴定冬青种质的方法，其特征在于该方法包括：以SSR分子标记进行PCR扩增；其中所述SSR分子标记为以下10个SSR分子标记引物中的一个或多个，其分别为：IL‑1，IL‑2，IL‑3，IL‑3，IL‑4，IL‑5，IL‑6，IL‑7，IL‑8，IL‑9，IL‑10。
【技术特征摘要】
1.一种利用转录组测序的SSR分子标记鉴定冬青种质的方法，其特征在于该方法包括：以SSR分子标记进行PCR扩增；其中所述SSR分子标记为以下10个SSR分子标记引物中的一个或多个，其分别为：IL-1，IL-2，IL-3，IL-3，IL-4，IL-5，IL-6，IL-7，IL-8，IL-9，IL-10。2.根据权利要求1所述的方法，其特征在于该方法包括如下步骤：1)提取待测冬青样品的DNA；2)以步骤1)提取的DNA为模板，根据SSR分子标记进行PCR扩增；3)采用聚丙烯胺凝胶电泳系统检测PCR产物。3.根据权利要求1所述的方法，其特征在于所述PCR采用10μl反应体系：包括10-50ng模板DNA1-2μl，正、反向引物各0.25μmol/L，Mg2+2.0mmol/L，TaqBuffer1X，dNTPMix200μmol/L及适量ddH2O。4.根据权利要求1或2所述的方法，其特征在于PCR反应程序为：95℃预变性5...
【专利技术属性】
技术研发人员：陈红，李云龙，王传永，陆小清，李乃伟，周艳威，张凡，蔡小龙，
申请(专利权)人：江苏省中国科学院植物研究所，
类型：发明
国别省市：江苏,32
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