水稻抗稻瘟病基因Pi2的共显性分子标记及其检测方法与应用技术

本发明专利技术涉及水稻抗稻瘟病基因Pi2的共显性分子标记及其检测方法与应用。水稻抗稻瘟病基因Pi2的共显性分子标记包括位于水稻第6号染色体第10389729～10389747bp处，多态性为5’‑CAGGAATCTCAGATGG‑3’/5’‑TGTTATTCTCAGGTATTAT‑3’和位于水稻第6号染色体第10452027bp处，多态性为A/G的分子标记。本发明专利技术提供的分子标记能够将Pi2与其它复等位基因进行有效鉴别，具有高度的特异性和准确性；本发明专利技术提供的Pi2基因型的检测方法通过扩增产物的电泳条带判定待测水稻材料的Pi2基因型，无需酶切，成本低廉，有利于缩短水稻的育种周期，降低育种成本。

Co-dominant Molecular Markers of Rice Blast Resistance Gene Pi2 and Their Detection and Application

The present invention relates to a co-dominant molecular marker of rice blast resistance gene Pi2 and its detection method and application. The co-dominant molecular markers of rice blast resistance gene Pi2 were located on chromosome 10 389729-10389747 BP of rice chromosome 6, with polymorphisms of 5', CAGGAATCTCAGATGG 3'/5', TGTTATTCTCAGTATTAT 3', and 1047;bp of rice chromosome 6. The polymorphisms were A/G molecular markers. The molecular marker provided by the invention can effectively identify Pi2 and other multiple alleles with high specificity and accuracy; the detection method of the Pi2 genotype provided by the invention determines the Pi2 genotype of the rice material to be tested by electrophoretic strips of the amplified products, without enzymatic digestion, and has low cost, which is beneficial to shortening the breeding cycle of rice and reducing the breeding cost.

【技术实现步骤摘要】
水稻抗稻瘟病基因Pi2的共显性分子标记及其检测方法与应用
本专利技术涉及分子遗传育种领域，具体涉及水稻抗稻瘟病基因Pi2的共显性分子标记及其检测方法与应用。
技术介绍
水稻作为世界上最重要的粮食作物之一，近一半以上的人口以稻米作为主食。稻瘟病是水稻生产中最为严重的病害之一，给水稻安全生产造成了重大威胁。长期的生产实践表明，培育水稻抗性品种或种质是防治稻瘟病的有效措施之一。然而，由于稻瘟病生理小种致病性变异频繁，导致单一抗性品种的抗性会在种植3～5年时间后逐渐丧失，因此，挖掘和利用光谱抗性基因是获得持久抗性品种的重要途径。近几十年来，已定位或克隆了诸多抗稻瘟病基因，同时分子标记技术的发展与应用极大促进了分子标记辅助选择及聚合育种技术在水稻抗稻瘟病品种选育中的应用。在已经克隆的抗稻瘟病基因中，诸多基因成簇分布或为复等位基因，基因之间序列高度同源，导致一些连锁标记难以甄别各种水稻材料的功能抗病基因。因此，基于基因序列或功能位点开发特异性的分子标记不仅使得检测的可靠性更高，还可有效加快育种进程。目前，在抗稻瘟病Pi2/9(LOC_Os06g17900)位点已克隆了多个稻瘟病抗性基因，如Pi2本文档来自技高网...

【技术保护点】
1.水稻抗稻瘟病基因Pi2的共显性分子标记，其特征在于，包括如下分子标记的一种或两种：(1)位于水稻第6号染色体第10389729～10389747bp处，多态性为5’‑CAGGAATCTCAGATGG‑3’/5’‑TGTTATTCTCAGGTATTAT‑3’；(2)位于水稻第6号染色体第10452027bp处，多态性为A/G。

【技术特征摘要】
1.水稻抗稻瘟病基因Pi2的共显性分子标记，其特征在于，包括如下分子标记的一种或两种：(1)位于水稻第6号染色体第10389729～10389747bp处，多态性为5’-CAGGAATCTCAGATGG-3’/5’-TGTTATTCTCAGGTATTAT-3’；(2)位于水稻第6号染色体第10452027bp处，多态性为A/G。2.用于检测权利要求1所述分子标记的引物。3.根据权利要求2所述的引物，其特征在于，所述引物包括如下(1)、(2)的一种或两种：(1)正向引物1：Pi2-RF:5’-GATGCTGCAGGTATCTCAGTTG-3’；反向引物1：Pi2-RR:5’-GGTCGTGATACCTTCGGTCA-3’；(2)正向引物2：Pi2-SF:5’-GCATGTTATGTTTGGAAGTAGCC-3’；反向引物2：Pi2-SR:5’-CATGTCTCGATAATTAGGAATCGC-3’。4.一种水稻抗稻瘟病Pi2基因检测试剂盒，其特征在于，包括权利要求2或3所述的引物。5.根据权利要求4所述的试剂盒，其特征在于，所述试剂盒还包括Mg2+、DNA聚合酶、PCR反应缓冲液和dNTPs。6.权利要求1所述的分子标记或权利...

【专利技术属性】
技术研发人员：杨远柱，邓钊，王凯，赵炳然，刘兰兰，石媛媛，秦鹏，符辰建，
申请(专利权)人：袁隆平农业高科技股份有限公司，湖南隆平高科种业科学研究院有限公司，湖南亚华种业科学研究院，湖南杂交水稻研究中心，
类型：发明
国别省市：湖南,43